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基因芯片分析生物信息学

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基因芯片分析生物信息学
 
    基因 芯片或基因微阵列是将很多(数千或数万个)寡核苷酸或DNA作为探针,密集排列于玻片等固相支持物上,将待分析样品标记与微点阵杂交并进行检测。
 
    根据杂交信号强弱及探针位置和序列,可以确定靶DNA的表达情况以及突变和多态性存在与否等。芯片技术的突出特点是高度并行性、高通量、微型化和自动化等,被广泛用于基因转录情况分析、不同基因型细胞的表型分析以及基因诊断、药物设计等领域。
 
    在微阵列研究的各个方面计算机起核心作用。电子图书馆可以查阅微阵列文献,含基因和蛋白质、结构及基因组信息的生物学数据库。这些文献和数据库可用于进行同源性分析、序列突变的鉴定及进化研究。序列信息可用于熔点计算,序列比对和设计寡核苷酸靶分子、探针及PCR引物。
 
    计算机也能为微阵列提供信息学手段,包括微阵列的定位和定性空间,测定基因数量和复杂性,形成样品及内容图谱。信息学手段也能用于数据定量,使研究者能计算绝对表达水平,分析与正常资料的比例关系。数据挖掘手段和建立的模型力n,陕了数据转换、数据的可视化、表达图的形成。
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