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想不到吧?OpenBUGS 除了做统计还能这样用......

我们大家都知道,OpenBUGS 是进行贝叶斯统计分析的得力工具,它不仅能做统计分析,详情请戳手把手教你用 OpenBUGS 做统计,还可以绘制疾病地图,下面告诉大家如何利用 OpenBUGS 绘制疾病地图。需要准备的材料1. 需要绘制的目标地区地图,一般从中国地理信息系统网站上可以下载到(.shp)格式的中国及各省份的地图。2. 数据,需要目标地区各个行政区域上某种疾病的发病率或患病率,并能计算出疾病的期望发病或者期望死亡数据。3. 需要在电 ...

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让文献按影响因子大小排列的神器在此

在《如何查找核心文献(一):知网高级检索》、《如何查找核心文献(二):文献管理软件》中,我们已经详细了解了如何通过网站配合软件查找到核心文献。然而,对于外文的文献检索,仍有着不方便之处,正如我们想到检索中文文献就会想到 CNKI 一样,一想起外文文献检索,PubMed 肯定是首选。凭借着其庞大的文献量,对于写作医学类论文有着很大的便捷之处。然而,在检索界面,我们除了文献摘要外,并不能获得更多关于可以用于评价文献质量方面的提示(图 1)。图 1 ...

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手把手教你用软件便捷地数细胞

统计图,和科研领域里的大多数图像数据伴生,是一种大家喜闻乐见的,直观表现数据结果的形式。周围的 Lab 不管是做免疫,还是发育,或者肿瘤,都涉及到要做免疫荧光(Immunofluorescence, IF)或者免疫组化(Immunohistochemistry, IHC),而在拍完了图之后,直接给老板 show 漂亮的 images 时并不能让 TA 百分百满意,总是想要一个 bar 图,那就需要统计了。而手动点数细胞太费时,所以向大家介绍一个有用的软件 IMARIS ...

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三十五岁拿着五千的月薪,这种工作还能要吗?

看到工资条的那一刻,老林摸着鼠标的手有些颤抖。去掉五险一金等,3 月份打进工资卡的不到五千块。想想一家三口的生活,他又忍不住叹了口气。老婆从刚结婚那会就在说相当全职太太,而等到儿子都上了小学,她还在过着每天加班的日子。唯一庆幸的是,房子买得早,房贷轻松点。于是,第 xxx 次想要离职的念头又出现了……丁香园于 2017 年 3 月~5 月进行了医生薪酬调研,了解了临床医生 2016 年的收入情况。数据显示 2016 年临床医生平均年薪为 8.5 万元(薪酬包括:工资、奖金、 ...

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WB 同一批次蛋白跑出的条带为何不一致

WB,又叫蛋白质免疫印迹,是很常见单很重要的一个分子生物学实验。然而,大家常常会遇到各种问题,特别是新手,有时候不知道如何下手,学霸君汇总了一下。欢迎大家来一起交流共同进步。问题chengxue727 :每次提蛋白后会将样品在短时间内重复 2-3 次 WB,但是每次跑出的条带趋势不一致,上样量和其他条件都没有变,内参基本是整齐稳定的,不知道为什么目的条带就是不一致?求解。回答dxymuchong:内参稳定说明上样量稳定(应该大致是 ...

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熬夜刷了复联 3,我必须读点书平静一下

这个夏天,复联 3 来了……正义的美队,嘴炮的蜘蛛侠、豪爽的毁灭者、理性的奇异博士,心有猛虎细嗅蔷薇的黑寡妇、憨厚的王……我们爱电影里的每一个超级英雄。那科研狗的英雄梦呢?发 nature、 science,拿国奖,戴上博士帽,入选千人计划,评上教授,同时迎娶白富美?咳咳,醒醒~这个夏天,华大基因学院特为您准备两场学习盛宴【生信和肿瘤遗传咨询】,助力您的「英雄梦」!1. 疾病生物信息分析培训班:专家手把手教您从容处理疾病海量数据,解读经典案例,实践 ...

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学霸唠唠:学历之间的差距会影响感情吗?

