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【求助】请问gap-opening

丁香园论坛

2491
请教分子生物高手:
gap-opening和gap-extension是什么意思呢,怎么理解?
非常感谢!
Gap opening penalty:空格罚分设置,增加一个空格就罚相应的分值,增加这一分值会降低空格出现的频率。
Gap extension penalty:空格扩展罚分,就是根据空格的长度来罚分,增加这一分值会使空格变短,末端空格不计入罚分。

参考: http://abc.cbi.pku.edu.cn/references/zhang-zhixang-mega.pdf
非常感谢,明白了,还有个问题就是这个设置是比对的时候需要做的,如果不选是不是可以呢,是不是英文文章中需要体现出来呢?如果审稿人让提供这些细节的信息,需要如何回答呢? 再次感谢freecell,还请指教!
版主freecell留言:
我不太懂这方面知识,只是帮你google了一下。

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