RNA相关名词

1.RNAi：

近年来的研究表明,一些小的双链RNA可以高效、特异的阻断体内特定基因表达，促使mRNA降解，诱使细胞表现出特定基因缺失的表型，称为RNA干扰（RNA interference，RNAi，也译作RNA干预或者干涉）。它也是体内抵御外在感染的一种重要保护机制。

2.siRNA：

siRNA（small interfering RNAs）是一种短片断双链RNA分子，能够以同源互补序列的mRNA为靶目标降解特定的mRNA，这个过程就是RNA干扰途径（RNA interference pathway）。

3.RISC：

在RNAi效应阶段，siRNA双链结合一个核酶复合物从而形成所谓RNA诱导沉默复合物（RNA-induced silencing complex, or RISC）。激活RISC需要一个ATP依赖的将siRNA解双链的过程。激活的RISC通过碱基配对定位到同源mRNA转录本上，并在距离siRNA3'端12个碱基的位置切割mRNA(3, 18, 27, 29)。尽管切割的精确机制现在还是未知，研究表明每个RISC都包含一个siRNA和一个不同于Dicer的RNA酶。

4.Dicer：

Dicer的酶，是RNaseIII家族中特异识别双链RNA的一员，能以一种ATP依赖的方式逐步（processive）切割由外源导入或者由转基因、病毒感染等各种方式引入的双链RNA，切割将RNA降解为19―21bp的双链RNAs(siRNAs)，每个片断的3'端都有2个碱基突出(27, 28)。

5.PTGS：

Post-transcriptional Gene Silencing (PTGS) 部分的植物中的基因沉默是在转录后发生的，称为post-transcriptional gene silencing。它是相对于部分植物中发生的转录阶段的基因沉默（PGS）而言的。

6.基因沉默：

研究结果发现有大量的转基因植株不能正常表达，通常这并不是由于转基因的缺失或突变引起的，而是基因失活的结果.这种失活的现象称为基因沉默。

7.RNA transfection：

即RNA转染。

8.Sense RNA：

正义RNA。

9.Antisense RNA：

反义RNA。

10.19+2+2 nt siRNA：

在细胞中双链RNA一般都被切割成21-23小片段，这样的RNA片段能达到更好的RNAi作用。人工合成的siRNA也是依据这个原理，所合成的RNA就是19nt的碱基序列再加上两端的识别序列如-GG，-TT等。

11.BLAST：

Basic Local Alignment Search Tool，基本的基于局部对准的搜索工具；一种快速查找与给定序列具有连续相同片断的序列的技术。

12.Entrez：

美国国家生物技术信息中心所提供的在线资源检索器。该资源将GenBank序列与其原始文献出处链接在一起。

13.NCBI：

美国国立生物技术信息中心（National Center for Biotechnology Information），为美国国家医学图书馆（NLM）和国家健康协会（NIH）下属部门之一，1988年设立。主要提供生物医学领域的信息学服务，如世界三大核酸数据库之一的GenBank数据库，PubMed医学文献检索数据库等。

14.GenBank：

GenBank 是 NIH 的基因序列数据库，是所有公开的DNA序列的集合 ( Nucleic Acids Research 1998 Jan 1;26(1):1-7). 截至1998年12月，GenBank大约收集了 2,162,000,000 个碱基、3,044,000 个序列。

15.DUST：

A program for filtering low complexity regions from nucleic acid sequences。

16.Ribosomal RNA：

核糖体RNA，简写为rRNA。是一组存在于核糖体中的RNA分子。

17.UniGene：

美国国家生物技术信息中心提供的公用数据库，该数据库将GenBank中属于同一条基因的所有片断拼接成完整的基因进行收录。