NCBI上查找该基因的序列

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知道了基因名(即Symbol)，怎样在NCBI 上查找该基因的序列。Symbol是基因的名称，在文献是可以经常看到的，经常会提到某个基因的基因名。我们就可以用Symbol在NCBI 的Gene数据库搜索。但有一点需注意，Symbol是经常会改变的，就是说随着序列的升级，对该基因的研究更加深入，Symbol会改变。但这个基本上不会影响使用，因为NCBI仍然会保留旧的基因名。用旧的Symbol在Gene数据库搜索同样有效。

例如：查找乳腺癌突变 基因'TNRC9'的基因序列

1，进入NCBI，选择Gene数据库

2，输入TNRC9

3，结果出来的是Tox3的基因名，再细看就可以知道TNRC9是Tox3的旧Symbol

看下表：

物种 (txid) 基因ID Symbol 别名

10090 244579 Tox3 500-9|BC052044|C230068E13|CAGF9|Tnrc9

9606 27324 TOX3 CAGF9|TNRC9

可知，一个基因ID可以对应多个Symbol。

但这里需要注意，因为Gene数据库的收集的基因都是RefSeq的，所以目前的物种还不是很多。一开始是只有人类的，目前也只是一些科研中常见的物种才有。

例如：要查找绵羊的'SRY'序列。还有绵羊SRY的'HMG-BOX'序列。

这里如果通过Gene数据库是搜索不到的~

这时我们可以选择Nucleotide数据库。

1，用绵羊的英文sheep在NCBI的Taxonomy数据库，搜索绵羊的txid是多少。关于这部分，详细请查看：图文讲解：知道一个酶的英文怎么在NCBI上查找基因?

2，得到绵羊的txid=9940

3，在NCBI的Nucleotide数据库输入SRY txid9940，这个关键词的意思是只在绵羊的数据中查找SRY基因

4，结果非常明显。如：

http://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/197295704?ordinalpos=1&itool=EntrezSystem2.PEntrez.Sequence.Sequence_ResultsPanel.Sequence_RVDocSum

http://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/197295705?ordinalpos=1&itool=EntrezSystem2.PEntrez.Sequence.Sequence_ResultsPanel.Sequence_RVDocSum

5， 查找绵羊SRY的'HMG-BOX'序列，输入HMG-BOX txid9940

6，直接进入结果页面：http://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/1390