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穷人的劳斯莱斯-我的五年western blot体会

丁香实验

1931

1.抗体的选择


对于国内的大多数实验室来讲,做 western blot 实验选择抗体是个头疼的问题。原因很简单,买进口抗体捉襟见肘,买国产抗体得需要大无畏的勇气,对于我所在的兰州地区的实验者而言,感触尤深。在这五年的western blot 实验历程里,我先后用过进口抗体,进口抗体国内分装包装,国产抗体,质量良莠不齐。

进口抗体一般不会出现闪失:abcam 品种全,质量过硬,但价高(3400 元/100 微升),而且说是 100 微升,但至多能吸出来 90 微升;Sigma 的价最贵;比较有性价比的是 CST 的抗体,现在好像是2200 元/100 微升,我前后用过二十几种, 1:1000 的稀释比下,还没有失过手,100微升通常能完成所有的免疫组化和 western blot 实验,还有一个优点是通常量比 100 微升多出来 10 微升,唯一的不足是 CST的品种实在不多。Santa 的多克隆抗体质量可以,但是选用 Santa 的单抗还是有风险,估计这也是业界共识了吧。

进口抗体国内分装包装我也用过不少,呵呵,毕竟是穷人(420 元/ 100微升),大概好抗体的比例约为 50%,如果能做出来,也存在一个问题,就是抗体大多只能用一次。我曾经把Santa的原装抗体和分装抗体做过比对(抗体品种,货号等完全一致),在都能做出来的前提下,原装抗体能重复使用的次数要多出许多。

具体原因我已经揣测了好几年,不敢说出来,我一直在想是不是冬天西瓜切成牙和整个卖,也会有所不同。揣测归揣测,假如只为了发论文毕业走人,可以考虑选用进口分装的多克隆抗体。

国产抗体比较知名的就几家,但质量确实不敢恭维。western blot能做出来的确实不多,而且杂带多,背景不干净。我们周边的实验室大多买国产抗体做免疫组化,怎么说呢,应付硕士论文够了。

我也帮别人自制过抗体,再用抗原亲和纯化。效价非常不错,夸张的时候 1:10000 都能做出条带,唯一的麻烦是兔子太骚(骚臭),不知道这是不是“兔女郎”名号的来由。如果读书非常悠闲,老板又特别想拥有手工作坊的情况下,可以自己伺候折腾兔子来玩玩,刚开始的时候还是蛮有成就感的。只是单凭抗原表达和制备多抗,是不是可以写成论文毕业,估计因校而异了。

2.Western Blot设备

目前最好的垂直槽和转移槽还是 Biorad(伯乐),尤其是 MINI3 好用,MINI4 可以一次跑四块胶,但通常用不上,由此造成垂直缓冲液的浪费,而且 MINI4 用绿色塑料夹住玻璃板来组成内槽,容易漏液,塑料夹应该是有疲劳寿命的,估计日子一长,弹性就会改变,所以如果你们实验室刚买了 MINI4,赶紧用,遭殃的肯定是某一级的师弟师妹们。

Biorad 的一套系统得两万多,西部能玩得起伯乐的还真不多。好在咱中国人聪明,上海天能的外观和构造和伯乐的 MINI3 几乎一模一样,而且可以通用,不带电泳仪是 5 千多一套,挺好用的。唯一的不足是塑料寿命不如伯乐,胶架容易断裂。

不过仔细算算,三套天能也就是一套伯乐的价格,值了。北京六一的垂直槽很转移槽很好用,但垂直槽配胶不方便,玻板太厚,散热不好,但能用,六一的电泳仪(电源)还是很好用的。


3. Western Blot实验条件

Western Blot 实验条件我基本是按 ABCAM 公司经典教材做的,具体的试剂配方我是按宝生物试剂册的附录部分配制。丙烯酰胺和甲叉我是从北京华美买的德国 biomol 原装货,配出来的胶可以提在手里玩,弹性非常好,价格比 sigma 的便宜许多,1 公斤好像是 480 多人民币,够实验室用好长时间,现在我们实验室做双向电泳都用 biomol 的胶,很好用。Marker 我现在用 fermantas 的 SM1811,2 微升就很清晰了,兰州的代理是上海生工。

