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【求助】SNP如何确定样本含量

happy_m_lucky 想通过直接测序的方法检测一个基因的SNP,只检测外显子、5'UTR、3'UTR区,共三十多个已知位点,对照组和病例组共394个样本,不知道样本量够不够,查了很多资料也没找到,想请教一下怎样确定样本含量,能麻烦大家帮我解答一下吗?非常感谢!yyyantopbt 可参考一下帖子:如何计算作SNP需要的病例数:http://genetics.dxy.cn/bbs/topic/8096982SNP与病例数:ht ...

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【求助】关于polyA的问题~

qingyu2010 我是分子菜鸟一只。。。查基因序列的时候发现有些基因有两个polyA,这是为啥呢?望各位师兄师姐解惑啊~苍山暮雪 基因序列没polyA吧,A尾巴是在RNA加工中添加的吧qingyu2010 呃。。。我说的是polyA signal。。。苍山暮雪 有些基因有多个polyA位点的,通过不同剪接方式产生不同的蛋白,大鼠降钙素基因神马的就是这样本文由丁香园论坛提供,想了解更多有用的、有意思的前沿资讯以及酷炫的实验方法的你, ...

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【求助】选择性剪切问题

real_madrid_146 有个选择性剪接的问题不是很懂,想请教下大家一个完整的mRNA个外显子,起始密码子在第一个外显子,终止密码子在第十一个外显子。第二个外显子选择性剪切缺失之后,随后的序列发生移码,终止密码子出现在第三个外显子了,那后面4-11个外显子还能翻译不?有没有可能后面的外显子内重新出现个起始密码子,也同样翻译?类似于原核生物的多顺反子那样。因为在genebank上可以查询到相应的序列,里面标注的 ...

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【求助】求助~过表达载体

ono1180 求助各位同道:我想过表达一个基因,想选用一个质粒载体连接此基因再转染入细胞,选用的载体需要有绿色荧光标记,而且能筛选出稳定转染的细胞系,上网查了一下觉得pEGFP系列的好像符合我的要求。请问这个载体怎么样,大家还有什么载体觉得挺好,请指教,感谢了。xiaokangkuaile 我用的是pEGFP-C1表达载体,但我的目的基因对GFP表达有影响,转染效果很差xiaokangkuaile 现在正在做其他的目的 ...

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【求助】factor-related apoptosis inducing ligand和TNF-α

wzmchxz 求助各位战友:factor-related apoptosis inducing ligand指的是什么,它和TNF-α的关系?感谢您的帮助。kern6549 你这个不完整吧,应该是tumor necrosis factor(TNF)-related apoptosis inducing ligand。这个分子简称TRAIL,与相应受体结合后能够诱导细胞凋亡。目前,诱导细胞凋亡的配体主要有TNF、FasL和TRAIL 3种。wzmchxz 感谢 ...

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【求助】请问有没有TLRs基因敲除的小鼠

zaiju512 请问有没有人知道哪能买到所有TLRs敲除的小鼠或大鼠?zaiju512 想法有点天真呵呵hzyyy zaiju512 wrote:想法有点天真呵呵文献上有报道的!C3H/Hej小鼠,去上海斯莱克问一下吧!hzyyy 补充一下,C3H/Hej小鼠是TLR4抑制的小鼠,但所有TLR敲除的没法搞,因为老鼠几乎不会活,所以从这个角度讲,2楼的兄台还是有一定道理的!洄游的鱼 大鼠基因敲除研究才刚刚开始,肯定是没有的。前面几位说 ...

