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【求助】关于WNT通路相关的实验设计

丁香园论坛

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各位信号转导版的老师,牛人,大家好,提前祝大家端午快乐!
学生有个问题咨询下大家,

我是研一的肝胆外科的研究生,这段时间设计课题,也看了一些文献,实验室的老师建议做做肝癌的WNT通路方面的。WNT激活能够引起相关的MMP cyclinD cd44 VEGF等等相关的细胞增殖和转移的促进。我想的是设计实验阻断wnt通路,以求降低beta-catenin的水平和入核内激活相关癌基因的转录水平。然后检测胞内的磷酸化和非磷酸化的catenin的量,还有相关增殖凋亡和转移方面的蛋白或者基因的变化。选比如vegf mmp-7 bax cycling D等。然后验证性地证明阻断WNT对肝癌的治疗和预防复发有用。和实验室老师讨论了下认为也可以。

但是问题是昨天查询了一天相关抑制剂的价格,WNT的抑制因子wif,DKK,frizzled的抑制剂或者dsh的,都非常的贵,有的3千多,有的高达8千多!这对我们没有科研基金(只有公费的6千元钱。两个同学加在一起也大概1万元钱)的学生来说看来是根本不可能的了。

而其它的抑制剂,又相关实验报道,布洛芬等抗炎药能够降低肝癌的beta-catenin的水平和转位,从而抑制cyclinD和c-myc的表达,抑制细胞的增殖,文献说其作用可能与WNT有关。但说其分子机制还需要进一步证实。胃癌中也报道有同样的效果。吲哚美辛和苏林酸等在体内外均能抑制beta-catenin tcf的活性。内皮抑素说能够在WNT中促进catenin的讲解抑制cyclinD1的转录,还有就是格列卫,geleevec,选择性的酪氨酸激酶抑制剂,能够增强e-cad和catenin的结合,调整beta-catenin核内外的分布,下调beta-catenin的水平。降低tcf/lef的活性。

还有相关的中药提取物能够降低beta-catenin的水平,比如报道有槲皮素。

我应该怎么选择呢?请各位老师和大牛指教!做这条通路还是不做?选内皮抑素、格列卫、cox抑制剂这些还是?

另,在肝癌细胞中AXIN基因是突变的,大肠癌中apc是突变的,尽管有文献说在突变的大肠癌中抑制wnt通路,还是能够降低beta-catenin的水平。但在肝癌中是否会有明显
结果还是有点担心。

谢谢大家,真心向大家请教。QQ674693586
自己顶一下,希望高手前来!~
你这些经费根本做不了这些实验。
一万元钱也就够检测两三个western蛋白的。估计意义不大。
找个地方合作
也有便宜的办法可以阻断WNT通路活性的。WNT通路的最终活性取决于b-catenin/TCF4的转录活性。
1.选择RNAi下调b-catenin的表达,由于经费不多,可以找人要b-catenin的RNAi质粒,许多实验室有,可以发EMAIL找老外要。
2.找人要deltaN TCF4质粒(dominant negative of TCF4),该质粒同样可以有效阻断WNT活性。

记得做实验前,先检测一些肝癌细胞系的WNT通路的活性,有许多方法,建议看文献。选择WNT异常激活的肝癌细胞系做阻断实验,然后检测下游改变及细胞生物学改变。
印象中WNT通路在肝癌中是不是有发表啊?很长时间没关注了,建议先查文献,别做了一堆别人发表过的东西。

但愿有所帮助,祝研究顺利!
选WNT抑制剂的话,一般那几个比较好用?做WB的话,选哪几个蛋白?谢谢。

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