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光敏生物素试剂盒杂交实验

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实验试剂

 

硫酸葡聚糖钠盐(可不用)、聚乙烯吡赂啉酮(PVP)、聚蔗糖、牛血清白蛋白(BSA)、100mM EDTA、3MnaAC、无水乙醇、电泳缓冲液、切变性鲱鱼精DNA(100ug/ml)

20×SSC溶液    氯化钠    3M    预杂交液 6×SSC 

柠檬酸三钠  0.3M       (含100ug/ul变性鲱鱼精DNA)

                pH 7.0                  5×Denhardt's 溶液

                                         0.5%SDS  

变性液  0.5M NaOH                   中和液  1M Tris-HCl   pH 7.4

         1.5M NaCl                           1.5M NaCl

封闭液  3gBSA溶于70ml水中,浓盐酸调pH至3.0,煮沸20分钟后,冷至室温,NaOH调pH至7.5,加入10ml以下缓冲液(1M Tris-HCl  pH7.5,MgCl2 0.19%,NaCL 5.8%,Triton X-100  0.05ml)定容至100ml

50×Denhardt's 溶液   1%PVP    1M PBS  NaCl    0.8%   pH  7.4

                         1%BSA             KCl     0.02%

                         1%聚蔗糖          Na2 HPO4 0.144%

                                           KH2 PO4   0.024%

洗涤液 

A: 2×SSC,250ml中含0.1%SDS       B:0.1×SSC,250ml中含0.1%SDS

C:Tris-HCl     100mM pH 7.5      D:Tris-HCl      100mM

     NaCl           1M                 NaCl          0.5M

     MgCl2          2mM                Tween 20      0.5% pH 7.5

     Triton X-100  0.05%

亲和素-碱性磷酸酶溶液     Tris-HCl     100mM

                           NaCl           1M

                           MgCl2          2mM

                           Triton X-100  0.05%

                           pH 7.5

                           碱性磷酸酶    2-3单位/ml

底物溶液     Tris-HCl     100mM      pH 9.5    终止液

             NaCl         100mM               Tris-HCl    10mM

             MgCl2           5mM                 EDTA       1mM

实验设备

 

分子杂交仪、摇床、 烤箱、取液器、电泳仪、电泳槽

实验步骤

 

1. 转膜

   1) 电泳

   2) 切胶   在紫外下,切取凝胶有条带部分

   3) 脱嘌啉0.25NHCl浸泡凝胶10分钟,蒸馏水洗胶(大于15kb的DNA片段转移时做此步骤)

   4) 变性,变性液(0.5MNaOH、1.5MNaCl)浸泡凝胶2次,每次15分钟,蒸馏水洗胶

   5) 中和,中和液(0.5MTris-HCl,pH7.0、3MNACl)浸泡凝胶2次,每次15分钟,蒸馏水洗胶

   6) 平衡,凝胶在20×SSC中室温平衡10分钟

   7) 转膜,取一塑料盒,将一干净玻璃板横架于盒上,盒中倒入10×SSC,作为转移缓冲液,将2张大小合适的滤纸用20×SSC溶液浸湿,放置于玻璃板上,作为滤纸桥

将处理好的凝胶切去多余部分并切下一角作标记,胶面反转放置于滤纸桥上,四周用Parafilm膜封闭,以防短路

剪取一块面积稍大于凝胶的硝酸纤维素膜(NC膜),以2×SSC溶液浸湿后置于凝胶上

剪取2块相应大小的滤纸,以2×SSC溶液浸湿后置于NC膜上

(滤纸、凝胶、NC膜、滤纸间都不能有气泡)

滤纸上面放一叠吸水纸,上面压一块玻璃板,再压上500g左右的重物,转移过夜

   8) 烤膜,转移结束后,NC膜在与凝胶切角相对处,用铅笔做记号,用6×SSC溶液室温漂洗5分钟,以充分洗去沾上的凝胶成分,吸水纸吸干残余液体,室温晾干,NC膜用滤纸夹裹好,80℃烤膜2小时

   9) 烤干的NC膜用2×SSC浸润。

2. 杂交

   1) 封闭,将杂交好的NC膜用滤纸吸干,放入一新杂交袋中,用封闭液42℃封闭2-4小时(封闭液用量为4ml/50cm2 膜)。

   2) 预杂交,将上部浸润的NC膜装入杂交袋,加入预杂交液(0.2ml/cm2 膜),使膜与预杂交液充分混匀,赶走汽泡,封口。65℃2-4小时。  

   3) 杂交,倾出预杂交液,加入杂交液(预杂交液+临用前变性的标记好探针,终浓度为1-2ng/ml)(0.2ml/cm2 膜),65℃过夜。

   4) 洗膜,用洗涤液A,B分别洗膜两次,每次洗膜液体积不少于250ml。

   5) 反应,弃去封闭液,加入亲和素-碱性磷酸酶溶液,室温避光反应15分钟,轻轻震荡。取出膜,用洗涤液C,D分别洗涤三次,每次洗涤体积不应少于300ml,每次5分钟,振荡。

   6) 显色,将膜转入新袋中,加入底物溶液(用量为4ml/50cm2 膜)。封袋,避光放置,显色数分钟至数小时,以杂交带清晰,背景低为好。

注意事项

 

1. 在7操作中每层间应确保无汽泡存在。

2. 操作中吸水纸的大小应小于顶层滤纸,且不能于滤纸下的任何一层接触。

3. 烤片的作用在于使已转移条带更牢地结合于NC膜上。

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