【求助】hsa-mir-150 基因序列
丁香园论坛
1668
请教各位大侠,为什么我在MiRbase上找不到hsa-mir-150 基因上下游序列呢,请各位高手帮忙找一下,十分感谢!
这是什么意思啊,由于刚涉及这方面还不太懂,还请高手多指教,非常感谢!
你是要找编码hsa-mir-150的序列吗?
如果是想构建hsa-mir-150表达载体,在MiRbase上是找不到的,你只能找到hsa-mir-150的成熟序列或者是前体序列。但是你可以直接在PubMed里面Gene里面输入Mir150,然后看它在基因组中的定位,之后根据你想要的长度进行上下延伸,这样就可以找到hsa-mir-150的上下游序列了。
如果是想构建hsa-mir-150表达载体,在MiRbase上是找不到的,你只能找到hsa-mir-150的成熟序列或者是前体序列。但是你可以直接在PubMed里面Gene里面输入Mir150,然后看它在基因组中的定位,之后根据你想要的长度进行上下延伸,这样就可以找到hsa-mir-150的上下游序列了。
GGAACAGCAGGTCTGGTGGGTGCTGGGGGTGTGGGGCTGAGTGAGAGGGAGAGCAGGTGG
GAGGGGAGACAGGGGAACCCGCTGACCTAGGAACTGTATCTCCTTGGGTTATCAAATAAC
CTGTGGGCAGGGTGCAGTGGCTCACGCCTGTAAAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAATAT
GGGTGGATCATGAGGTCAGGAGTTCGTGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCCCGTCT
CTACTAAAAATTAAAAAATTAGCTGGGTGTGGTGGTGCATGCCTGTAATCCCAACTACTT
AGGAGACAGAGGCAGGAGATTCGCTTTAACTTGGGAGGCGAAGGTTGCGGTGAACCAAGA
TCGCGCCATTGCACTCCAGCCTGGGCGACAGAGCAAGAATCTGCCTCAAAAATAAAATAA
AATAAAATAAAAATAAAAAAATAAAAAGAACCTATGGTCCTTATCCCCACTCTTCAGGTG
GAAGGCCTGTCAAGAGGTCCGAGGGGGTCTTTTAAACTTGCTCTTTGCAATCCAGCAGGC
CCAGCAGAGGTCCTTCCCCAGCACACACTCTGACCTCAGCACACCACCTGACGTGATGGG
GTGCCAAGGAGACGCCCCAACAATCAGGGAGGAAACCGGGGAGCCGGGCTGTTGTTGTAA
ACACAGCAGCCCCACCCGAACGGAAACACCTGCGGCTGAGGGGAGGGGGCCGCAACCTCC
TATTCCCCTCTGGGTCTCCGTCCCCTCCCTCTGGAGTCCACACTCCCTCTTTGCCCCTTG
CTGGTTCTCTACTGCCCCCAGCATAGGGTGGAGTGGGTGTGCAGTTTCTGCGACTCAGGG
TGGCGTCCCCCCAACCTGTCCCTGCCCCTTCCTGCCCTCTTTGATGCGGCCCCACTTCCT
CTGGCAGGAACCCCCGCCCTCCCTGGACCTGGGTATAAGGCAGGGACTGGGCCCACGGGG
AGGCAGCGTCCCCGAGGCAGCAGCGGCAGCGGCGGCTCCTCTCCCCATGGCCCTGTCTCC
CAACCCTTGTACCAGTGCTGGGCTCAGACCCTGGTACAGGCCTGGGGGACAGGGACCTGG
GGACCCCGGCACCGGCAGGCCCCAAGGGGTGAGGTGAGCGGGCATTGGGACCTCCCCTCC
CTGTACTCCCATCTCTGCTGCGGCTTTTATGCGTCTCTCCCCTTCGGGTCCCACATATCC
TCTGGTGCGCTCCTGCCTCACCGCCCCCACCCCATGCCTGTCGTCCCCACCTCTGTGTGA
TGCGCAAAGTACACCTGTTTCTATTGTACCTGCCTCTCGCGGTGGTCTGTGCTCTCCCCA
GCTCTGCAAAACCCCTCCTCCCCATGTGCCACAACCCTGGGCCACCGTGTGTCCTGTCCT
GTTCCTCTCAAGGCCCCCATCTCTGCGGCCTGTGTGTATTGGGCCGTCTCCGGACGCTTC
CTGCCCACTTCCTTCCCAGCAGCCTGGGCCCCGGTACCACTGAACAGGCTCCAGGGGAGC
CTCATGATGCCACTTGCCCACACCACCAATTTCCTTACTGCGATTTTGAGGCAGCTGGCG
CAGAGGAAGTTTCTAGAATCTGAGACCTGTAACTCAGCTACTCACTGGGACTTCAGGTGG
AGGGCTTGGCCTCTCCCAGATGAGTTTCCTCATCTGCAGATAGGCCTGGTGCCCAACTAG
GCGTGTGTGGTGCGTGCATGGGGCCCCCATCCTTGGCTGTAAGGAGGGATAGGAGGCCCA
GGCTAAAGCCAAGACCTTTACACTTCACAGCCAGACAACAGGGCCTCAGCACATCCCACT
CTACCTGGGTGAGCCCATGCCCACAGCAGGGGGGGGCTGCAGCTTCTTCCCCTCCCCACC
CGAGGTGGTCAGGAAAGAGACAGACCAGGGCCTGGAGGACCCAGGGGCCTCCGCCGTCAC
TCACTTCCTCCCCAGAGACCGGAGGGGGCGGGGGGACAGCGCAACGCCAGGTAATCAGCC
