【求助】一个普通的蛋白有可能作为转录因子起作用么?
丁香园论坛
2324
功能已知的蛋白(一个代谢酶)有可能作为一个转录因子而调控其它基因么?如果往转录因子这方面去考虑合理么?大家给点建议吧,谢谢!
helloabing wrote:
功能已知的蛋白(一个代谢酶)有可能作为一个转录因子而调控其它基因么?如果往转录因子这方面去考虑合理么?大家给点建议吧,谢谢!
跑个luciferase assay,看看结不结合到其目的基因的promoter region 就知道了。
那如果是间接影响呢?
erik wrote:
那如果是间接影响呢?
首先,如果这个蛋白确实没有其做为transcription factor (TF)的作用报道,属于全新工作原理的猜测。那么不知道其结合位点是正常的。既然1楼的战友怀疑有可能做为TF工作的话,总得有和某个gene的promoter位置结合吧:D(不结合就不叫TF了),那么是否和他所关注的gene的promoter结合,还是和其上游的某个环节的gene结合,那就只能一个一个实验做下去考察了。
谢谢楼上两位战友的回答。以前没做过这方面的工作,所以还是不太明白。利用 luciferase assay 法来检测目的蛋白是否作为转录因子直接与某个基因结合,原理是什么?有这方面的试剂盒么(针对我的这个目的)?谢谢。
helloabing wrote:
谢谢楼上两位战友的回答。以前没做过这方面的工作,所以还是不太明白。利用 luciferase assay 法来检测目的蛋白是否作为转录因子直接与某个基因结合,原理是什么?有这方面的试剂盒么(针对我的这个目的)?谢谢。
http://www.dxy.cn/bbs/post/search?words=luciferase&c=0&mode=and&bid=0&username=&age=0&o=0&limit=20&action_search=+%CB%D1+%CB%F7+
这个其实可以用生物信息学的方法,看看这个酶是否与已知的转录因子在序列上有相似性,然后再做试验验证。一般转录因子在序列上,特别是与基因的promoter结合的地方有一定的保守性,所以可以通过这种方法来验证。
本文由丁香园论坛提供,想了解更多有用的、有意思的前沿资讯以及酷炫的实验方法的你,都可以成为师兄的好伙伴
师兄微信号:shixiongcoming