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流式细胞分析分选术

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1. 96 孔板样本处理
1.1 操作流程
接种细胞:3×104 /孔 药物刺激 一般作用24 小时,上机
1.2 方法
在cellquest 环境下,利用control 细胞标定上样条件,并在已设好的文件
夹(INS 文件及SET 文件)下,保存好需要的上样文件 关闭cellqest 软件,
打开MPM 软件 在MPM 软件下进行一系列设定(首先在Autosample 下,
进行SettingInitial 及FinalWashing 操作,清洗整个管路 管路清洗完毕进行
上样条件设定(主要设定上样体积(一般100ul),混合体积(一般100ul),混合次数,
清洗次数等,在Acquisition 菜单下设定current plate(现在使用的板号是353263),
DateStorageFolder( 即数据储存文件夹) , AcquisitionDocument 及
InstrumentSettingsFile(上样条件从保存好的INS 及SET 文件中选定) 上样
条件设定完毕,选定96 孔板的上样范围 在Acquisition 下选择Acquire,
上样 上样完毕,退出上样板,使用次*钠及水,清洗管路(将次*钠
及水加在96 孔板上,以上样的方式清洗管路)
~undefined须知:如果使用PBS 作为上样鞘液,上样完毕后,换用水作为鞘液,并反复冲
洗管路,防止PBS 盐结晶堵塞管路。
1.3 注释
1) 必需的control:应准备一管对于检测指标为阴性的细胞(例如:若要检测
Jurkat-NF-KB-GFP 经药物刺激样本,就需要准备一管Jurkat 细胞(GFP 为阴
性)),用于标定机器的上样条件。细胞量为1×106 个/ml,1ml。
2) 上机前,应对样本进行混合,以使样本均一(注意使用排枪吹打,勿产生气泡)。
3) 以上protocol 仅针对于悬浮细胞。
4) 药物刺激浓度需先做梯度检测。
第七章 流式细胞分析分选术
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2. Cell Cycle Assay
常用的实验细胞株包括:293(T),MCF7,U2OS,Saos,Hela 等
以U2OS 细胞为例
2.1 细胞培养及铺板
1) 细胞株及材料:
a) 细胞株: U2OS 细胞
b) 培养基: DMEM(10%FBS,GBICO),DMEM(无血清)
c) 培养器皿:75cm2 培养瓶,6cm 培养皿
2) 细胞培养及铺板:
a) 传代:用DMEM(10%FBS) 培养基接种U2OS 至75cm2 培养瓶,细胞长
满后铺板并传代。
注:一般一瓶细胞总数可以达到1×107 个
b) 铺板:
细胞消化:将培养好的U2OS 细胞,倾去培养基,加入2ml 1×胰酶轻轻
摇晃以覆盖整瓶细胞,37℃培养箱放置2-3min,观察细胞从
瓶壁上脱落下来(也可以用手拍击瓶壁),显微镜下观测到细胞
成单个,或是只有2-3 个细胞聚团,即可以加入5ml 含有血清
的DMEM(10%FBS),终止胰酶的消化作用。
细胞计数:如果细胞密度较大,可按一定倍数稀释后计数。
细胞密度(单位:个/ml)=(4 个大方格的细胞总数/4)×104×稀释倍数
铺板: 6cm培养皿按照每孔6×105 个细胞(即1.5×105/ml,4ml)
细胞加入后将6cm 培养皿沿水平面桌面的方向前后左右来回晃动
(手势一定要轻柔,防止培养液泼出),使细胞能够均匀分布,放置细
胞培养箱生长。
注:计算铺板量时,应将control 板,药物阳性对照板及质粒对照板考虑在内。
第七章 流式细胞分析分选术
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2.2 转染
1) 试剂及材料:
a) 转染试剂:Lipofectamin 2000
b) 质粒:对照质粒:pEF-BOS
p21(阳性对照)
p16(阳性对照)
GFP-spectin
目的基因质粒,构建在pEF-FN 载体上
注:若目的基因载体不是pEF-FN,则对应的空载体要相应变化。
2) 转染:细胞密度为50%-60%时,进行转染