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【求助】DNA复制时连接冈崎片断的酶是聚合酶还是连接酶?

huahualian7 急急急问:DNA复制时连接冈崎片断的酶是聚合酶还是连接酶?谢谢啊!zhujoker 聚合酶yuxiongying DNA聚合酶1填补冈崎片段引物切除后的空隙,然后连接酶连接两个相邻的冈崎片段本文由丁香园论坛提供,想了解更多有用的、有意思的前沿资讯以及酷炫的实验方法的你,都可以成为师兄的好伙伴师兄微信号:shixiongcoming

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【求助】关于放线菌素D

zhanghai123 大家好!我最近在做一个受体对一种靶蛋白的调节作用。通过WB分析表明这个受体被激活后能够上调靶蛋白的水平。Realtime PCR 分析发现受体激活后,该靶蛋白的mRNA不仅没有上升,反而是在下降的。这也能理解,因为这种靶蛋白是一种转录因子,本身对自己的mRNA具有负性调控作用。于是我分析可能这种调控作用是发生在翻译水平或者蛋白稳定性方面。我用放线菌素D预处理细胞,之后再加入受体激动剂,然后再WB分 ...

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【求助】求助:一个论文题目

银钥灵 大家好~~我准备写毕业论文,可是就一个题目就把我难倒了,想请大家帮帮我,我的实验是将一种牛的DNA的一部分与一对引物结合,最后测序,就这样,怎样起名字呢?麻烦大家帮帮我~biolinkphilic 你连实验目的都没说清楚,怎么起题目呢?你说的貌似是实验手段,实验题目一般是实验的目的和用途。银钥灵 其实我都没有弄的太清楚实验就做完了,我做的大概是这样的,从那种牛的血液中提取DNA,然后老师给我一对引物,对加入引物的DNA ...

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【求助】矛盾的实验结果:IKb alpha和NFKB同时升高

吴佰霖 我的基因过表达,结合文献,推理应该是IKb alpha下降,而NFKB升高 (IKb可磷酸化NFKB,使后者降低)但现在我的结果是两者同时升高,请问可能的原因有哪些呢?谢谢woxingwosu 可否检测一下NFKB的磷酸化情况?erik NFKB是检测核内的吗?检测p65还是p50/吴佰霖 检测总蛋白,为P65本文由丁香园论坛提供,想了解更多有用的、有意思的前沿资讯以及酷炫的实验方法的你,都可以成为师兄的好伙伴师兄微信号:sh ...

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【讨论】western中洗液用tween-20需要 分子级的吗

hysong 配制PBST时必须要用分子级别的吗?如果用的吐温-20是普通的化学纯的会对结果有影响吗?woxingwosu 个人觉得应该影响不大吧。lijingxin198506 应该影响不大。rencuiping 配制PBST时所用试剂如:NaCl 、Na2HPO4、KH2PO4、KCl均应为分析纯,所用吐温-20是普通的化学纯不会对实验结果有影响,只是需要注意 吐温-20的浓度不同,洗涤效果不同。一般我们实验室用0.1%的。江边的麦 ...

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【求助】体内外信号通路不一致,怎么办?

onlylittleghost 同标题,有遇到过这方面问题的同学吗?体内是camp-pka通路,体外(原代培养)是ERK1/2zaiju512 这个问题很值得思考holywater 恭喜你,可以发两篇文章如果找出为什么不同就是3篇本文由丁香园论坛提供,想了解更多有用的、有意思的前沿资讯以及酷炫的实验方法的你,都可以成为师兄的好伙伴师兄微信号:shixiongcoming

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【求助】请问有Western blot 做的比较好的公司么

mushuixiaotaozi 想找一下Western blot 做的比较好的公司xhjggl 可以买个试剂盒,自己做,这样可以增加实践机会,上海生工就有。flyeryeung http://protein.dxy.cn/bbs/topic/18102961看看这个丁香园战友写的总结吧,很有帮助。mushuixiaotaozi O(∩_∩)O谢谢啦mushuixiaotaozi O(∩_∩)O谢谢本文由丁香园论坛提供,想了解更多有用的、有意思的前沿资 ...

