蛋白质的疏水层析纯化步骤---写给新手，请指正！

疏 水 层 析

1、 疏水层析是根据不同蛋白质的疏水力强弱不同来分离的。在高盐离子强度的情况下，蛋白质的疏水基团充分暴露与填料的疏水介质相互作用，从而结合在柱子上。不同蛋白质的疏水性强弱不同从而导致其与柱子填料的结合力也不同。随后，逐渐降低洗脱缓冲液的盐离子强度就可以将不同的蛋白分布洗脱下来，形成一个个的蛋白质洗脱峰。

2、 柱子的装填：如果是预装柱，就不存在装柱的问题了。不是，则从头开始：首先，把柱子洗干净，一定要洗干净，不然会出现气泡。填料预先融涨（注意，进口一般已经是融涨好的，不必再做这一步），取一定的填料（例如：想装5.0ml的柱子，一般将瓶子里的填料（沉淀的填料：上清=1：1的话）取10.0ml出来）先脱一下气（请人帮忙，不然控制不好会暴沸出来！），然后缓缓装入柱子（柱子上下口一定不要搞错！！！），打开下口让水流出，最好一次性装完，等待其自然沉降，柱子就装好了。（实际上，因为疏水层析的原理与分子筛不同，所以其装柱远远没有分子筛的柱子那么严格，很容易的！放心好了！看着顺眼就应该差不多吧）

3、 注意：柱子装好之后，任何时间都不能让缓冲液流到柱面以下而干柱，切记！

4、 缓冲液的选择：a、pH值：要在蛋白质的pI值附近，因为这时蛋白质的疏水力会最强，但是也不要把缓冲液的pH正好调到pI，因为蛋白那时会发生等电点沉淀！（大家都知道，呵呵…）。所以，如果你的蛋白等电点是8.5的话，配一个8.0或9.0的缓冲液应该都可以！b、缓冲介质：常用的是PBS或者Tris-HCl缓冲液，都可以，看个人习惯了，或者，你以后的实验要用Tris-HCl，那么这里也用Tris-HCl就是了。蛋白质技术手册上用的是PBS，自己选择吧。c、缓冲液的浓度：依照蛋白质技术手册上的浓度即可：20mM。

5、 样品的处理：疏水层析是在高盐离子强度的情况下上样的。而且，样品在上样之前一定要注意没有沉淀，有的话应该离心除去。样品的盐离子强度的调整：可以直接将固体的磨的很细的盐颗粒加在样品里，使之达到预定的浓度（是硫酸铵的话，就查手册后面的表格，计算应该加多少盐），或者将样品与100%的硫酸铵等体积混合，不就变成50%的了（这样的好处是缓冲液的浓度不会因为加入硫酸铵体积变大而降低，从而影响了样品的pH值）？

还有更加重要的是：请仔细选择上样的离子强度，要知道，蛋白质在高盐的情况下是要发生沉淀的（硫酸铵沉淀纯化蛋白的原理）！如果你的蛋白的硫酸铵沉淀范围是50-80%，那么你大可放心地用50%硫酸铵来上样！如果你的蛋白的硫酸铵沉淀范围是30-50%，那么你就只能用30%来上样了，千万记住！！！还有就是，调整盐离子强度的时候要在低温下操作，如果有沉淀产生，轻轻地混匀一会儿，该溶解的就会溶解，离一下心，就可以上样了。

6、 不知道你的蛋白的稳定性如何？必要的时候，请加入蛋白酶抑制剂。

7、 柱子的预平衡：10倍床体积的层析缓冲液洗柱（20mM PBS, 50%硫酸铵（这个浓度要你选择，50%还是30%？）），使其平衡。

8、 上样：当平衡层析缓冲液流至恰好与床面相切时，关闭出液口（有泵的话，把它一关就OK!），然后上样。注意：尽量小心，保持床面的平整性！打开出口，让样品缓缓进入柱床，再次相切时，加入少量（很少就可以，稍稍盖过床面就行！）层析缓冲液（20mM PBS, 50%硫酸铵）洗一下。

9、 洗柱：注意，这一步不是洗脱，而是把一些吸附不在柱子上的杂蛋白尽量洗下来！步骤：3倍床体积的层析缓冲液洗柱（20mM PBS, 50%硫酸铵）洗柱或者观察检测仪的信号回到基线，那就证明吸不住的杂蛋白完全洗下来了。

10、 目的蛋白的洗脱：有梯度混合仪的话，可以梯度洗脱（比如50%-0%洗脱），没有的话，就像手册上那样，配置一系列浓度的洗脱缓冲液，各两倍体积来洗。控制好流速，0.5ml/min左右吧，再问问人家一般用多大的流速？两种洗脱方式各有利弊，梯度洗脱分辨率高一些，操作较简单，不用频繁更换缓冲液，但是不太适合批量蛋白的过柱。分布洗脱比较烦，要不停更换缓冲液（换液之前，别忘了关泵，否则柱子要被吸干！！！），但是批量操作性好，重复性好，样品可以不用分步收集，只需把不同浓度缓冲液洗下来的样品收集到一起即可。

11、 样品的收集：梯度洗脱的话，将洗脱峰的各管合并（不放心，可以峰前，峰尖，峰尾分别合并，至少可能保证峰尖是纯的，不过我觉得你的样品没必要这样，因为本来就比较纯的！）分布洗脱的话，本来就是直接按照不同浓度合并收集的，不存在再次合并问题。

12、 样品纯度的检查：疏水层析后的样品盐离子强度很高的一般都，除非你是在0%的时候才洗脱下来你的蛋白（还有，如果你的蛋白0%还洗不下来，可以在洗脱缓冲液中加入5%的乙醇或者乙二醇来洗脱）。不管用什么办法，请将你的样品脱盐（透析，体积太大可以先冷冻干燥再溶解后透析，或者直接用三氯乙酸沉淀洗涤即可）。然后，估计一下你的样品的蛋白质浓度，就可以SDS-PAGE上样电泳检查纯度了（测酶活方便的话，比较比酶活也可以初步知道纯化程度！）。若纯度要求很高，你可以用银染来检查，这个灵敏度高，ng级的！

13、 好了，就这么多，有什么问题再讨论吧。或者到丁香园去问一下，chromatography很内行的！