差异基因后面先做蛋白分子互作还是富集分析
rrrlkkkk
1.得到差异基因，然后KEGG/GO富集分析功能聚类，再在感兴趣的某个功能集合里做PPI，找hub基因，hub基因结合临床信息分析
2.得到差异基因，所有基因全部先做PPI蛋白互作，找hub基因，再在hub基因里进行KEGG/GO富集分析，找到感兴趣的hub基因，最后在感兴趣的hub里结合临床信息进一步分析
应该选1还是2，感觉1的路更正确一些？
3 个回答
balalaLy
1就是简单的生信分析，文章不会很高分，2的话工作量会很大
土井挞克树
还是第一种比较好，分析的比较准确。
Dr_劉医生
两个思路都可以，第一个注重差异基因的功能表达，更基础也更能发现机制；第二个强调蛋白分子的表达和相互作用，能和临床表型结合更紧密。具体看方向，纯生信基础，选1；关注临床，选2.
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