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【求助】RNA二级结构预测

霍一刀hxs 各位战友,谁知道哪些网站或者软件可以预测RNA的二级结构?谢谢。吴佰霖 Mfold这个网站霍一刀hxs 吴佰霖 wrote:Mfold这个网站谢谢。投你一票。本文由丁香园论坛提供,想了解更多有用的、有意思的前沿资讯以及酷炫的实验方法的你,都可以成为师兄的好伙伴师兄微信号:shixiongcoming

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【求助】请教一下关于压力相关信号转导通路的问题

走过去 因为最近在查阅压力相关信号转导通路的文献,粗略的看了一下,似乎相关的文献不多,而且压力相关信号转导通路在听毛细胞的研究稍多一些,不知道哪位高手可以回答一下关于压力相关信号转导通路的研究,例如在充溢性尿失禁当中的进展等均可?谢谢,请拨冗指点。走过去 自己顶一下,再求助。zaiju512 我帮你顶一下本文由丁香园论坛提供,想了解更多有用的、有意思的前沿资讯以及酷炫的实验方法的你,都可以成为师兄的好伙伴师兄微信号:shi ...

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【求助】荧光定量PCR结果如何分析

mushuixiaotaozi 麻烦问一下大家,如何分析real time PCR的结果,用的是SYBR Green的方法,做相对表达量的分析。结果怎么作图怎么描述?升高或者降低的倍数达到多少才有意义呢?wangke80 这个问题你查两篇国内或国外文献就知道了,或者直接百度一下。简单说就就是运用2-deltadeltaCT运算最后的结果和作图。不在于升高或降低多少倍数才有意义,而是统计是不是有意义。mushuixiaotaozi 我 ...

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【求助】寻求microRNA和慢病毒载体相关课题合作

kakaxuan1984 寻找掌握microRNA慢病毒包装技术的科研人员合作,由于本人课题需要,需要构建microRNA慢病毒载体,因为是大鼠系统性用药,所以用量较大,您只需提供病毒包装即可,其他由我们来做,研究成果分享形式,有意者可邮件交流kakaxuan1984@126.comdujinghua 请问楼主慢病毒让公司包装的话,大鼠系统用药需要很大的病毒量,所有都让公司包装的吗?shylook dujinghua wro ...

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【求助】请问谁有mir-21在癌症术后升高的文献或者相关文献

gaoyongxin 请问谁有mir-21在癌症术后升高的文献或者其他miRNA升高的相关文献zhidan1728 我看到过miRNA21在癌症方法的综述,也看到过其在心血管方法的文献,不过你可以在pubmed上搜搜,应该就找得到。gaoyongxin 这一方面的文章我也看了很多 都是miR-21术后下调的 没有看到过上调的 但是我现在需要的是上调的文献的支持 其他miRNA术后上调的也可以dnazyme Upregulation of mi ...

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【求助】关于真菌分子生物学问题

crystalilixu 请教各位老师:关于真菌的问题,我用抗真菌药物处理后,真菌生长收到了抑制,电镜下真菌形态发生了变化,但是下一步的为了探索其可能的作用机制,从分子生物学领域可以作哪方面的工作啊?阳光海岛 这个问题的关键是你的“抗真菌药物”是什么,不是说他是什么名字什么结构,而是指它是一个化学合成新药,仿制药,还是中药提取物,又或者是其他物质。来源不同,研究的方法就不太一样。对于化学合成的新药,一般来说现在都是靶向药物 ...

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【求助】用流式细胞术检测细胞内某蛋白磷酸化或某磷酸化蛋白表达水平对一抗有特殊要求吗?

yaojun2006whu 有些公司的一抗介绍明确注明可以用于“流式检测”某蛋白磷酸化或某磷酸化蛋白表达水平,但用流式细胞术检测细胞内某蛋白磷酸化或某磷酸化蛋白表达水平对一抗有特殊要求吗?是不是未标明可用于流式检测的一抗,就不能用于流式检测呢?请教园中兄弟姐妹,比较急,谢谢!kern6549 流式检测胞内磷酸化蛋白一种抗体就够了,就是荧光素偶联的该磷酸化蛋白的抗体,不需要一抗、二抗、三抗什么的。yaojun2006whu ...

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