【求助】如何做突变的蛋白及蛋白功能的预测
丁香园论坛
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我在做基因筛查,发现了一个突变,而且氨基酸发生改变,我想用软件预测蛋白及蛋白功能有没有改变,怎么做?谢谢指教!
我没有读过类似的文献,可以用软件来预测功能有没有改变。
在这种情况下,个人认为就该基因表达产物的典型功能,做一个对比的实验。基本就能说明问题,证明是否有义突变。
在这种情况下,个人认为就该基因表达产物的典型功能,做一个对比的实验。基本就能说明问题,证明是否有义突变。
哦,问题是我这里不能做这方面的实验,我只能想办法用软件预测!希望多多指教!
有没有这个蛋白质的三级结构?或者BLAST看看保守功能区。
看看突变是不是在活性中心,或者活性中心以外的关键位点,变构位点,亚基之间结合位点。
如果真的是有意义的突变,无论如何是需要做活性试验的 ,否则写不了文章,浪费时间。
看看突变是不是在活性中心,或者活性中心以外的关键位点,变构位点,亚基之间结合位点。
如果真的是有意义的突变,无论如何是需要做活性试验的 ,否则写不了文章,浪费时间。
用这个试试。。。。SWISS-MODEL
你可以向做过酶定向进化的人请教一下吧,我记得我读书时我们实验室有人就使用软件对蛋白结果和活性中心等研究过!
祝 好
祝 好
非常感谢大家!正在练习使用软件!不过进展很慢!
不知道“馨er”前辈现在解决这个问题没有,我也发现一个引起氨基酸改变的突变,条件有限,只能使用软件预测蛋白功能是否改变,不知道什么软件好用呢?蛋白的等电点等变化!急急!
抱歉!最终没有解决,是美国那边的老师做的预测分析,我只得到了结果。
请教“聲er”老师,人体有那么多的基因,怎么才能知道哪个基因是什么功能的啊,比如哪个基因是编码嗅觉受体的啊
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