丁香实验_LOGO
登录
提问
我要登录
|免费注册
点赞
收藏
wx-share
分享

western blot详解,多年积累加上经验总结,觉得好就顶一下

丁香园论坛

1798
工作原理
蛋白质的电泳分离是重要的生物化学分离纯化技术之一,电泳是指带电粒子在电场作用下,向着与其电荷相反的电极移动的现象.根据所采用的支持物不同,有琼脂糖凝胶电泳,淀粉凝胶电泳,聚丙烯酰胺凝胶电泳等.其中,聚丙烯酰胺凝胶电泳(PAGE)由于无电渗作用,样品用量少(1-100μg),分辨率高,可检出10-9-10-12mol的样品,凝胶机械强度大,重复性好以及可以通过调节单体浓度或单体与交联剂的比例而得到孔径不同的凝胶等优点而受到广泛的应用.
SDS-PAGE是最常用的定性分析蛋白质的电泳方式,特别是用于蛋白质纯度检测和测定蛋白质分子量.
PAGE能有效的分离蛋白质,主要依据其分子量和电荷的差异,而SDS-PAGE(SDS变性不连续聚丙烯酰胺凝胶电泳)的分离原理则仅根据蛋白质的分子量的差异,因为SDS-PAGE的样品处理液是在要跑电泳的样品中假如含有SDS和巯基乙醇(2-ME)或二巯基赤藓醇(DTT),其可以断开半胱氨酸残基之间的二硫键,破坏蛋白质的四级结构,SDS是一种阴离子表面活性剂即去污剂,它可以断开分子内和分子间的氢键,破坏蛋白质分子的二级及三级结构,并与蛋白质的疏水部分相结合,破坏其折叠结构,电泳样品假如样品缓冲液后,要在沸水中煮3-5分钟使SDS与蛋白质充分结合形成SDS-蛋白质复合物,SDS-蛋白质复合物在强还原剂巯基乙醇存在时,蛋白质分子内的二硫键被打开而不被氧化,蛋白质也完全变性和解聚,并形成榛状结构,稳定的存在于均一的溶液中,SDS与蛋白质结合后使SDS-蛋白质复合物上带有大量的负电荷,平均每两个氨基酸残基结合一个SDS分子,这时各种蛋白质分子本身的电荷完全被SDS掩盖,远远超过其原来所带的电荷,从而使蛋白质原来所带的电荷可以忽略不计,消除了不同分子之间原有的电荷差别,其电泳迁移率主要取决于亚基分子质量的大小,这样分离出的谱带也为蛋白质的亚基.
样品处理液中通常加入溴酚蓝染料, 溴酚蓝指示剂是一个较小的分子,可以自由通过凝胶孔径,所以它显示着电泳的前沿位置,当指示剂到达凝胶底部时,即可停止电泳.
另外样品处理液中也可加入适量的甘油或蔗糖以增大溶液密度,使加样时样品溶液可以沉入样品加样槽底部.
重要参数
①聚丙烯酰胺凝胶(PAG)制备原则:由于孔径的大小取决于单体和双体丙烯酰胺在凝胶中的总浓度(T)以及双体占总浓度的百分含量即交联度(C)决定的,因而制胶之前必须首先知道这两个参数.一般可以由下述公式计算:
T%=(a+b)/undefined100%; 和 C%=a/(a+b~undefined100%
其中: a=双体(bis)的重量(g) ;b=单体(arc)的重量(g);m=溶液的体积(ml)

②当分析一个未知样品时,常常先用7.5%的标准凝胶制成4-10的梯度凝胶进行试验,以便选择理想的胶浓度.如果蛋白质的分子量已知,可参考下表选择所需凝胶浓度:

蛋白质分子量范围(Da)  适宜的凝胶浓度(%)
<104  20-30
1×104-4×104  15-20
4×104-1×105  10-15
1×105-5×105  5-10
>5×105  2-5

③分离胶:
  电泳凝胶浓度
试剂  10%  12%  15%  10%  12%  15%
H2O(ml)  4.0  3.3  2.3  5.9  4.9  3.4
30%丙烯酰胺(T: 30%,C: 3%(ml)  3.3  4.0  5.0  5.0  6.0  7.5
1.5mol/lTris.cl(PH8.8) (ml)  2.5  2.5  2.5  3.8  3.8  3.8
10%SDS(ml)  0.1  0.1  0.1  0.15  0.15  0.15
10%AP(ml)  0.1  0.1  0.1  0.15  0.15  0.15
TEMED(μl)  4  4  4  6  6  6
总体积(ml)  10  15

④浓缩胶
试剂  浓度(5%)
H2O(ml)  4  2
30%丙烯酰胺(T: 30%,C: 3%(ml)  1  0.5
1.0mol/lTris.cl(PH8.8) (ml)  1  0.5
10%SDS(μl)  80  40
10%AP(μl)  60  30
TEMED(μl)  8  4
总体积(ml)  6  3
提问
扫一扫
丁香实验小程序二维码
实验小助手
丁香实验公众号二维码
扫码领资料
反馈
TOP
打开小程序