材料与仪器
细胞
RNA 提取缓冲液 变性液 水饱和酚
培养皿 Falcon 2063 管
RNA 提取缓冲液 变性液 水饱和酚
培养皿 Falcon 2063 管
步骤
1. 取 1 个细胞已长满的 100 ml 培养皿,吸出培养液,加 2 ml RNA 提取缓冲液,用橡胶刮棒刮下细胞。
RNA 提取缓冲液:
变性液,20 ml
β-巯基乙醇,0.144 ml
2 mol/L 乙酸钠,pH 4,2 ml
水饱和酚,22 ml
可避光保存在 4℃ 2~3 个月。
变性液:
4 mol/L 硫氰酸胍:250 g 硫氰酸胍
25 mmol/L 柠檬酸钠:17.6 ml 0.75 mol/L 柠檬酸钠,pH 7
0.5% 十二烷基肌氨酸钠(Sarkoayl):26.4 ml 10% 十二烷基肌氨酸钠,293 ml H2O
混合各组分,在 65℃ 搅拌溶解。可以在室温保存 3 个月。
水饱和酚:
用在水浴中加热到 65℃ 的灭菌水来溶解酚。从水浴取出后使冷却到 4℃。加足量水以维持水相(上相)。可在 4℃ 避光保存 2~3 个月。
2. 细胞裂解物转移到一个 Falcon 2063 管中,加 200 μl 氯仿,混合均匀。
3. 细胞冰浴 15 分钟。
4. 细胞裂解物在 4℃ 以 5000 g 离心 30 分钟。
5. 转移水(上)相,注意不要搅动交界面,水相放到一个干净的 Falcon 2063 管中并加入 1 ml 异丙醇(仅用于 RNA 工作的溶液)。
6. 管子在 -20℃ 放至少 1 小时或过夜。
7. 用固定角度的转头在 4℃ 以 8000 g 离心 30 分钟沉淀 RNA,小心去掉上清。
8. 加 1 ml 70% 乙醇洗白色沉淀物并在以 8000 g 离心 15 分钟。洗 3 次,不要振摇。
9. 最后一次 70% 乙醇洗涤后,去掉乙醇并稍稍离心管子收集残液。吸掉剩下的乙醇。
10. 短时间干燥沉淀。空气干燥约 30 分钟或在真空干燥器中 2~3 分钟。
11. 用 50~100 μl DEPC 处理过的水重悬 RNA,测量 1:100 稀释的样品的光密度(OD260)来计算浓度。
浓度(μg/ml)=(稀释度)[(40 μg/ml·OD260)](样品的 OD260)
12. 重悬的 RNA 贮存在 -70℃。
RNA 提取缓冲液:
变性液,20 ml
β-巯基乙醇,0.144 ml
2 mol/L 乙酸钠,pH 4,2 ml
水饱和酚,22 ml
可避光保存在 4℃ 2~3 个月。
变性液:
4 mol/L 硫氰酸胍:250 g 硫氰酸胍
25 mmol/L 柠檬酸钠:17.6 ml 0.75 mol/L 柠檬酸钠,pH 7
0.5% 十二烷基肌氨酸钠(Sarkoayl):26.4 ml 10% 十二烷基肌氨酸钠,293 ml H2O
混合各组分,在 65℃ 搅拌溶解。可以在室温保存 3 个月。
水饱和酚:
用在水浴中加热到 65℃ 的灭菌水来溶解酚。从水浴取出后使冷却到 4℃。加足量水以维持水相(上相)。可在 4℃ 避光保存 2~3 个月。
2. 细胞裂解物转移到一个 Falcon 2063 管中,加 200 μl 氯仿,混合均匀。
3. 细胞冰浴 15 分钟。
4. 细胞裂解物在 4℃ 以 5000 g 离心 30 分钟。
5. 转移水(上)相,注意不要搅动交界面,水相放到一个干净的 Falcon 2063 管中并加入 1 ml 异丙醇(仅用于 RNA 工作的溶液)。
6. 管子在 -20℃ 放至少 1 小时或过夜。
7. 用固定角度的转头在 4℃ 以 8000 g 离心 30 分钟沉淀 RNA,小心去掉上清。
8. 加 1 ml 70% 乙醇洗白色沉淀物并在以 8000 g 离心 15 分钟。洗 3 次,不要振摇。
9. 最后一次 70% 乙醇洗涤后,去掉乙醇并稍稍离心管子收集残液。吸掉剩下的乙醇。
10. 短时间干燥沉淀。空气干燥约 30 分钟或在真空干燥器中 2~3 分钟。
11. 用 50~100 μl DEPC 处理过的水重悬 RNA,测量 1:100 稀释的样品的光密度(OD260)来计算浓度。
浓度(μg/ml)=(稀释度)[(40 μg/ml·OD260)](样品的 OD260)
12. 重悬的 RNA 贮存在 -70℃。
来源:丁香实验