光敏生物素试剂盒杂交实验
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实验试剂
硫酸葡聚糖钠盐(可不用)、聚乙烯吡赂啉酮(PVP)、聚蔗糖、牛血清白蛋白(BSA)、100mM EDTA、3MnaAC、无水乙醇、电泳缓冲液、切变性鲱鱼精DNA(100ug/ml)
柠檬酸三钠 0.3M (含100ug/ul变性鲱鱼精DNA)
变性液 0.5M NaOH 中和液 1M Tris-HCl pH 7.4
50×Denhardt's 溶液 1%PVP 1M PBS NaCl 0.8% pH 7.4
A: 2×SSC,250ml中含0.1%SDS B:0.1×SSC,250ml中含0.1%SDS
C:Tris-HCl 100mM pH 7.5 D:Tris-HCl 100mM
MgCl2 2mM Tween 20 0.5% pH 7.5
底物溶液 Tris-HCl 100mM pH 9.5 终止液
实验设备
实验步骤
3) 脱嘌啉0.25NHCl浸泡凝胶10分钟,蒸馏水洗胶(大于15kb的DNA片段转移时做此步骤)
4) 变性,变性液(0.5MNaOH、1.5MNaCl)浸泡凝胶2次,每次15分钟,蒸馏水洗胶
5) 中和,中和液(0.5MTris-HCl,pH7.0、3MNACl)浸泡凝胶2次,每次15分钟,蒸馏水洗胶
7) 转膜,取一塑料盒,将一干净玻璃板横架于盒上,盒中倒入10×SSC,作为转移缓冲液,将2张大小合适的滤纸用20×SSC溶液浸湿,放置于玻璃板上,作为滤纸桥
将处理好的凝胶切去多余部分并切下一角作标记,胶面反转放置于滤纸桥上,四周用Parafilm膜封闭,以防短路
剪取一块面积稍大于凝胶的硝酸纤维素膜(NC膜),以2×SSC溶液浸湿后置于凝胶上
滤纸上面放一叠吸水纸,上面压一块玻璃板,再压上500g左右的重物,转移过夜
8) 烤膜,转移结束后,NC膜在与凝胶切角相对处,用铅笔做记号,用6×SSC溶液室温漂洗5分钟,以充分洗去沾上的凝胶成分,吸水纸吸干残余液体,室温晾干,NC膜用滤纸夹裹好,80℃烤膜2小时
1) 封闭,将杂交好的NC膜用滤纸吸干,放入一新杂交袋中,用封闭液42℃封闭2-4小时(封闭液用量为4ml/50cm2 膜)。
2) 预杂交,将上部浸润的NC膜装入杂交袋,加入预杂交液(0.2ml/cm2 膜),使膜与预杂交液充分混匀,赶走汽泡,封口。65℃2-4小时。
3) 杂交,倾出预杂交液,加入杂交液(预杂交液+临用前变性的标记好探针,终浓度为1-2ng/ml)(0.2ml/cm2 膜),65℃过夜。
4) 洗膜,用洗涤液A,B分别洗膜两次,每次洗膜液体积不少于250ml。
5) 反应,弃去封闭液,加入亲和素-碱性磷酸酶溶液,室温避光反应15分钟,轻轻震荡。取出膜,用洗涤液C,D分别洗涤三次,每次洗涤体积不应少于300ml,每次5分钟,振荡。
6) 显色,将膜转入新袋中,加入底物溶液(用量为4ml/50cm2 膜)。封袋,避光放置,显色数分钟至数小时,以杂交带清晰,背景低为好。
注意事项