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煮沸法快速提取质粒以及琼脂糖电泳与DNA酶解

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一、实验目的

1、掌握质粒DNA 分离,纯化的原理。

2、学习煮沸法快速提取质粒DNA 的方法。

3、学习DNA的限制性酶切的基本技术。

4 、学习利用琼脂糖电泳测定DNA片段的长度。

二、实验原理

在基因工程中,DNA分子的切割是由限制性内切酶来完成的。限制性内切酶能识别特定的DNA 序列,在一定的条件下切断双链DNA。限制性内切酶的作用效率是受多方面因素影响的,如反应温度,缓冲体系,离子种类与浓度,DNA 的纯度和甲基化程度等。

对DNA 进行酶切时,首先要选择适合的缓冲液。对于单酶切,应选用该酶的最适缓冲液;对于双酶切或三酶切,应选用一种能使所有酶都充分作用的缓冲液。 DNA的纯度对于酶切的效果的影响也很大,因为蛋白质。酚。氯仿。SDS 等杂质都会抑制限制性内切酶的活性。

琼脂糖凝胶电泳是分离,鉴定和纯化DNA片段的常规方法。利用低浓度的荧光嵌入染料- 溴化乙锭进行染色,可确定DNA在凝胶中的位置。如有必要,还可以从凝胶中回收DNA条带,用于各种克隆操作。琼脂糖凝胶的分辨能力要比聚丙烯酰胺凝胶低,但其分离范围较广。

用各种浓度的琼脂糖凝胶可以分离长度为200bp 至近50kbp 的DNA 。长度100kb 或更大的DNA ,可以通过电场方向呈周期性变化的脉冲电场凝胶电泳进行分离。在基因工程的常规操作中,琼脂糖凝胶电泳应用最为广泛。它通常采用水平电泳装置,在强度和方向恒定的电场下进行电泳。

DNA分子在凝胶缓冲液(一般为碱性)中带负电荷,在电场中由负极向正极迁移。DNA分子迁移的速率受分子大小,构象。电场强度和方向,碱基组成,温度和嵌入染料等因素的影响。

三、实验材料和试剂

1. 菌种

含pUC18 的大肠杆菌JM107 菌株。

2. 化学试剂和溶液

  (1) LB 培养基:
  NaCl 10g/l 酵母提取物5g/l
  胰蛋白胨10g/l 氨苄青霉素50 μ g/ml (培养基灭菌后加入)
  pH7.0

  (2) 70% 乙醇(-20 ℃)及无水乙醇(-20 ℃)

  (3) STET 缓冲液(pH8.0 )(8% 蔗糖,0.5%Triton,50mmol/L EDTA,10mmol/L Tris )

  (4) 5%CTAB (十六烷基三甲基溴化氨)

  (5) 1.2M 氯化钠

  (6) TE 缓冲液(10mmol/L Tris-HCl,1mmol/L EDTA )

  (7) 电泳缓冲液(50XTAE )

  Tris 242g, 冰醋酸57.1ml,EDTA(0.5mol/LpH8.0) 100ml
  使用时用蒸馏水稀释50 倍。

  (8) 样品缓冲液(6X )

  0.25% 溴酚蓝, 0.25% 二甲苯青, 40% ( W/V )蔗糖

  (9) 溴化乙锭10mg/ml

  (10) 琼脂糖(电泳级)

  (11) 限制性内切酶

  (12) 溶菌酶(50mg/ml ,溶于10mmol/L Tris-HCl ,pH 8.0 )

3.仪器设备

  台式离心机、超净工作台、高压灭菌锅、恒温振荡培养箱、恒温水浴箱等。

  Eppendorf 离心管,Tip 头,三角瓶等灭菌备用。

  电泳仪,电泳槽,样品梳,微波炉,水浴锅,移液器(20ul,200ul 和1000ul ),离心管,Tips(200ul,1000ul)。

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