小鼠心脏组织总RNA的提取纯化
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将冷冻保存的小鼠心脏组织在液氮条件下研磨成粉末,利用Trizol试剂采用一步法提取组织中总RNA。来自同一组别不同动物的总RNA混合提取。
1) 每100 mg研碎的组织加1 ml TRIzol,玻璃匀浆器匀浆至肉眼看不到组织样本颗粒为止。然后移入1.5 ml离心管中,室温放置15 min。
2) 按0.2 ml氯仿/1 ml Trizol起始量的比例加入氯仿,振摇30 sec,室温放置2-3 min, 4o C, 12000 g离心15 min。
3) 用移液器小心吸出上层水相,转移至另一离心管中,按0.5 ml异丙醇/1 ml Trizol的比例加入异丙醇,混匀,室温放置10 min以上,4o C,12000 g离心15 min。
4) 弃去上清,加入1 ml 75%乙醇,振摇,4o C,7500 g离心5 min。
5) 移出乙醇,通风橱中自然干燥5-10 min,适量DEPC水溶解RNA,-80℃冻存。
RNA纯度和浓度检测:将提取的RNA稀释100倍,用紫外分光光度计测定260 nm和280 nm处的OD值,RNA的浓度按10D=40ug/ml计算;RNA的纯度依据OD260/OD280比值判断,纯RNA的OD260/OD280接近2.0(比值最好在1.9-2.1之间)。
RNA完整性检测:取0.5ug RNA样品,补水至8ul,加入2 ul 15 x上样缓冲液,混匀。70℃加热变性10 min,然后冰上骤冷,加入稀释50倍的EB 1ul,离心后上样至RNA变性胶,70 V恒压电泳,凝胶成像仪上观察电泳结果。
使用Qiagen公司的RNeasy Mini Kit对总RNA进行过柱纯化。
1) 将总RNA的体积用DEPC水调整到100ul(因纯化柱的RNA最大结合量为100ug,因此取小于100ug RNA)。
2) 加入350ul RLT buffer混匀,再加入250ul无水乙醇,充分混匀。
3) 将700ul液体转移到纯化柱中,室温12000 rpm离心15 sec,弃去收集管中的液体。
4) 加500 ul RPE buffer到纯化柱中,室温12000 rpm离心15 sec弃去收集管中液体。
5) 加500 ul RPE buffer到纯化柱中,室温12000 rpm离心2 min。
6) 弃去收集管及其中液体,换一个新的收集管,室温,离心机最大转速离心1min
将纯化柱转入另一新1.5 ml离心管中,加入30-50ulDEPC水到纯化柱上,室温,12000 rpm离心1 min。
7) 如果RNA量大于30ug,再次加入30-50 ul DEPC水到纯化柱上,室温,12000 rpm离心1 min,F和H使用同一个收集管,之后进行定量和质检。