【求助】选择性剪切问题
丁香园论坛
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有个选择性剪接的问题不是很懂,想请教下大家
一个完整的mRNA个外显子,起始密码子在第一个外显子,终止密码子在第十一个外显子。
第二个外显子选择性剪切缺失之后,随后的序列发生移码,终止密码子出现在第三个外显子了,那后面4-11个外显子还能翻译不?
有没有可能后面的外显子内重新出现个起始密码子,也同样翻译?
类似于原核生物的多顺反子那样。
因为在genebank上可以查询到相应的序列,里面标注的CDS的翻译起始位点已经不是完整mRNA时的位点。
同时,蛋白数据库里也能查询到相应的蛋白。
一个完整的mRNA个外显子,起始密码子在第一个外显子,终止密码子在第十一个外显子。
第二个外显子选择性剪切缺失之后,随后的序列发生移码,终止密码子出现在第三个外显子了,那后面4-11个外显子还能翻译不?
有没有可能后面的外显子内重新出现个起始密码子,也同样翻译?
类似于原核生物的多顺反子那样。
因为在genebank上可以查询到相应的序列,里面标注的CDS的翻译起始位点已经不是完整mRNA时的位点。
同时,蛋白数据库里也能查询到相应的蛋白。
我们也遇到这种问题,不知道是怎么回事,推测可能是正在降解
在Cyclin A的研究中也发现多一个内含子的不完全剪切现象。
可能要对序列做一些分析了,一般来说断了之后不能再翻译后面的了,因为真核生物翻译起始因子的结合位点没有了,而从5'上翻译过来的核糖体在遇到终止子后按理论上说是脱落了,如果现在实验发现还能翻译的话也不排除核糖体没有脱落而是跳过这个终止子后继续干活哈。
理论上如果出现这种突变的话,mRNA是不稳定的。楼主可以做下mRNA的拷贝数,看看是否存在无义突变介导的mRNA降解。
另外,一般来将在翻译结束后,核糖体并不是完全脱落。而是大亚基脱落,小亚基继续在mRNA上滑动,这个可以参见很多研究uORF的文献。但不是遇到ATG就可以起始翻译的,对于真核细胞来讲,得看Kozak序列强不强。
另外,一般来将在翻译结束后,核糖体并不是完全脱落。而是大亚基脱落,小亚基继续在mRNA上滑动,这个可以参见很多研究uORF的文献。但不是遇到ATG就可以起始翻译的,对于真核细胞来讲,得看Kozak序列强不强。
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