原理
1. 人脂联素蛋白质序列的检索
（1）调用 Internet 浏览器并在其地址栏输入 Entrez 网址（http://www.ncbi.nlm.nih.gov/Entrez）；
（2）在 Search 后的选择栏中选择 protein；
（3）在输入栏输入 homo sapiens adiponectin；
（4）点击 go 后显示序列接受号及序列名称；
（5）点击序列接受号 NP_004788 （adiponectin precursor； adipose most abundant gene transcript 1 [Homo sapiens]）后显示序列详细信息；
（6）将序列转为 FASTA 格式保存（参考上述步骤使用 SRS 信息查询系统检索人脂联素蛋白质序列）；
2. 使用 BioEdit 软件对人脂联素蛋白质序列进行分子质量、氨基酸组成和疏水性等基本性质分析
打开 BioEdit 软件 → 将人脂联素蛋白质序列的 FASTA 格式序列输入分析框 → 点击左侧序列说明框中的序列说明 → 点击 sequence 栏 → 选择 protein → 点击 Amino Acid Composition → 查看该蛋白质分子质量和氨基酸组成。
或者选择 protein 后，点击 Kyte & Doolittle Mean Hydrophobicity Profile → 查看该蛋白质分子疏水性水平。
3. 人脂联素蛋白质序列的蛋白质同源性分析
（1）进入 NCBI/Blast 网页；
（2）选择 Protein-protein BLAST (blastp) ；
（3）将 FASTA 格式序列贴入输入栏；
（4）点击 BLAST；
（5）查看与之同源的蛋白质。
4. 人脂联素蛋白质序列的 motif 结构分析
（1）expasy-tools (http://cn.expasy.org/tools/) 中的链接进入，或直接输入网址（http://myhits.isb-sib.ch/cgi-bin/motif_scan）进入网页；
（2）将人脂联素蛋白质序列的 FASTA 格式序列贴入输入栏；
（3）点击 Scan；
（4）查看分析结果（注意 Prosite Profile中的motif information）。
5. 人脂联素蛋白质序列的二级结构预测
（1）可由 expasy-tools (http://cn.expasy.org/tools/) 中的链接进入，或直接输入网址（http://www.predictprotein.org/）进入；
（2）进入 predictprotein 页面后，先 register（注册）；
（3）然后将人脂联素蛋白质序列的 FASTA 格式序列贴入输入栏，submission（提交）所要分析的蛋白序列；
（4）从 email 信箱查看分析结果。
PHD predictions 结果
PROF predictions 结果
6. 人脂联素蛋白质序列的三维结构预测
（1）进入 http//www.expasy.org/swissmod/SWISS-MODEL.html （SwissModel First Approach Mode）网页；
（2）选择 Automated mode （自动模式）；
（3）进入 Automated mode 界面后输入 E-Mail 地址和序列名称，将人脂联素蛋白质序列的FASTA格式序列贴入输入栏，点击「submit modeling request」后，等待结果。
（4）从 email 信箱查看分析结果。
材料与仪器
BioEdit 软件， rasmol 软件。
步骤
1. 人脂联素蛋白质序列的检索
（1）调用 Internet 浏览器并在其地址栏输入 Entrez 网址（http://www.ncbi.nlm.nih.gov/Entrez）；
（2）在 Search 后的选择栏中选择 protein；
（3）在输入栏输入 homo sapiens adiponectin；
（4）点击 go 后显示序列接受号及序列名称；
（5）点击序列接受号 NP_004788 （adiponectin precursor； adipose most abundant gene transcript 1 [Homo sapiens]）后显示序列详细信息；
（6）将序列转为 FASTA 格式保存（参考上述步骤使用 SRS 信息查询系统检索人脂联素蛋白质序列）；
2. 使用 BioEdit 软件对人脂联素蛋白质序列进行分子质量、氨基酸组成和疏水性等基本性质分析
打开 BioEdit 软件 → 将人脂联素蛋白质序列的 FASTA 格式序列输入分析框 → 点击左侧序列说明框中的序列说明 → 点击 sequence 栏 → 选择 protein → 点击 Amino Acid Composition → 查看该蛋白质分子质量和氨基酸组成。
或者选择 protein 后，点击 Kyte & Doolittle Mean Hydrophobicity Profile → 查看该蛋白质分子疏水性水平。
3. 人脂联素蛋白质序列的蛋白质同源性分析
（1）进入 NCBI/Blast 网页；
（2）选择 Protein-protein BLAST (blastp) ；
（3）将 FASTA 格式序列贴入输入栏；
（4）点击 BLAST；
（5）查看与之同源的蛋白质。
4. 人脂联素蛋白质序列的 motif 结构分析
（1）expasy-tools (http://cn.expasy.org/tools/) 中的链接进入，或直接输入网址（http://myhits.isb-sib.ch/cgi-bin/motif_scan）进入网页；
（2）将人脂联素蛋白质序列的 FASTA 格式序列贴入输入栏；
（3）点击 Scan；
（4）查看分析结果（注意 Prosite Profile中的motif information）。
5. 人脂联素蛋白质序列的二级结构预测
（1）可由 expasy-tools (http://cn.expasy.org/tools/) 中的链接进入，或直接输入网址（http://www.predictprotein.org/）进入；
（2）进入 predictprotein 页面后，先 register（注册）；
（3）然后将人脂联素蛋白质序列的 FASTA 格式序列贴入输入栏，submission（提交）所要分析的蛋白序列；
（4）从 email 信箱查看分析结果。
PHD predictions 结果
PROF predictions 结果
6. 人脂联素蛋白质序列的三维结构预测
（1）进入 http//www.expasy.org/swissmod/SWISS-MODEL.html （SwissModel First Approach Mode）网页；
（2）选择 Automated mode （自动模式）；
（3）进入 Automated mode 界面后输入 E-Mail 地址和序列名称，将人脂联素蛋白质序列的FASTA格式序列贴入输入栏，点击「submit modeling request」后，等待结果。
（4）从 email 信箱查看分析结果。
注意事项
1. 需下载软件入 rasmol 查看三维图象。
2. 有时结果比较快，会马上有结果发到 E-Mail，通过 E-Mail 链接即显示结果页面。但有时候比较慢。
来源：丁香实验
