植物DNA的提取与纯化
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一、实验目的:
了解植物DNA提取和纯化的一般方法。
二、实验原理 :
天然状态的DNA 是以脱氧核糖核蛋白(DNP)形式存在于细胞核中。要从细胞中提取DNA时,先把DNP抽提出来,再把蛋白质和糖去除,同时除去RNA及无机离子等,从中分离DNA。提取植物DNA的方法主要采用SDS和CTAB法。两种方法均采用去污剂裂解细胞并保护DNA不受内源核酸内切酶降解。具体方法简单说来就是利用液氮对植物组织进行研磨,从而破碎细胞。细胞提取液中含有的SDS溶解膜蛋白而破坏细胞膜,使蛋白质变性而沉淀下来。EDTA抑制DNA酶的活性。再用酚、氯仿抽提的方法去除蛋白,得到的DNA溶液经乙醇沉淀。
SDS法:SDS是有效的阴离子去垢剂,细胞中DNA与蛋白质之间 常借静电引力或配位键结合,SDS能够破坏这种价键。CTAB法:CTAB是一种阳离子去垢剂,它可以溶解膜与脂膜,使细胞中的DNA-蛋白质复合物释放出来,并使蛋白质变性,使DNA与蛋白质分离。这里我们使用SDS法。
DNA纯化:蛋白质常用苯酚:氯仿:异戊醇(25:24:1)或氯仿:异戊醇(24:1)抽提。RNA 常选用RNase消化 ,或是用LiCl来消除大分子的RNA。酚类物质 提取液中加少量巯基乙醇,选取幼嫩的材料。多糖提取液中加1%PVP。
三、实验材料与 仪器 :
植物叶子,DNA提取缓冲液,24:1/氯仿:戊醇,其它 试剂 :液氮、TE缓冲液、无水乙醇、70%乙醇,研钵,水浴锅,离心机,移液器等。
四、实验步骤:
1.取新鲜叶片约3g, 剪碎, 加入液氮充分研磨后转移至2ml离心管中;
2.在65℃预热的提取液中按3.8g/L加入Na Bisufite, 混匀并调pH至8.0;
3.在管中加入适量提取液,60℃水浴保温约30min,不时颠倒混匀;
4.冷却至室温后加入等体积氯仿/异戊醇,用力摇匀后,放置摇床上摇15分钟左右;
5.室温下10000rpm离心15min,小心吸上清于新的离心管中,加入两倍体积的冷酒精-20 ℃放置1h或过夜;
6.挑出DNA置于新的管中,挑出有困难时可以低速离心后倒去上清。加入适量70%酒精,摇动洗涤10min,重复洗涤2-3次;
7.吹干DNA,加入适量TE在65℃溶解,完全溶解后离心去除杂质;
8.加入RNase(10mg/mL),室温处理0.5-1h,除去RNA,4℃或-20℃贮存。
9.如需纯化DNA,再加入适量TE,氯仿/异戊醇多次抽提后吸取上清,加入3ml/L NaAc和两倍体积的乙醇,-20 ℃放置1h或过夜;
10.吹干沉淀后,加入适量TE, 65℃溶解, 4℃或-20℃贮存。
了解植物DNA提取和纯化的一般方法。
二、实验原理 :
天然状态的DNA 是以脱氧核糖核蛋白(DNP)形式存在于细胞核中。要从细胞中提取DNA时,先把DNP抽提出来,再把蛋白质和糖去除,同时除去RNA及无机离子等,从中分离DNA。提取植物DNA的方法主要采用SDS和CTAB法。两种方法均采用去污剂裂解细胞并保护DNA不受内源核酸内切酶降解。具体方法简单说来就是利用液氮对植物组织进行研磨,从而破碎细胞。细胞提取液中含有的SDS溶解膜蛋白而破坏细胞膜,使蛋白质变性而沉淀下来。EDTA抑制DNA酶的活性。再用酚、氯仿抽提的方法去除蛋白,得到的DNA溶液经乙醇沉淀。
SDS法:SDS是有效的阴离子去垢剂,细胞中DNA与蛋白质之间 常借静电引力或配位键结合,SDS能够破坏这种价键。CTAB法:CTAB是一种阳离子去垢剂,它可以溶解膜与脂膜,使细胞中的DNA-蛋白质复合物释放出来,并使蛋白质变性,使DNA与蛋白质分离。这里我们使用SDS法。
DNA纯化:蛋白质常用苯酚:氯仿:异戊醇(25:24:1)或氯仿:异戊醇(24:1)抽提。RNA 常选用RNase消化 ,或是用LiCl来消除大分子的RNA。酚类物质 提取液中加少量巯基乙醇,选取幼嫩的材料。多糖提取液中加1%PVP。
三、实验材料与 仪器 :
植物叶子,DNA提取缓冲液,24:1/氯仿:戊醇,其它 试剂 :液氮、TE缓冲液、无水乙醇、70%乙醇,研钵,水浴锅,离心机,移液器等。
四、实验步骤:
1.取新鲜叶片约3g, 剪碎, 加入液氮充分研磨后转移至2ml离心管中;
2.在65℃预热的提取液中按3.8g/L加入Na Bisufite, 混匀并调pH至8.0;
3.在管中加入适量提取液,60℃水浴保温约30min,不时颠倒混匀;
4.冷却至室温后加入等体积氯仿/异戊醇,用力摇匀后,放置摇床上摇15分钟左右;
5.室温下10000rpm离心15min,小心吸上清于新的离心管中,加入两倍体积的冷酒精-20 ℃放置1h或过夜;
6.挑出DNA置于新的管中,挑出有困难时可以低速离心后倒去上清。加入适量70%酒精,摇动洗涤10min,重复洗涤2-3次;
7.吹干DNA,加入适量TE在65℃溶解,完全溶解后离心去除杂质;
8.加入RNase(10mg/mL),室温处理0.5-1h,除去RNA,4℃或-20℃贮存。
9.如需纯化DNA,再加入适量TE,氯仿/异戊醇多次抽提后吸取上清,加入3ml/L NaAc和两倍体积的乙醇,-20 ℃放置1h或过夜;
10.吹干沉淀后,加入适量TE, 65℃溶解, 4℃或-20℃贮存。