蛋白质抗原加工提呈的两条主要途径
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T细胞能识别APC表面由MHC分子提交的抗原肽，依赖于APC对蛋白质抗原进行处理和加工，并将抗原肽展示于细胞表面供TCR识别，称为抗原的加工提呈。
抗原加工与提呈分为针对外源性抗原和针对内源性抗原两条主要的途径。需要说明的是，内源性抗原并非自身抗原的同义词，外源性抗原也不等于非己抗原。内源性和外源性抗原的区分是根据它们在进入加工途径前所处的位置，即位于细胞内还是细胞外。因此，自身蛋白质，如可溶性MHC分子或细胞膜结合的蛋白分子，如被APC摄人后进入内体加工，即为外源性抗原。反之，在宿主细胞质中产生的病毒蛋白和胞内感染的病原体等虽属非己蛋白，但由于存在于胞质内也称为内源性抗原。
外源性抗原和内源性抗原在细胞内加工的部位、所结合MHC分子的种类，以及与MHC分子发生结合的区室并不相同。加工过程中涉及的酶、胞内转运中所需的信号或伴随蛋白等也是不同的。
下表比较了两种抗原加工提呈途径的特点