A:0.3μg GFP-spectin+3μg interest gene+ serum free DMEM 至终体积500μl/
孔。
B:9.9μL lipofectamine 2000+490.1μL serum free DMEM 体积为500μl /孔,室
温放置5min
A,B 二者混合,室温放置20-30min 后将混合液缓慢而均匀的加到6cm 板
细胞液中,每板为1000μL,轻轻摇晃,使DNA 分布均匀,转染5 小时后,
换置培养液(10%FBS+DMEM)。
2.3 细胞分板
细胞分板:转染12-16 小时后, 根据细胞密度按1:3 或1:2 分板,使分
板后细胞密度为30%左右,37℃继续培养30h。
2.4 加药刺激
除了利用转染质粒作为阳性对照,也可使用药物处理细胞作为阳性对照样本
细胞铺板24 小时后,加药刺激:
G1,S-arrest :L-mimosine: 0.5mM
5-fluorourcil: 10mM
G2/M arrest : nocodazole: 50ng/ml
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加药后,继续培养24 小时
附注:作为阳性对照的基因及药物的具体使用情况见附表1。
2.5 细胞收获及处理
分别收集培养液,在每个6cm 板中加入1ml 胰酶消化(细胞消化的方法同上)。
消化完毕,加入已收集的培养液(注意一一对应,防止弄错)中和胰酶。离心(300g,
5min)收集细胞,弃上清,加入2-3ml 75%乙醇(细胞量较多,可酌量多加),votex,
充分混匀,放入-20oC 冰箱,保存。
2.6 上机样本制备
从-20oC 取出细胞样本(至少已在-20oC 放置4 小时),离心(300g,5min)收集细
胞,弃上清。1×PBS 清洗两遍,加入100ul 1×PBS,votex 混匀,加入10ulPI(终
浓度100ug/ml),10ulRnase(终浓度50ug/ml),置于37oC 水浴锅,避光处理30min。
注:细胞量较多时,PI 及RNase 量应酌量增加。
2.7 上机
在cellquest 环境下,选择FL-1(GFP)及FL-3(PI)作为研究对象,先上control
样本标定上样条件,进而上其他样本。
2.8 相关试剂的配制
1.1×PBS:采用GIBCO 1×10L D’PBS(Cat.No21600-069)配制。
2.PI:以水为溶剂,母液浓度为1mg/ml,配制完毕后,4oC 避光保存
3.Rnase:以水为溶剂,母液浓度为0.5mg/ml,配制完毕后,分装冻存于-20oC
4.L-mimosine: 以无血清培养液为溶剂,母液浓度为100mM,配制完毕后,
4oC 避光保存
5.5-fluorourcil:以DMSO 为溶剂,母液浓度为549mM,配制完毕后,4oC 保

6.Nocodazole:以DMSO 为溶剂,母液浓度为5mg/ml,配制完毕后,4oC 保存
第七章 流式细胞分析分选术
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附表1:阳性对照基因及药物
3.FACS analysis on Apoptosis
可用于凋亡检测的细胞,多为对细胞凋亡较为敏感的细胞,例如:MCF7, Hela
以Hela 细胞为例
3.1 细胞培养及铺板
1) 细胞株及材料:
i. 细胞株: Hela 细胞
ii. 培养基: DMEM(10%FBS GBICO),DMEM(无血清)
iii. 培养器皿:75cm2 培养瓶,6cm 培养皿
2) 细胞培养及铺板:
a) 传代:用DMEM(10%FBS) 培养基接种hela 细胞至75cm2 培养瓶,细胞
长满后铺板并传代。
注:一般一瓶细胞总数可以达到3×107 个
b) 铺板:
i.细胞消化:将培养好的Hela 细胞,倾去培养基,加入2ml 1×胰酶轻
轻摇晃以覆盖整瓶细胞,37℃培养箱放置2-3min,观察细
胞从瓶壁上脱落下来(也可以用手拍击瓶壁),显微镜下观测
基因 药物
G0/G1 P21,P16 L-mimosine: 0.5mM
S 5-fluorourcil: 10mM
G2/M nocodazole: 50ng/ml
第七章 流式细胞分析分选术
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到细胞成单个,或是只有2-3 个细胞聚团,即可以加入5ml
