【分享】细胞总RNA抽提的体会-申请加分
丁香园论坛
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自己整理的protocol,希望对大家有所帮助!
Preparations:
1. 高压2遍的物品及试剂:Ep管[大、中、小]
移液枪头[大、中、小]
0.1%DEPC[sigma]水—v/v, 室温静置过夜-高压2遍(大Ep管分装 后冻与-20℃)
2. 试剂:Trizol[invitrogen](4度)
100%无水乙醇(生产日期近,越久的挥发越多;及时盖盖)
氯仿(三氯甲烷CH3Cl3)
异丙醇
3. 其它:手套【需要勤换-防止RNA酶降解RNA】;口罩;冰盒;刮匙。半小时前启动4度离心机。基本是室温操作。
Protocol:
1. 收细胞:冰上操作。冷PBS洗皿2-3次,倾斜空净余液,加入Trizol(大皿加1ml,小皿加300ul),然后冻于-80度。
2. 4度解冻samples。(不超声;解冻本身就是裂解过程)。
3. 分相(3-4)。 加氯仿---每个Ep管内加入的体积为该管内Trizol量的1/5。剧烈振荡15s-30s,室温静置15-30min,中间加一次振荡。
4. 离心:12000g,15min,4度(一定要慢减速,下同)。分三层:上—水相含RNA;中—白色含pro.和DNA;下—同中,以及红色苯酚、氯仿。
5. 沉淀(5-6)。小心吸取上层水相至另一新Ep管,加入等体积(原Trizol量的1/2)的异丙醇,颠倒混匀,室温静置5-10min。
6. 离心:12000g,10min,4度。管底可见白色沉淀。
7. 洗涤(7-9)。倒弃上清(注意沉淀不要被带出),加入75%-80%乙醇(v/v用DEPC水现用现配;先加DEPC水,再加无水乙醇-乙醇易挥发)吹打洗涤(每1mlTrizol加1ml的75%乙醇)。
8. 离心:7500g,5min,4度。
9. 倒弃上清,重复7、8。
10. 干燥:通风厨内,室温下5-10min。不能彻底干燥。
11. 稀释:逐步小量DEPC水稀释沉淀,至完全溶解,一定要均一。置于冰上,不用则冻于-80度。
此种方法是改进了RNA提取过程的细节过程,最终提取到的RNA的OD260/OD280一般都能保存在1.8左右。
Preparations:
1. 高压2遍的物品及试剂:Ep管[大、中、小]
移液枪头[大、中、小]
0.1%DEPC[sigma]水—v/v, 室温静置过夜-高压2遍(大Ep管分装 后冻与-20℃)
2. 试剂:Trizol[invitrogen](4度)
100%无水乙醇(生产日期近,越久的挥发越多;及时盖盖)
氯仿(三氯甲烷CH3Cl3)
异丙醇
3. 其它:手套【需要勤换-防止RNA酶降解RNA】;口罩;冰盒;刮匙。半小时前启动4度离心机。基本是室温操作。
Protocol:
1. 收细胞:冰上操作。冷PBS洗皿2-3次,倾斜空净余液,加入Trizol(大皿加1ml,小皿加300ul),然后冻于-80度。
2. 4度解冻samples。(不超声;解冻本身就是裂解过程)。
3. 分相(3-4)。 加氯仿---每个Ep管内加入的体积为该管内Trizol量的1/5。剧烈振荡15s-30s,室温静置15-30min,中间加一次振荡。
4. 离心:12000g,15min,4度(一定要慢减速,下同)。分三层:上—水相含RNA;中—白色含pro.和DNA;下—同中,以及红色苯酚、氯仿。
5. 沉淀(5-6)。小心吸取上层水相至另一新Ep管,加入等体积(原Trizol量的1/2)的异丙醇,颠倒混匀,室温静置5-10min。
6. 离心:12000g,10min,4度。管底可见白色沉淀。
7. 洗涤(7-9)。倒弃上清(注意沉淀不要被带出),加入75%-80%乙醇(v/v用DEPC水现用现配;先加DEPC水,再加无水乙醇-乙醇易挥发)吹打洗涤(每1mlTrizol加1ml的75%乙醇)。
8. 离心:7500g,5min,4度。
9. 倒弃上清,重复7、8。
10. 干燥:通风厨内,室温下5-10min。不能彻底干燥。
11. 稀释:逐步小量DEPC水稀释沉淀,至完全溶解,一定要均一。置于冰上,不用则冻于-80度。
此种方法是改进了RNA提取过程的细节过程,最终提取到的RNA的OD260/OD280一般都能保存在1.8左右。