【求助】请问各位我的发现有意义吗？
丁香园论坛
879
我在养一种细胞，分别用低糖培养液和高糖培养液，然后做RT-PCR，我扩增得这种基因在低糖得时候不能扩增出来，但是在高糖得时候能扩增出来。可能就是在低糖的时候不转录，而在高糖得时候转录。我的发现有没有意义啊？
你的发现理论上是有意义的。但是不知道你的基因到底是什么基因了，细胞到底是什么细胞了？因为如果你养的是肿瘤细胞，并且你发现的这个基因是原癌基因的话，你的这个发现就更有意义了。因为有传统的饮食疗法，就是所谓的“饥饿疗法”是对肿瘤有抑制作用的。你的发现是有意义，但是你要做起来就比较麻烦了，因为我认为其下调是一个间接作用，不是一个直接作用？
个人观点哈，欢迎大家一起参与讨论！
个人观点哈，欢迎大家一起参与讨论！
zhuoer9401 wrote:
我在养一种细胞，分别用低糖培养液和高糖培养液，然后做RT-PCR，我扩增得这种基因在低糖得时候不能扩增出来，但是在高糖得时候能扩增出来。可能就是在低糖的时候不转录，而在高糖得时候转录。我的发现有没有意义啊？
楼主应该确定该基因在低糖培养时是否真的不表达，单靠RT-PCR实验就说明其不表达是不可靠的，有时同一管的cDNA做多管常规PCR，有的有条带，有的没有，意味着人为因素在影响。建议采用其他实验进一步证明其是否真的不表达。
楼主的信息不够详细，该基因在低糖的环境不表达是否有意义或意义有多“大”无法下结论。
既然可以设计确定的引物做RT-PCR，意味着该基因不是新基因，那么可以结合该基因已有的研究，再结合低糖高糖的环境作进一步分析其不表达是否有意义。
个人认为一般细胞，尤其大多数肿瘤细胞，低糖已足够其能量供应了，高糖更有利于细胞贴壁而已，当然对于能量需求特别大的细胞就另当别论了。所以我对楼主目前检测的准确性持怀疑态度。:)
如果真实情况如你所说，期待更详细的资料供我们讨论。
PS：绝对没打击意思，一个有意义的发现也是值得“同道人”高兴的。
恩！！很有意义呀，坚持研究下去嘛！！说不定又是一个新发现呢。
还是要看这个基因到底是什么功能。如果是比较重要的基因，别人没报道过的，那比较有意义的。否则抓一把泥灭一下菌，放进细胞，然后用基因芯片一测，也能发现上百个基因发生变化的。关键是有没有意义。
kiki2009 wrote:
楼主应该确定该基因在低糖培养时是否真的不表达，单靠RT-PCR实验就说明其不表达是不可靠的，有时同一管的cDNA做多管常规PCR，有的有条带，有的没有，意味着人为因素在影响。建议采用其他实验进一步证明其是否真的不表达。
楼主的信息不够详细，该基因在低糖的环境不表达是否有意义或意义有多“大”无法下结论。
既然可以设计确定的引物做RT-PCR，意味着该基因不是新基因，那么可以结合该基因已有的研究，再结合低糖高糖的环境作进一步分析其不表达是否有意义。
个人认为一般细胞，尤其大多数肿瘤细胞，低糖已足够其能量供应了，高糖更有利于细胞贴壁而已，当然对于能量需求特别大的细胞就另当别论了。所以我对楼主目前检测的准确性持怀疑态度。:)
如果真实情况如你所说，期待更详细的资料供我们讨论。
PS：绝对没打击意思，一个有意义的发现也是值得“同道人”高兴的。
目前的肿瘤细胞培养基一般是高糖，本人做过实验，降低glucose的浓度至正常水平（具体数字我记不得了），肿瘤细胞的生长速度减慢很多
是要看这个基因到底是什么功能。如果是比较重要的基因，别人没报道过的，那比较有意义的。否则抓一把泥灭一下菌，放进细胞，然后用基因芯片一测，也能发现上百个基因发生变化的。关键是有没有意义。
这个现象是否有意义，还要看是个什么基因，如果是个呼吸/代谢/合成的基因就一般了，
当然还可能和细胞的分裂有关，是不是低糖的时候不能快速生长，细胞周期相关分子会有变化。
但是如果是个重要的信号分子，和肿瘤/细胞大小之类有关就好玩了。
当然最直接的是看看你的gene的promotor区域又没有有关糖代谢通路的TF的binding site，比如cAMP 激活的TF之类。
当然还可能和细胞的分裂有关，是不是低糖的时候不能快速生长，细胞周期相关分子会有变化。
但是如果是个重要的信号分子，和肿瘤/细胞大小之类有关就好玩了。
当然最直接的是看看你的gene的promotor区域又没有有关糖代谢通路的TF的binding site，比如cAMP 激活的TF之类。
本文由丁香园论坛提供，想了解更多有用的、有意思的前沿资讯以及酷炫的实验方法的你，都可以成为师兄的好伙伴
师兄微信号：shixiongcoming
