【求助】求进化树构建软件
丁香园论坛
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本人最近需要对一批测序克隆进行进化树分析,但是看文献好像有多种不同的进化树构建方式,不知道哪个软件比较合适?我想构建的是细菌的进化树,哪位高人如有能否发我一个啊?xumin101977@163.com 不胜感激!
参考文献啊,有很多的,例如mega。
用mega吧,这个软件是最专业的!
中低端:MEGA(free)
http://www.megasoftware.net
中端:phylip(free)
http://cmgm.stanford.edu/phylip
高端: paup(commercial)
http://paup.csit.fsu.edu/downl.html
最适合生物学研究者使用的是MEGA,易学易用。
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中端:phylip(free)
http://cmgm.stanford.edu/phylip
高端: paup(commercial)
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最适合生物学研究者使用的是MEGA,易学易用。
gel compare
还有这个公司出的bionumberics
如果有 DiversiLab最好,比较适合细菌基因分型,常用于院内细菌感染研究中。
但是以上软件没有free的,都需要花钱,而且不少。
~undefined*的好像没有,因为这几个商业软件都用了加密狗,很难crack。
还有这个公司出的bionumberics
如果有 DiversiLab最好,比较适合细菌基因分型,常用于院内细菌感染研究中。
但是以上软件没有free的,都需要花钱,而且不少。
~undefined*的好像没有,因为这几个商业软件都用了加密狗,很难crack。
paup,本论坛上的**版的了。MrBayes也可以偿试下。
DNAman,DNASTAR, RNAst
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