如何分析 JC- 1 染色数据？

下面我将通过一个实例分析 JC- 1 染色数据：

1. 细胞模型是胶质瘤，给予阳性药 CCCP（线粒体脱偶联剂）处理后消化下来上机（FACScan）检测。

2. 把 listmode 格式的原始数据文件拿回来，用 winMDI 2.9 或者 FlowJo 分析作图。

3. 下面两个图是 density plot (密度图)，不是 dot plot (散点图)，一个点不代表一个细胞，而是代表染色强度相同的若干个细胞。我个人更喜欢 density plot，干净清爽，还是彩色的。

4. 横轴示 FL- 1 Channel 收集的绿色荧光信号，来自 JC- 1 monomer；纵轴示 FL- 2 Channel 收集的红色荧光信号，来自 JC- 1 aggregates。

5. C 图细胞群为正常对照，我把细胞群摆在近中央的位置。D 图是 CCCP 处理过的细胞，相对于对照，可见 CCCP 处理的细胞群往右下方发生移动，即红色荧光减弱，绿色荧光增强，这表明 CCCP 处理导致线粒体膜电位下降。

6. 如何定量分析：通过 winMDI 2.9 软件可分别得到 FL- 1 channel 和 FL- 2 Channel 的数学均值（arithmetic mean）以表示细胞群的平均红、绿荧光强度，然后自行计算红/绿荧光强度的比值（Ratio）。可见 CCCP 处理组的 Ratio 明显小于对照。重复 n 次实验，对 Ratio 进行统计。