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求教SNP格式chr:pos与rsID转换方法

相关实验:SNP分型分析实验

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六道闲人

如题,最近在做TwoSampleMR,从UKB下载都是chr:pos这种格式,但是我的暴露数据是rsIDs这种格式,格式不同后面就没法做clumped,求大神赐教怎么转换格式!谢谢!

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2 个回答

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土井挞克树

有帮助

先明确原始数据的dbsnp版本,然后标准化,之后匹配完就可以转化了。

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Dr_劉医生

有帮助

具体看你SNP数量,少的话,直接用NCBIdsSNP直接搜rsID,批量转换的的话可以用SNPnexus这个工具试试,得用教育邮箱注册

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