SNP分型分析实验

DNA 实验

最新修订时间：2022-02-10

简介

SNP 即指同一物种成员或同一个体配对染色体由基因组中单个核苷酸——A、T、C 或 G 的变化导致的 DNA 序列差异。SNP 分析是遗传分析的核心部分。目前，用于 SNP 分型分析实验的方法主要有 3 种：限制性片段长度多态性分析检测、基因芯片 SNP 分型分析和 5』-核酸酶等位基因鉴别。

原理

SNP 分型分析实验的基本原理是指 2 条来自不同个体的，DNA 片段测序 ATGGTC 和 ATGCTC 中就包含了单个核昔酸 (G 和 C) 的变化，涉及 2 个等位基因。绝大多数常见的 SNP 中仅存在 2 个等位基因。SNP 的选择取决于某一 SNP 在群体中最低的等位基因频率。人类的不同群体中存在变异， SNP 等位基因在某些地理或种族人群中发生的频率有很大的差异，可以通过相关的 DNA 标记分析确定相关的 SNP 分型。

来源：丁香通实验团队

操作方法

限制性片段长度多态性分析 SNP 分型

限制性片段长度多态性检测使用限制性内切核酸酶消化的方法鉴定感兴趣区域 DNA 序列多态性。限制性片段长度多态性检测依赖于 DNA 序列的改变发生在酶切位点处，常与 Southern 印迹技术联用。

基于基因芯片分析 SNP 分型

基因芯片技术的产生源于高通量 SNP 检测技术的发展，该技术大大提升了检测细胞内 SNP 标记的效率，其检测技术原理基于 DNA 探针杂交技术，利用高分辨率的影像分析技术，有效提升了高通量的数据处理分析能力。原理基因芯片技术涉及等位基因特异性的核酸杂交， DNA 探针固定在不可渗透的固体表面，极大程度地减少了反应溶液体系和杂交所需时间，一张芯片可同时检测数以万计的 SNP 位点，绿色或红色荧光分别

基于 5'- 酸酶等位基因鉴别法分析 SNP 分型

5'- 酸酶等位基因鉴别法或称 TaqMan 法是一种 PCR 为基础的 SNP 基因分型手段。TaqMan 技术依赖 Taq 酶的 5'→ 3' 外切核酸酶活性，在 PCR 延伸过程中降解与互补靶序列杂交结合的双重标记探针，该探针降解的过程中，荧光基团释放并与淬灭基团分离，最终释放出荧光信号，进而检测标记信号。原理基于 5'- 酸酶等位基因鉴别法分析 SNP 分型的基本原理是基于特异性的 Taq