【求助】siRNA 设计
丁香园论坛
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我想对某一序列的基因进行沉默，在知道DNA 序列号的情况下，能否设计出针对mRNA的siRNA序列？是生物合成的还是化学合成的转染效率要好一些，用什么样的转染载体教实惠？
提交你的基因，找专门的公司搞定，他们有现成的siRNA库。
有的文献是用化学合成的，这样比较快，但是都是瞬时转染，载体比较好的目前是病毒载体。可以和我联系，我的邮箱是sc-western@163.com
其实siRNA的设计是非常简单的，你可以在以下几个网站找到你所需要的siRNA设计：
http://www.ambion.com/techlib/misc/siRNA_finder.html
http://www.ic.sunysb.edu/Stu/shilin/rnai.html
http://design.dharmacon.com/rnadesign/default.aspx?SID=45358710
http://www.genesil.com/business/products/order2.htm
这些软件的原理就是通过一系列算法来预测可能能够kockdown你的目的基因，在很大程度上是可以的。像我自己使用的是麻省理工学院（MIT）怀特黑德实验室的算法，一般你可以设计4对，然后构建好质粒转染检测那个效果更好。至于你说的合成办法，这个引物很短的，大概50多个碱基对，所以还是建议你找公司合成。但是设计很简单的，所以最好自己做做。实验过程还是非常重要的。
祝实验顺利，不会的话可以叫我给你设计。呵呵！
http://www.ambion.com/techlib/misc/siRNA_finder.html
http://www.ic.sunysb.edu/Stu/shilin/rnai.html
http://design.dharmacon.com/rnadesign/default.aspx?SID=45358710
http://www.genesil.com/business/products/order2.htm
这些软件的原理就是通过一系列算法来预测可能能够kockdown你的目的基因，在很大程度上是可以的。像我自己使用的是麻省理工学院（MIT）怀特黑德实验室的算法，一般你可以设计4对，然后构建好质粒转染检测那个效果更好。至于你说的合成办法，这个引物很短的，大概50多个碱基对，所以还是建议你找公司合成。但是设计很简单的，所以最好自己做做。实验过程还是非常重要的。
祝实验顺利，不会的话可以叫我给你设计。呵呵！
这些设计都是老黄历了，现在有更新的设计方法。
楼上的说说看！
erik wrote:
楼上的说说看！
设计上比较讲究，主要看设计元件构成。最重要的是算法。
zhujoker 战友，我也打算做RNAi，是关于乙肝病毒X基因的，想麻烦你也帮我设计下：我的QQ919596527，谢谢！
Dharmacon公司RNAi产品资料大全，有需要或是感兴趣的朋友留下邮箱!
我们可以帮您设计，每个基因设计4条序列，选择最优的去包装病毒，
您可以联系我 Tel:13811831415 Email:zenghong808@126.com
有什么问题可以问我，对这方面还是比较了解的，我的硕士阶段就做的这些！
您可以联系我 Tel:13811831415 Email:zenghong808@126.com
有什么问题可以问我，对这方面还是比较了解的，我的硕士阶段就做的这些！
现在用慢病毒做干扰有很多优点，可以去这里看看www.cqwestern.com在这方面做得很好。
目前siRNA的设计软件较多,影响siRNA的有效性的因素较多,可以MSN:vitrogene@hotmail.com
QQ;451823934 可以聊聊
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师兄微信号：shixiongcoming
