【求助】荧光定量PCR结果如何分析
丁香园论坛
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麻烦问一下大家,如何分析real time PCR的结果,用的是SYBR Green的方法,做相对表达量的分析。结果怎么作图怎么描述?升高或者降低的倍数达到多少才有意义呢?
这个问题你查两篇国内或国外文献就知道了,或者直接百度一下。
简单说就就是运用2-deltadeltaCT运算最后的结果和作图。不在于升高或降低多少倍数才有意义,而是统计是不是有意义。
简单说就就是运用2-deltadeltaCT运算最后的结果和作图。不在于升高或降低多少倍数才有意义,而是统计是不是有意义。
我从网上查了一些资料,有的文章写到 “在使用相对定量时,首先要考虑的是数据如何呈现。需要注意的是,Ct值是指数关系,而不是线性关系,不能用于t 检验或方差分析(ANOVA)这些需要正态分布的统计分析方法。有些研究者直接使用原始Ct值进行统计学分析,这在方法学上是错误的。统计数据时应将原始Ct值进行2-Ct转换,从而达到线性关系。” 你的意思是统计原始Ct值进行2-Ct转换后的值么??
那么假设说用2-deltadeltaCT 算出样本1 比样本2的倍数Fold=0.5,这代表样本1比样本2增加0.5倍么?还是代表样本1是样本2的1/2 ,即降低了0.5倍呢??
这样的倍数关系又如何用统计呢?
新手上路好多不理解的事情,望多多包涵指教,谢谢!!:)
那么假设说用2-deltadeltaCT 算出样本1 比样本2的倍数Fold=0.5,这代表样本1比样本2增加0.5倍么?还是代表样本1是样本2的1/2 ,即降低了0.5倍呢??
这样的倍数关系又如何用统计呢?
新手上路好多不理解的事情,望多多包涵指教,谢谢!!:)
我平时用的是Taqman的探针做的,仪器生产公司的貌似不是很推荐用SYBR Green,因为后者需要多做一个熔解曲线。
不知道您最后到底怎样做的图呢
好问题
我就一直没弄明白双Δ法怎么做error bar的
roy2929
我就一直没弄明白双Δ法怎么做error bar的
卡卡西23
你以某组中的某一个样品为1,其他的所有样品都算一个比值,然后统计各组相对表达量的均值和SD。
最后一句能不能具体说明,怎么统计?
既然是比值,均值和SD怎么算
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