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CTAB法提取植株基因组DNA

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3101
(1)采摘健康幼叶作为提取植株基因组DNA的材料,用蒸馏水洗净,用纸吸干。
(2)取新鲜的叶片150mg置于1.5ml离心管中,使用MM301细胞破碎仪进行研磨破碎。(若样品暂时不用,应保存于-80°C)
(3)加入已预热的2×CTAB提取缓冲液700µl浸透粉末并倒转离心管,使粉末充分散开,于65℃水浴60 min,其间轻柔混合2-3次。(65°C预热CTAB,准备1000μl枪头,新离心管,镊子,厚手套,-20°C预冷异丙醇、无水乙醇)
(4)取出离心管,冷却至室温,加入700µl的氯仿/异戊醇(24/1),轻缓颠倒混匀,静置10 min。
(5)13000rpm离心10min。(离心温度不可过低,CTAB低于15°C会析出沉淀)
(6)取上清600µl转移至新离心管中,加入等体积的氯仿/异戊醇(24/1),轻缓颠倒混匀,室温放置10min。(取上清时一定要小心,不可将杂质混入,上清不够则少提)
(7)13000rpm离心10min,取上清400µl转移至新离心管中,加等体积已预冷的异丙醇,保存于-20℃,静置20 min。
(8) 13000rpm离心10min,将离心管倒置于吸水纸上,控干上清,用600µl 70%的乙醇洗涤沉淀2次,室温下微干。加入300µl去离子水溶解沉淀。(沉淀一定要充分溶解,可用枪头将沉淀从离心管底部弹起,放于4°C 0.5h—1.0h)
(9) 加入1µl RNase(10mg/ml)置于37℃水浴60 min,每个离心管加300µl去离子水,加入等体积的氯仿/异戊醇抽提2次。(此步抽提很重要,一定要避免分离层中的白色薄膜吸入枪头,否则所得到的DNA中会含杂质而呈现乳白色)
(10) 吸取上清400µl 转入新离心管,加入上清体积1/10的3mol/LNaAC溶液,2.5倍体积的预冷无水乙醇沉淀DNA,置于-20℃,20 min左右,12000rpm离心10min,弃上清。(此时沉淀的DNA应为无色胶状)
(11)用600ul 70%的乙醇洗涤沉淀2次,通风干燥或者自然干燥。(若DNA为无色,用乙醇洗涤时应小心,以免将DNA倒出;可用小号枪头将部分乙醇吸出后再自然干燥,以便加快干燥速度)
(12)加入30µl TE缓冲液溶解DNA,4℃保存备用。(-20°C长期保存)
 
所需溶液的配制
(1)0.5mol/L EDTA溶液
400mlddH 2 O中加入93.05g Na 2 EDTA,完全溶解后使用NaOH调节至PH=8.0,加ddH 2 O定容至500ml。(4°C保存)
(2)1mol/L Tris·Cl溶液
400mlddH 2 O中加入60.50g Tris,完全溶解后使用浓盐酸调节至PH=8.0,加ddH 2 O定容至500ml。(4°C保存)
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