TTATTCAGACACCGAAAAGGTGACAAGGACCAAAGAAGGAGACCCAGGGGAAGGCAGGCA
TCTCAGTTCAGGCTCCACTGTCCTCACCCACAGACATGGGCAGG
两旁加了1000bp的flank sequence,来源:ensembl:http://www.ensembl.org/Homo_sapiens/Gene/Summary?g=ENSG00000207782;r=19:50004042-50004125;t=ENST00000385048
GAGGGGAGACAGGGGAACCCGCTGACCTAGGAACTGTATCTCCTTGGGTTATCAAATAAC
CTGTGGGCAGGGTGCAGTGGCTCACGCCTGTAAAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAATAT
GGGTGGATCATGAGGTCAGGAGTTCGTGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCCCGTCT
CTACTAAAAATTAAAAAATTAGCTGGGTGTGGTGGTGCATGCCTGTAATCCCAACTACTT
AGGAGACAGAGGCAGGAGATTCGCTTTAACTTGGGAGGCGAAGGTTGCGGTGAACCAAGA
TCGCGCCATTGCACTCCAGCCTGGGCGACAGAGCAAGAATCTGCCTCAAAAATAAAATAA
AATAAAATAAAAATAAAAAAATAAAAAGAACCTATGGTCCTTATCCCCACTCTTCAGGTG
GAAGGCCTGTCAAGAGGTCCGAGGGGGTCTTTTAAACTTGCTCTTTGCAATCCAGCAGGC
CCAGCAGAGGTCCTTCCCCAGCACACACTCTGACCTCAGCACACCACCTGACGTGATGGG
GTGCCAAGGAGACGCCCCAACAATCAGGGAGGAAACCGGGGAGCCGGGCTGTTGTTGTAA
ACACAGCAGCCCCACCCGAACGGAAACACCTGCGGCTGAGGGGAGGGGGCCGCAACCTCC
TATTCCCCTCTGGGTCTCCGTCCCCTCCCTCTGGAGTCCACACTCCCTCTTTGCCCCTTG
CTGGTTCTCTACTGCCCCCAGCATAGGGTGGAGTGGGTGTGCAGTTTCTGCGACTCAGGG
TGGCGTCCCCCCAACCTGTCCCTGCCCCTTCCTGCCCTCTTTGATGCGGCCCCACTTCCT
CTGGCAGGAACCCCCGCCCTCCCTGGACCTGGGTATAAGGCAGGGACTGGGCCCACGGGG
AGGCAGCGTCCCCGAGGCAGCAGCGGCAGCGGCGGCTCCTCTCCCCATGGCCCTGTCTCC
CAACCCTTGTACCAGTGCTGGGCTCAGACCCTGGTACAGGCCTGGGGGACAGGGACCTGG
GGACCCCGGCACCGGCAGGCCCCAAGGGGTGAGGTGAGCGGGCATTGGGACCTCCCCTCC
CTGTACTCCCATCTCTGCTGCGGCTTTTATGCGTCTCTCCCCTTCGGGTCCCACATATCC
TCTGGTGCGCTCCTGCCTCACCGCCCCCACCCCATGCCTGTCGTCCCCACCTCTGTGTGA
TGCGCAAAGTACACCTGTTTCTATTGTACCTGCCTCTCGCGGTGGTCTGTGCTCTCCCCA
GCTCTGCAAAACCCCTCCTCCCCATGTGCCACAACCCTGGGCCACCGTGTGTCCTGTCCT
GTTCCTCTCAAGGCCCCCATCTCTGCGGCCTGTGTGTATTGGGCCGTCTCCGGACGCTTC
CTGCCCACTTCCTTCCCAGCAGCCTGGGCCCCGGTACCACTGAACAGGCTCCAGGGGAGC
CTCATGATGCCACTTGCCCACACCACCAATTTCCTTACTGCGATTTTGAGGCAGCTGGCG
CAGAGGAAGTTTCTAGAATCTGAGACCTGTAACTCAGCTACTCACTGGGACTTCAGGTGG
AGGGCTTGGCCTCTCCCAGATGAGTTTCCTCATCTGCAGATAGGCCTGGTGCCCAACTAG
GCGTGTGTGGTGCGTGCATGGGGCCCCCATCCTTGGCTGTAAGGAGGGATAGGAGGCCCA
GGCTAAAGCCAAGACCTTTACACTTCACAGCCAGACAACAGGGCCTCAGCACATCCCACT
CTACCTGGGTGAGCCCATGCCCACAGCAGGGGGGGGCTGCAGCTTCTTCCCCTCCCCACC
CGAGGTGGTCAGGAAAGAGACAGACCAGGGCCTGGAGGACCCAGGGGCCTCCGCCGTCAC
TCACTTCCTCCCCAGAGACCGGAGGGGGCGGGGGGACAGCGCAACGCCAGGTAATCAGCC
TTATTCAGACACCGAAAAGGTGACAAGGACCAAAGAAGGAGACCCAGGGGAAGGCAGGCA
TCTCAGTTCAGGCTCCACTGTCCTCACCCACAGACATGGGCAGG
两旁加了1000bp的flank sequence,来源:ensembl:http://www.ensembl.org/Homo_sapiens/Gene/Summary?g=ENSG00000207782;r=19:50004042-50004125;t=ENST00000385048
本文由丁香园论坛提供,想了解更多有用的、有意思的前沿资讯以及酷炫的实验方法的你,都可以成为师兄的好伙伴
师兄微信号:shixiongcoming