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1.得到差异基因,然后KEGG/GO富集分析功能聚类,再在感兴趣的某个功能集合里做PPI,找hub基因,hub基因结合临床信息分析
2.得到差异基因,所有基因全部先做PPI蛋白互作,找hub基因,再在hub基因里进行KEGG/GO富集分析,找到感兴趣的hub基因,最后在感兴趣的hub里结合临床信息进一步分析
应该选1还是2,感觉1的路更正确一些?
balalaLy
1就是简单的生信分析,文章不会很高分,2的话工作量会很大
毛利小五郎的徒弟
还是第一种比较好,分析的比较准确。
Dr_劉医生
两个思路都可以,第一个注重差异基因的功能表达,更基础也更能发现机制;第二个强调蛋白分子的表达和相互作用,能和临床表型结合更紧密。具体看方向,纯生信基础,选1;关注临床,选2.
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