含有血清的DMEM(10%FBS),终止胰酶的消化作用。
ii.细胞计数:如果细胞密度较大,可按一定倍数稀释后计数。
细胞密度(单位:个/ml)=(4 个大方格的细胞总数/4)×104×稀释倍数
iii.铺板: 6cm 培养皿按照每孔3×105 个细胞(即0.75×105/ml,4ml)接种,
细胞加入后将6cm 板沿水平面桌面的方向前后左右来回晃动(手势一定
要轻柔,防止培养液泼出),使细胞能够均匀分布,放置细胞培养箱生长。
注:计算铺板量时,应将control 板,药物阳性对照板及质粒对照板考虑在内。
3.2 转染
1)试剂及材料:
转染试剂:Lipofectamin 2000
质粒: a:对照质粒:pEF-BOS
RIP(阳性对照)
b:GFP-spectin
c:目的基因质粒,构建在pEF-FN 载体上
注:若目的基因载体不是pEF-FN,则对应的空载体要相应变化。
2)转染:细胞密度为50%-60%时,进行转染
A:0.15μg GFP-spectin+3μg interest gene+ serum free DMEM 至终体积500μl/孔。
B:9.45μL lipofectamine 2000+490.55μL serum free DMEM 体积为500μl /孔,室
温放置5min
A, B 二者混合,室温放置20-30min 后将混合液缓慢而均匀的加到6cm 培养皿
中,每孔为1000μL,轻轻摇晃,使DNA 分布均匀,转染5 小时后,换置培养
液(10%FBS+DMEM)。继续培养
3.3 细胞收获
第七章 流式细胞分析分选术
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转染24 小时后,一旦观察到经RIP 转染的细胞明显死亡,即可收获细胞。
每板分别收集培养液,在每个6cm 板中加入1ml 胰酶(细胞消化的方法同上),
消化完毕,加入已收集的培养液(注意一一对应,防止弄错)中和胰酶,离心(300g,
5min)收集细胞。
3.4 上机样本制备
收集细胞液(包括上清) 同时准备56℃水浴处理细胞
分别取一点
没有转染的细胞
作为control
及转染的细胞
作为GFP 单染样本 PBS 洗
染AnnexinV Ab-PE 染7-AAD
室温避光15min
PE-mouse IgG 室温避光染色15min
1�binding buffer 洗两次
染7-AAD,室温避光15min AnnexinV Ab-PE/ 7-AAD 染色,室温避光15min
3.5 上机
在cellquest 环境下,选择FL-1(GFP),FL-2(PE)及FL-3(7-AAD)作为研究对
象,先上control 样本标定电压,域值,再用单染GFP 的细胞样本及水浴处理后
单染PE,7-AAD 的样本,调节补偿,最终确立上样条件,进而上其他样本。
注:A:用GFP 单染样本以及水浴处理的单标Annexin V-PE 样本调节FL1-H 及
FL2-H 的补偿;
B:水浴处理的单标Annexin V-PE 以及水浴处理的单标7-AAD 样本调节
FL2-H 及FL3-H 的补偿。
4. CD69 检测
第七章 流式细胞分析分选术
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(或其他类似的免疫荧光检测)
4.1 细胞培养
1)细胞株及材料:
细胞株:Jurkat-T 细胞或Jurkat 细胞
培养基:RPMI 1640(10%FBS GBICO;1%双抗),RPMI 1640(无血清)
培养器皿:75cm2 培养瓶;175cm2 培养瓶;25 cm2 培养瓶;96 孔细胞培养板
2)Jurkat-T 细胞的培养:
Jurkat-T 细胞为悬浮细胞,细胞活力好时,镜检多为10 个左右细胞聚团,
及少量游离的单个细胞,细胞圆而透亮。一般培养按密度来计算,起始培养
密度不要低于1×105 个/ml,24hr 后细胞密度即可达到2×105 个/ml,以此类推
在第五天上即可以达到1.6×106 个/ml,根据这个来调整接种密度及传代天数。
最好细胞的密度高不能超过1.6×106 个/ml。
例如,起始培养密度2×105 个/ml,体积30 ml,在第三天时, 细胞密度
达到8×105 个/ml,细胞总数达到2.4×107 个,因为检测一个待检基因的电击
所需细胞数量为1×107 个,所以,此培养的细胞数只能做2.4 个样品,因此,
