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AFLP-PCR

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简介

AFLP-PCR或AFLP是一种基于PCR的工具,用于遗传学研究,指纹,DNA和基因工程技术在实践中的。在20世纪90年代初开发的Keygene,AFLP使用限制性内切酶消化基因组DNA,然后连接适配器的粘性末端的限制性片段。

限制性片段的子集,然后选择被放大。此选择是通过使用的适配器序列互补的引物,内的限制性酶切位点的片段(如在下面详细描述)的限制位点的序列和几个核苷酸来实现。的扩增片段在变性聚丙烯酰胺 凝胶中分离和可视化,可以通过放射自显影或荧光的方法,或通过自动毛细管测序工具。

AFLP是不是一个缩写,尽管数以百计的出版物就是这样做的,这是不正确的,指为“扩增片段长度多态性”,所得到的数据没有进球长度多态性AFLP ,而是存在不存在多态性。

AFLP-PCR是一种高灵敏度的方法,用于检测的DNA中的多态性。该技术最初是在1993年由Vos和Zabeau描述详细地说,在这种技术的程序被分成三个步骤:

1. 消化的总细胞DNA与一种或多种限制性内切酶和结扎限制半站点特定适配器的所有限制性片段。

2. 一些这些片段与两个有对应的适配器和限制性位点的特异性序列的PCR引物的选择性扩增。

3. 电泳分离扩增产物的凝胶基质上,随后通过的带图案的可视化。

AFLP的一个变体的cDNA-AFLP ,这是用来量化基因表达水平的差异。

AFLP分子的另一个变化是TE显示,用于检测转座元件的流动性。

应用

AFLP技术有能力同时检测不同的基因多态性在不同基因组区域。这是灵敏度高,重现。其结果是,AFLP技术已成为广泛使用的用于识别的遗传变异的植物,真菌,动物,和细菌的菌株或密切相关的物种。AFLP技术已被用于犯罪和亲子鉴定,以确定种群内的细微差别,并在连锁研究产生的数量性状位点(QTL)分析图。

相比其他标记技术,包括随机扩增多态性DNA(RAPD),限制性片段长度多态性(RFLP),和微 AFLP时有许多优点。AFLP不仅具有较高的再现性,分辨率和其他技术相比,在全基因组水平的灵敏度,但它也有能力在同一时间在50和100之间的片段扩增。

此外,事先没有序列信息需要放大(Meudt 2007年和Clarke)因此,AFLP已成为非常有益的,包括细菌,真菌和植物类群的研究,现在还是有很多未知的。各种生物的基因组构成。

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