【求助】研究细胞膜分子下游信号转导通路的方法和思路？
丁香园论坛
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最近在做一个膜分子及其配体的相互作用，下一步想研究其激活后下游的信号转导途径，不知道大概的思路和具体的方法是什么啊？利用基因芯片和蛋白芯片吗？还是有什么其他的方法？
希望大家提供一点想法，先多谢大家了啊！
这个问题在其他版也求助过，但是不太积极，希望在这个版能够得到一个大概的思路和方法。
希望大家提供一点想法，先多谢大家了啊！
这个问题在其他版也求助过，但是不太积极，希望在这个版能够得到一个大概的思路和方法。
这类命题，JBC上每年文章甚多。采取何种研究思路，我认为
1、首先关键要整理文献，以前此类有无研究此类配体与其受体结合的研究概例？
2、如果无前例，该配体所属家族成员，有无信号通路研究的前例？
3、该配体的受体主要分布于什么细胞？这类细胞在生命活动中扮演了什么角色？这种细胞的生理特性，主要通过哪些信号通路反映出来？
4、比较经典的一个例子是干扰素与其受体结合后，引起下游信号分子的变化，包括激活抗病毒因子等。楼主可以参阅相应文献。
1、首先关键要整理文献，以前此类有无研究此类配体与其受体结合的研究概例？
2、如果无前例，该配体所属家族成员，有无信号通路研究的前例？
3、该配体的受体主要分布于什么细胞？这类细胞在生命活动中扮演了什么角色？这种细胞的生理特性，主要通过哪些信号通路反映出来？
4、比较经典的一个例子是干扰素与其受体结合后，引起下游信号分子的变化，包括激活抗病毒因子等。楼主可以参阅相应文献。
感谢版主的回答，我的意思就是如果知道了一对分子的相互作用，如果要研究这对分子相互结合（激活）后下游的分子信号传导途径，我个人在想是不是使用蛋白芯片是一个选择，不知道还有什么叫新的技术，可以进行下游细胞信号转导的初筛。
打个质谱就行
普通学生 wrote:
感谢版主的回答，我的意思就是如果知道了一对分子的相互作用，如果要研究这对分子相互结合（激活）后下游的分子信号传导途径，我个人在想是不是使用蛋白芯片是一个选择，不知道还有什么叫新的技术，可以进行下游细胞信号转导的初筛。
虽然现在的趋势流行用程序等其他非生物手段先模拟预测，但是这些结果最后都需要经过生物学手段证实，否则意义不大。
因此建议你与其去想程序上有没有什么新方法，不如听听别人的意见，看看你所说的这两种分子以前主要已经有了哪些确定的上下游作用、哪些ligand、enzyme跟它们有关系，会导致什么结果等等。
如果做不了分子水平，就先从细胞水平设计，比如subcelluar定位等等。
bigbang_0_0战友说的质谱确实是一个可行的办法，但是可能还牵涉到后续的二维电泳和氨基酸测序吧？能不能把详细的步骤稍微说一下，对这个不太了解。
LoftyMan的建议也很好，但是不知道用软件预测的大概概率是多少，我知道最后肯定是需要实验来验证，但是如果预测的出现了方向性的错误，那不是白忙吗？还有不知道LoftyMan推荐一下比较好的预测软件或者在线的数据库。
多谢楼上两位的解答。
LoftyMan的建议也很好，但是不知道用软件预测的大概概率是多少，我知道最后肯定是需要实验来验证，但是如果预测的出现了方向性的错误，那不是白忙吗？还有不知道LoftyMan推荐一下比较好的预测软件或者在线的数据库。
多谢楼上两位的解答。
普通学生 wrote:
bigbang_0_0战友说的质谱确实是一个可行的办法，但是可能还牵涉到后续的二维电泳和氨基酸测序吧？能不能把详细的步骤稍微说一下，对这个不太了解。
LoftyMan的建议也很好，但是不知道用软件预测的大概概率是多少，我知道最后肯定是需要实验来验证，但是如果预测的出现了方向性的错误，那不是白忙吗？还有不知道LoftyMan推荐一下比较好的预测软件或者在线的数据库。
多谢楼上两位的解答。
我对软件不熟悉，你可以在下面这张帖子里面跟楼主联系一下，他是学习这方面的
http://bbs.taisha.org/viewthread.php?tid=1469607&page=2#pid16864309
多谢楼上的提示。
我觉得可能还是先筛选一下常见的信号通路比较可行。
我觉得可能还是先筛选一下常见的信号通路比较可行。
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