根据实验所需要检测的样品数目来调整培养细胞的体积(象175cm2 的培养瓶
可以培养200-300ml 细胞悬液,细胞总数可以达到16-24×107,这样就可以做
16-24 个样品)。
4.2 电击转化
细胞总数达到检测样品所需则可转染(细胞密度最好在1×106/ml 左右)。
转染用品:电击仪,400mm 电击杯
质粒: a:对照质粒:NFAT 刺激系统:negative control:pEF-BOS
positive control: SYC plasmid
NFAT 抑制系统: negative control:pEF-BOS
positive control: SLIM plasmid
b: NFAT-luc report plasmid
c:目的基因质粒,构建在pEF-FN 载体上
试剂: 台盼蓝(0.4%)
1)将Jurkat-T 细胞转到50ml 离心管中,细胞计数(细胞密度最好在1×106 左右)。
第七章 流式细胞分析分选术
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2)1000rpm离心,用无血清的RPMI1640 培养液收集细胞,调整浓度为2.5×107/mL,
每个电极杯中加入400μl 细胞液(细胞总数为1×107 个)。
3)依次加入10μg NFAT-luc reporter gene 和20ug interest gene(体积控制在20μl 以
内),使质粒和细胞混匀(尽量不要产生气泡)。
4)电击条件250V,950μF。电击前轻轻弹击电击杯,将杯底的细胞重悬起来,注
意不要产生气泡。电击时观察一下time constant(约为24ms)。
5)电击完后立即弹击电击杯的侧壁使细胞混匀,室温下放置30min。
6)将电极杯中的细胞加到10mL RPMI1640 培养液中(含serum)24cm2 培养瓶,培
养40hr(即培养到第三天上午)。
4.3 铺板,加药
C305:1∶60 稀释使用
PMA: 储存浓度为0.5mg/ml,应用浓度为50ng/ml(稀释10000 倍))
Ionomycin: 储存浓度为1mM,应用浓度为1μM(稀释1000 倍));
1)将转染培养40hr 后的细胞转到15ml 离心管中,进行活细胞计数(台盼蓝染色),
离心收细胞,调整细胞浓度为2×106/ml。
2)在96 孔板中,每孔加50μL 细胞(细胞数为1×105),每个样品还是要做3 个复
孔。NFAT 刺激系统,NFAT 抑制系统可以同时进行,前者无需加药刺激,后
者需要做C305 抗体刺激和PMA+ Ionomycin 刺激,因此,一个样品需要做9
个复孔。按顺序在96 孔板中加入细胞,并相应做好标记。
3) 对于NFAT 刺激系统,直接在每孔中补加50μl 新鲜培养基,使终体积为100μl;
对于NFAT 抑制系统分别加入50μL C305(anti-TCR, 60 倍稀释);或50μl
PMA(50ng/mL)+Ionomycin(1μM),刺激8-12 小时。
4.4 细胞收获及处理
将刺激8-12 小时后的细胞取出,离心收集细胞
4.5 样本制备
第七章 流式细胞分析分选术
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A:CD69 间标法
Cells harvested
1 × PBS 清洗两遍
Cells were suspended in 1ml 1×binding buffer (1% BSA)
(cell 浓度约1×106/ml)
取其中的100μl
5μl pure-Mouse IgG1 5μl Mouse anti-human CD69 (或其它一抗)
(非特异性染色)
4oC 或冰上放置, 30min
1×binding buffer (1% BSA) 清洗两遍(每次4ml)
5μl PE goat anti-mouse IgG 及 5μl 7-AAD
4oC 或冰上,避光放置15min
1×PBS 清洗两遍(每次2ml)
上机
B:CD69 检测直标法
操作步骤基本同间标法,只是作非特意性对照的样本,直接用Mouse
anti-human IgG-pe 直接标记
4.6 上机
第七章 流式细胞分析分选术
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在cellquest 环境下,选择FL-1(GFP),FL-2(PE)及FL-3(7-AAD)作为研究对
