【讨论】细菌的甲基化图谱

Cell, Nature 都出版过拟南芥的甲基化图谱的文章，但是细菌的甲基化图谱未见报道，如果单从基因组的大小考虑，细菌的更加容易测序。

各位以为细菌的甲基化图谱有其表观遗传学的意义么？

如果该细菌可以产生经济效益，如产生某些能源物质，呵呵，这些物质的产生与某些基因表达有关，而甲基化会影响这些基因表达，也许有用。

PS：只是其中一方面！呵呵

可能大家的理解都进入了一个误区，以为甲基化就理所当然应该是抑制基因表达。其实，细菌是不存在经典意义中的表观遗传的。

确实，细菌中存在DNA的甲基化，但是这种甲基化的作用是和真核生物截然不同的。请注意，我们通常提的DNA甲基化是指真核细胞中的甲基化。而且，植物与动物的甲基化也是有区别的。动物的甲基化发生在CG中,而植物通常发生在CNG中。

细菌中的甲基化和CG,CNG都没有关系，它的存在主要有以下两方面作用：
1，在细菌DNA错配修复系统中，发挥母链标记的作用。
2，细胞的一种基本防御机制。细菌中存在多种甲基化酶，就像限制性内切酶一样，能够识别特定的序列，并甲基化这组序列内或附近的碱基对。外来的未进行这种形式甲基化的DNA将被限制酶降解。

谢谢th-chen, 明白了！呵呵

PS：已经有定论细菌的甲基化对表达不影响了么？:)

倒是没见过定论。不过，可以确信的是，细菌中不存在核小体，因此，DNA甲基化不会牵涉到染色质变化。
甲基化的DNA会不会干扰转录因子对DNA的结合，倒是值得考虑的。不过，这毕竟是小概率事件，细菌中DNA的甲基化可能并没有真核生物中普遍。

有道理！

回过头来看这个帖子还是很有意思的
http://www.ebiotrade.com/newsf/2012-11/20121120115106784.htm
通过一种新的DNA测序技术，研究人员首次绘制了致病菌全基因组甲基化标记图谱。通过比较相关菌株之间的甲基化模式，他们发现了称作噬菌体的病毒感染细菌显著改变宿主的一种方式。