基因突变，蛋白质预测咨询

一类是理论分析方法或从头算方法（Ab initio），通过理论计算（如分子力学、分子动力学计算）进行结构预测。该类方法假设折叠后的蛋白质取能量最低的构象。从原则上来说，我们可以根据物理、化学原理，通过计算来进行结构预测。但是在实际中，这种方法往往不合适。主要有几个原因，一是自然的蛋白质结构和未折叠的蛋白质结构，两者之间的能量差非常小（1kcal/mol 数量级），二是蛋白质可能的构象空间庞大，针对蛋白质折叠的计算量非常大。另外，计算模型中力场参数的不准确性也是一个问题。

可以上ncbi上输入你的突变基因，然后进行蛋白预测。

预测蛋白质结构是一项复杂的任务，涉及到许多不同的计算方法和工具。针对已知基因非同义突变位点的预测，可以考虑以下方法：

使用基于模板的结构预测方法：这种方法需要找到具有相似序列的已知蛋白质结构作为模板，并基于模板进行蛋白质结构预测。其中，一些经典的方法包括BLAST、HHblits、PSI-BLAST等用于查找相似序列的工具，以及模板比对工具MODELLER和ROSETTA等。您可以学习相关的课程和教材，例如Bioinformatics Specialization（https://www.coursera.org/specializations/bioinformatics）和Protein Structure Prediction（https://www.coursera.org/learn/protein-structure-prediction）。

使用基于物理学的结构预测方法：这种方法尝试通过基于物理原理的建模，来预测蛋白质的三维结构。其中，一些常见的方法包括分子动力学模拟、蒙特卡罗模拟、分子力场等。您可以学习相关的课程和教材，例如Computational Biophysics（https://www.coursera.org/learn/computational-biophysics）和Introduction to Computational Chemistry（https://www.coursera.org/learn/introduction-to-computational-chemistry）。

需要注意的是，任何结构预测方法都有其局限性和不确定性。因此，在进行蛋白质结构预测时，应该综合考虑多种方法和工具的结果，并进行合理的验证和验证。