说说我的经历吧,我和女朋友是大四认识的,十二月份一起考研,成绩出来了,不出意外我肯定是没考上的,可她考的非常不错。三月份女友去复试,不负所望的顺利通过了复试被正式录取了!复试期间两个人还闹得很不开心,后来约着两个人一起把话说明白,记得她哭了,哭的我满是负罪感。那一天聊了很多很多,我们的感情迅速升温。五月份毕业考,她跟我去了家里。六月,毕业分飞。她回家等研究生开学,我回县里准备工作。(来自丁香园站友@安度 F1TY)最近看女 ...

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和医学生谈恋爱是种什么感觉?|唠唠

一位网友吐槽了一个朋友的男票是医生的故事,没想到一石激起千层浪。。。原来和医生谈恋爱这么健康的吗!一起来感受一下~(来自微博@一颗会讲故事的柠檬)△ 图片来源于:丁香园论坛@江江106105 有次学校晚会肚皮舞排练,男票围观,结束后冷不丁扔过来一句:我看到了你的麦氏点,以及测试他是否说谎查看心尖搏动点搏动频率,按摩捏腓肠肌系列……@2n10000n 谈啥恋爱哦,学医以后什么都没了希望,特别是在县级医院上班,一年四季 80% 时间科室为家,这 ...

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国内工作 or 国外读博?这是个问题……

面对未来的选择,自己究竟何去何从?在出国的这条路上,可能会一下子不知所措。偶然逛园子的时候发现大家也在纠结这个问题:选择国内工作 or 国外读博?@tiger234:想好以后做什么了吗?北美读博士都有 5 到 6 年,完全和临床不沾边。读完之后做什么?继续博后?那你以后注定做科研,和别人拼文章;或者博士毕业回国,还能做回临床吗,要规陪吗?如果不做临床,继续科研,注定还要博后,继续漂泊。不要为了出国而出国,一旦走上这条路,路漫长不说,有一天,甚至想 ...

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3 年免疫共沉淀经验总结

免疫共沉淀(Co-Immunoprecipitation)是以抗体和抗原之间的专一性作用为基础的用于研究蛋白质相互作用的经典方法。它可以:测定两种目标蛋白质是否在体内结合;确定一种特定蛋白质的新的作用搭档;分离得到天然状态的相互作用蛋白复合物。实验原理当细胞在非变性条件下被裂解时,完整细胞内存在的许多蛋白质-蛋白质间的相互作用被保留了下来。如果用蛋白质 X 的抗体免疫沉淀 X,那么与 X 在体内结合的蛋白质 Y 也能沉淀下来。目前多用精 ...

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献给初学者:WB 操作步骤详解(上)| 实验

我做 western 的时候,发现目前的资料都很老,网上的资料也大多互相传抄,说法各异,于是综合了目前网上所能找到的资料和个人实际经验,编辑了这份 western blot 操作步骤,内容包括主要操作步骤和所需要注意的有用的细节,并附上参考文献。我按下文的步骤操作已经做出来了稳定可重复的、背景干净的 western 条带了,所以相信你也行。背景蛋白质印迹的发明者是斯坦福大学 George Stark。Neal Burnette 于 1981 年所著的 Analyt ...

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学霸唠唠:毕业论文被抽到盲审,这可肿么办?

硕士实验做得很水,最近又忙于找工作,毕业论文写得一团糟,却被抽到了盲审,真是要哭了。@clhong1094:我现在焦虑死了。我是专业型的。但我做了点小实验,论文只把这小实验的结果写上去了,两部分。写了五篇综述,一篇 meta,meta 发表在 Plos one,但我没有把这些文章弄成论文,时间太仓促了。老板说内容不够,现在焦虑死了,该怎么办?痛苦挣扎中!@yhllove1:不用怕,用点功把论文写得条理性逻辑性强一点,没人会为难你的。因为全 ...