要强调的是垂直电泳缓冲液千万不能回收用,具体愿因你只需上网查查SDS-PAGE 的原理就知道了。转移电泳缓冲液可以回收再用两次。

转膜我通常是快转两百 200 毫安/ 2 小时,慢转 80 毫安/ 12 小时。快转是一定得做冰水浴,就是把槽子泡在冰水混合液里。封闭我通常用 BD 的脱脂奶粉,不归,260 元 500 克,也是从北京华美买的。ECL 我用 pierce 的,500 毫升 1650 元,比国产的还便宜好用。胶片是柯达的,以前用过乐凯的,不如柯达。我很少用丽春红或考马斯染膜或染胶。


4. Western Blot实验关键

Western Blot 操作步骤多,每一步的失误都会造成全盘失败,综合而言,抗体仍然是决定成败的关键,如果抗体很滥,就是神仙也没招。其中内参抗体很重要,因为内参抗体的选择关系到全盘实验的考评。

Actin,Tubulin,GAPDH 我都用过,Actin,Tubulin 的缺点是有时候会出现复带,比较稳定的还是 GAPDH。如果用心看看 cell,nature, science 上的文章,大多用 GAPDH 做内参。进口的,国内分装的,国产的,我都用过。

进口的最强的 1:10000 都能做出条带(Upstate,现在被 Minipore 招安了),国内分装的也好用,但就是不好回收重复使用,国产的一般只能用一次。我要特别强调的是,实验室里最贵的抗体实际上是内参抗体,因为只要 Western Blot 开工,每次都得用内参抗体,而一般目的蛋白的抗体也就用几次,重复三次就了事。

但内参抗体是不折不扣的耗材,严格意义上将,每跑一次胶,就得杂一次内参,使用频率最高决定了内参是最花钱的抗体。我也自己制备过内参抗体,但好像因为种属同源性太高,背景总是不干净。进口的好,太贵;国产的只能使用一次,年终算账,不比进口的便宜。

我自己的体会是多抗制备并不是技术含量极高的事,为什么国内企业高的早不了,低的造不好呢?现在我用的是杭州贤至的 GAPDH 兔多抗,200 微升 420 元钱,我在蛋白上样量 12 微升/孔的情况下,按 1:2000 稀释比,条带非常清晰,没有杂带,是我目前用过的最好的国产抗体,我估计按1:4000 照样能做出来,因为按按 1:2000 稀释做,在暗室里点上 ECL 后肉眼清楚地看到荧光条带。抗体我在不加叠氮化钠的情况下4度过夜杂交,可回收重复使用 5 到 6 次。

最早我是 2008 年在丁香通上看到了杭州贤至(当时名叫杭州松华)发布的广告,我就怂恿实验室主管买了2支,很好用,现在实验室都没有用完 ;2009年我的一个朋友做western,我推荐他又买了1支,做出来的效果确实好,2009 年底我到了新的实验室,western 的全套我在新实验室重新建立,啥都采购齐了,可就是买不到杭州松华的内参抗体,我上网再也找不到这个公司的网页了,没办法,只好一直噌朋友的内参抗体用。

我有个陋习,就是实验中用顺了用稳定了试剂轻易不愿意更换品牌。还好,今年 7 月份我终于找到了当年的通讯记录,一联系才知道他们改名叫杭州贤至生物科技有限公司了,呵呵,改了个名,害我找了大半年。第三次买到的 GAPDH 内参抗体,还是好用,1:2000,条带清晰,回收重复用,照样 work,截止目前,我的新导师对我采购的一堆试剂还没有不满意的,嘿嘿!草根出生,我也照样有我穷人的劳斯莱斯。

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