western难题
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bixin1220: 这几天做western条带出现了奇怪的现象。
band变成空心了,还有actin条带像PCR一样拉长了,请各位能人帮忙,指点谜径。
这是actin,我这是用细胞,分细胞质里的蛋白和细胞核里的蛋白做了western blot。细胞质里的蛋白actin就变成这样了,细胞核里的actin就正常。是不是我分得不对了就出现这种情况?我用RIPA buffer 提取蛋白的。
这是核里的actin。算挺正常吧
丁香园网友 bixin1220 认为:
在这儿写出我做western的条件,有什么该优化的地方,希望大家帮我指出来。
1.上样 一般30μg蛋白,volume一般不超过3μl。
2.电泳 stacking gel 70V,分离胶100~120V。
3.转膜 100V 1h。
4.封闭 5% 脱脂牛奶 2h。
5.凡washing TBST 7~10min/次,三次。
6.一抗 1:1000,4 ℃,overnight (一般15~17小时)。
7.二抗 1:1000~2000,室温 1h。
8.ECL 用pipet反复滴在膜上约3min。
9.曝光 在暗盒里10秒~3分钟不等,因样品而异。
什么问题会导致上面的那些条带呢???
毕业在即,心急如焚,望各位前辈高人不吝赐教。
丁香园网友 sunnyziyang 认为:
你那个空心的条带是蛋白过多曝光过强了,减少曝光时间就好了,这么强用胶片贴一下就好了,或者你少上点样啊,至于那个拖的现象,你确定你的抗体以前从来没出现过这种情况吗,会不会抗体的问题呢,还有就是会不会跑太久,分得太开了呢
丁香园网友 bingchuan001331 认为:
上样量太高了,边上孔的蛋白有溢出的现象。
还有空心的条带是压片时间久了,要么换个弱显试剂盒,要么缩短压片时间。
丁香园网友 bixin1220 认为:
非常感谢楼上两位,我电泳跑的时间是长了点,一共加起来可能有俩小时了,我以为条带分得越开就越好呢,这会是条带拖下来的原因吗?
再附上片子。这次我上样减量了,封闭时间长了点,4摄氏度里过夜十五个小时,空心现象减轻多了,fraction之后cytosol里的Actin也是好点了,就是条带托下来的现象还有,我再试一下减跑电泳时间。我压片只有7,8秒啊,这还长吗?我怕在短了压得太模糊了。
对了,我洒上ECL PLUS之后,有时候membrane上开灯的时候就隐约可见淡黄色的条带的痕迹,这种现象是否正常呢,不影响条带的质量?
罗罗嗦嗦写这么多,只不过是想给同道中人提供点参考,还有请大家多多指点。
丁香园网友 bixin1220 认为:
从上至下依次是cytosol,nuclear,actin条带。
nuclear拖下来的现象比cytosol的好多了,这是什么原因呢?
丁香园网友 sunnyziyang 认为:
洒上ECL PLUS之后,有时候membrane上开灯的时候就隐约可见淡黄色的条带的痕迹,这是正常现象,蛋白量多,条带很强的时候就会出现这种现象的,你应该很高兴,这样就代表你曝光的时间应该短一点,像你的七八秒其实也差不多了,试一下二三秒吧,应该也能曝出来