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实验时间 | 不识文献真面目,只因没懂框架图

「穿上白大衣,手拿移液器,配置显微镜」小明一如儿时课本上所画生物科学家一般,他怀揣着梦想与忐忑推开科研大门,见到了耀眼的导师。导师慈眉善目,温和地说:「刚读研,要多看看文献,积累科研思维课题设计」。小明点头如捣蒜,内心却纠结如线团。咋看,无从下手呀!怎样把文献看的既快速又通透?今天就给大家分享一些「小套路」。首先,我们来看一下肿瘤相关文献共通点。肿瘤的研究分为现象发现,机制探索,现象验证几大类。其课题设计和文章书写无外乎以 ...

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献给初学者:如何看流式细胞术结果中的图?

FCM 数据的存贮的方式是 FCS2.0(flow cytometry standard),采用列表排队(List Mode)方式。易于加工处理分析,但缺乏直观性,数据的显示通常有一维直方图、二维点图、等高线图、密度图等几种。由数据还可以做出标准曲线进行定量分析。坐标轴的意义?单参数直方图每一个细胞单参数的测量数据可以整理成统计分布,以直方图的方式来显示。在图中,横坐标表示荧光信号或散射光信号相对强度的值,其单位是道数(channel), ...

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俩博士相亲后,首先应该做什么 | 唠唠

赶快打开电脑,一言不合就检索,查下对方发了几篇文章,都是多少分的?分区怎样?通讯作者哪个?是不是大牛?门当户对吗?博士论文写得怎样?研究方向有没有前途?

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那个劝我学医的「智障」男朋友,现在是前男友了

今天要跟大家聊的话题是:当年,你是怎么选择学医的?6 月,又是一年毕业季,又是一年高考时。不妨都来聊聊自己为什么选择学医?跟同行们聊了一下,学医大概有以下几种原因:数学成绩不好的@一定能赢你:1.学医不用学数学。对,我就是个学渣。2.从小对生物感兴趣,所有科最好的就是生物。当时啥也不懂,觉得学医和生物最接近(这脑回路也是没谁了)。3.因为一句话:「不为良相,即为良医」。虽然贪生怕死,但是医学给人带来的成就感是无与伦比的,我们在一个 ...

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男友说,我考上博士就跟我分手

今天学霸君在逛园子的时候,发现了一个有趣的帖子@丁香园站友 jlhdlium 「他说,只要我考上博士就不会在一起,还说爱我,我该怎么办」。别冲动啊,妹子,你看学霸君单身二三十年,对象真的蛮难找的。然而,姑娘回帖了:面试没过,心里却有一丝安慰,可男友还要分手,我都考不上了啊。这样的男朋友不分手要留着过年吗!

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搞科研的人和平常人究竟有什么不一样?

搞科研的人,和平常人究竟有什么不一样?不比不知道,一比吓一跳:我待科研如初恋,科研虐我千百遍;失败是无需理由的,继续又是必须的。

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大数据时代,一作发表40篇SCI的大牛教你如何让大数据为己所用

如今,海量的数据已经成为这个时代的最重要的符号,我们常说,这是大数据的时代。很多人会误解,以为大数据是数据工程师的工作,殊不知大数据与各行各业都息息相关,医生亦是如此。在医疗诊治的过程中,大数据的获取、分析和处理,能更加精准地推动医学的发展。传统的临床试验中,首先是在小群体中测试新药或新的诊疗方法,然后通过观察治疗的效果,和是否有副作用的出现。当试验证明药物或诊疗方法凑效后,试验将扩展到更大的人群中。传统的临床试验 ...

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原来这么漂亮的 Cell 期刊插图可以用 AI 画出来

每当我们下载一篇 Cell 杂志的文章时往往都是以一篇精美的 Graphical Abstract 开篇,羡煞旁人,那这种高清度的配图如何制作呢,我们本期就以 Adobe Illustrator 为绘图软件,画出适合发表在 Cell 上的信号通路图。我们打开软件后选择左边的「铅笔工具」,先从画线粒体开始,描出大致形状后可在图形选中的情况下修改线条,一直改至线条圆滑为止(初步看还是较为满意滴)。然后我们选择左侧「填色」,对颜色进行填充;首先选中图形,双击左 ...

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