丁香实验_LOGO
登录
提问
我要登录
|免费注册

细菌的耐药基因序列长度

user-title

光爱吃鱼

想请教一下大家,编码细菌的耐药基因是都要完整的CDS才能发挥耐药性吗,还是含有部分序列就可以?

wx-share
分享

3 个回答

user-title

毛利小五郎的徒弟

有帮助

建议使用全部的序列,部分序列非常不稳定,容易变异

user-title

光爱吃鱼user-title

那检测细菌耐药性是不是只需要下载完整的序列比对找到保守区设计引物即可

user-title

huarenqiang5

有帮助

大多数都是全基因测序。细菌对抗菌药物的耐药性通常是由耐药基因编码的,可通过多种机制介导,如基因的点突变、插入、丢失或通过基因水平转移(horizontal gene transfer,HGT)的方式获得外源耐药基因。从全基因组测序数据中识别耐药基因主要分为2种分析模式:一种是序列组装后比对分析(assembly-based),另外一种是直接利用测序读段映射分析(read-based)。

user-title

Dr_劉医生

有帮助

最好是CDS序列,CDS在编码基因的功能注释上表现更好,能够避免部分序列产生变异。

提问
扫一扫
丁香实验小程序二维码
实验小助手
丁香实验公众号二维码
关注公众号
反馈
TOP
打开小程序