【求助】关于真菌分子生物学问题
丁香园论坛
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请教各位老师:
关于真菌的问题,我用抗真菌药物处理后,真菌生长收到了抑制,电镜下真菌形态发生了变化,但是下一步的为了探索其可能的作用机制,从分子生物学领域可以作哪方面的工作啊?
关于真菌的问题,我用抗真菌药物处理后,真菌生长收到了抑制,电镜下真菌形态发生了变化,但是下一步的为了探索其可能的作用机制,从分子生物学领域可以作哪方面的工作啊?
这个问题的关键是你的“抗真菌药物”是什么,不是说他是什么名字什么结构,而是指它是一个化学合成新药,仿制药,还是中药提取物,又或者是其他物质。来源不同,研究的方法就不太一样。
对于化学合成的新药,一般来说现在都是靶向药物研发,靶点是提前选定的。但你这个情况中,靶点未知,所以猜测你的药物不是这类。
对于仿制药,那么就可以查查关于被仿制的药物的相关文献,看它是针对什么靶点设计的。
如果是中药提取物或者其它的,那就比较麻烦了。这得看你的研究想做多深了,得具体问题具体分析。
一般的,那么研究一下药物的抗菌活性(我不知道你说的抗真菌是对单一真菌有效还是广普抗真菌),再研究一下这个药物的细胞毒性,细胞毒性没有或者很低那就最好。
深入一点,在这个药物药效好且毒性低的前提下,去研究机理,寻找靶点。那么一方面可以去寻找与该真菌有关的文献,看看是否有已知的靶点,研究下是否可能是命中了这些已知的靶点。另一方面可以寻找与药物相关的文献,看看其他对该药物的研究,是否能得到提示。
最后,如果要系统地研究这个问题,那需要基因组学和蛋白组学等多方面的知识。简单来说,可以看看加入药物之后,真菌内部的基因转录的变化(mRNA水平),以及其蛋白表达的变化(蛋白水平)。通过这些方法找到可能的靶点之后,再通过基因缺失或者RNAi来确定,哪个靶点是你药物起作用的地方。
再深入一步的话,再找到靶点之后还可以通过结晶的方法研究靶点和药物是如何结合的,药物是结合到了靶点的什么位置,产生了什么作用从而一步一步影响到最后,抑制了真菌。
对于化学合成的新药,一般来说现在都是靶向药物研发,靶点是提前选定的。但你这个情况中,靶点未知,所以猜测你的药物不是这类。
对于仿制药,那么就可以查查关于被仿制的药物的相关文献,看它是针对什么靶点设计的。
如果是中药提取物或者其它的,那就比较麻烦了。这得看你的研究想做多深了,得具体问题具体分析。
一般的,那么研究一下药物的抗菌活性(我不知道你说的抗真菌是对单一真菌有效还是广普抗真菌),再研究一下这个药物的细胞毒性,细胞毒性没有或者很低那就最好。
深入一点,在这个药物药效好且毒性低的前提下,去研究机理,寻找靶点。那么一方面可以去寻找与该真菌有关的文献,看看是否有已知的靶点,研究下是否可能是命中了这些已知的靶点。另一方面可以寻找与药物相关的文献,看看其他对该药物的研究,是否能得到提示。
最后,如果要系统地研究这个问题,那需要基因组学和蛋白组学等多方面的知识。简单来说,可以看看加入药物之后,真菌内部的基因转录的变化(mRNA水平),以及其蛋白表达的变化(蛋白水平)。通过这些方法找到可能的靶点之后,再通过基因缺失或者RNAi来确定,哪个靶点是你药物起作用的地方。
再深入一步的话,再找到靶点之后还可以通过结晶的方法研究靶点和药物是如何结合的,药物是结合到了靶点的什么位置,产生了什么作用从而一步一步影响到最后,抑制了真菌。
谢谢前辈
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