象,先上control 样本标定电压,阈值,并调节补偿,最终确立上样条件,进而
上其他样本。
4.7 几种药物的储存浓度和应用浓度
TNF 1×106U/瓶 1mg=4×107U, 1×106U=25μg 溶于12.5mL PBS 中,浓度为
2μg/mL。
储存浓度:2μg/mL
应用浓度:20ng/mL(稀释100 倍)
C305 60 倍稀释使用。
PMA and Ionomycin(dissolved in DMSO)
PMA:1 支1mg 溶于2ml DMSO 即0.5mg/mL(储存于-80°C)
储存浓度:0.5mg/ml
应用浓度:50ng/ml(稀释10000 倍)
Ionomycin: 1mg/747.1(MW)=1.33×10-3mmol 溶于1.33ml,浓度为1mM。(储存与
-80°C)
储存浓度:1mM
应用浓度:1μM(稀释1000 倍)
5. 细胞分选
5.1 分选细胞样本处理
第七章 流式细胞分析分选术
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贴壁细胞培养:一个细胞样本 悬浮细胞培养:一个细胞样本
至少需要一个10cm 细胞板 细胞总数应大于1×107
(细胞总数大于1×107 )
收集细胞
去除培养液
胰酶消化(一般加入2ml 胰酶,
37 oC 充分消化,大约3 分钟,
消化至细胞轻拍脱壁)
加入5ml 培养液中和,充分
分散细胞(尽量使之呈单
细胞悬液,可通过显微镜观察判断)
取100ul 细胞上机,测定转染效率,剩余细胞记数,离心
根据转染效率,分选模式(一般选用exclusion 模式),调节细胞浓度,达到
上样速率1000-3000 个/秒,目的细胞300 个/秒(细胞浓度(个/ul)=300/目的
细胞百分率)
上机,分选
分选后细胞,1500 转/秒,5min,离心收集细胞
1) 若所要分选的是悬浮细胞,要求细胞总数大于1×107,直接收集细胞液
2) 必需的control:举例说明,如果需要筛选的是GFP 阳性的细胞,必须提供没
有转染的同种细胞。
3) 如果分选后的细胞还需要继续培养,需要预先用无菌的4%BSA 包埋收集管
(在无菌收集管中,加满4%BSA ,并放置于4℃至少1 小时,使用前倒除包
埋液)。
4) 如果分选后的细胞还需要继续培养,所有用到的试剂,包括鞘液,都必须无
菌处理;在分选前及分选过程中,必须进行严格无菌操作,机器需要经过酒
精冲洗,无菌PBS 冲洗的过程。
5.2 分选细胞的上机操作程序
5.2.1 上机分选前准备
第七章 流式细胞分析分选术
53
1)无菌分选
分选前夜FACS 仪器间需紫外照射过夜,收集管预先用4%BSA 包埋(4
℃至少1 小时) 分选前冲洗机器程序:1. 将上样管换成75%酒精,鞘液
桶中换成3L 75%酒精冲洗,至3L 酒精完全跑完; 2. 倒去鞘液桶中残余的酒精,
用无菌PBS 冲洗鞘液桶使酒精彻底去除,加无菌PBS 至鞘液桶满,同时上样管
中换成无菌PBS,冲洗,使每个收集管收集液体约20ml 左右,即可上机分选。
2)非无菌分选
如果不需要无菌分选,可仅用少量酒精冲洗,再用PBS 冲洗至每管收集约
20ml 后即可上机分选。
5.2.2 上机分选步骤
打开cellquest 软件,先上control 样本,确定细胞获取条件,并划定需要获
取的细胞范围;在Acquire menu 菜单下,选择SortSetup,并设定SortSetup 下的
一系列参数,设定完毕,Acquire,上样分选。
注:SortSetup 下主要的参数设定如下:
SortGate 选择分选门,SortCount 选择0(连续分选),
SortMode 选择分选模式(一般使用exclusion)
~undefined须知:分选完毕后,用水冲洗,使每个收集管收集液体约20ml 左右后可停止(防
止分选管道中形成盐结晶)。继而用常规冲洗方法冲洗上样管。
5.3 相关试剂的配制
1.4%BSA 溶液:使用1×PBS 作为溶剂,每100ml 1×PBS 中加入4gBSA,充分溶
解.
2.1×PBS 溶液:采用GIBCO 1×10L D’PBS(Cat.No21600-069)配制。

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