log2FoldChange大于多少合适？

选择在1.5-2这个区间范围内

绝对值大于1.5就可以，相当于可信区间增大。

可以，绝对值越大，两组相差越大。不过有可能丢失部分信息

当expr(A) < expr(B)时，B对A的fold change就大于1，log2 fold change就大于0（见下图），B相对A就是上调；当expr(A) > expr(B)时，B对A的fold change就小于1，log2 fold change就小于0。通常为了防止取log2时产生NA，我们会给表达值加1（或者一个极小的数），也就是log2(B+1) - log2(A+1)。

当基因总的表达值很低时，log2 fold change的可信度就低了，尤其是在接近0的时候。