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这个被吹上天的外泌体数据库,真的名不虚传!

互联网

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外泌体不管是在基础科研、临床应用,还是商业研发,都相当火热,给大家介绍一个超强的外泌体数据库:exoRBase

exoRBase 数据库共收录了 58330 种 circRNAs,15501 种 lncRNAs,18333 种 mRNAs,它们来自 92 份血清外泌体 RNA-seq 实验数据,包括正常人(NP)、冠心病(CHD)、结直肠癌(CRC)、肝细胞癌(HCC)、胰腺腺癌(PAAD)和乳腺癌(BC)等样本。

作者还依据 GTEx project 获得组织特异性 RNA 表达特征,分析了相关 RNA 分子的组织来源。

一、浏览功能区使用

1. 点击进入 circRNA 浏览功能区。

2. 获得检索结果包括相关 circRNA 的 ID、circBase ID 和染色体位置等信息。

3. 点击进入 lncRNA 和 mRNA 浏览功能区。

4. 获得检索结果包括基因名、基因类型,相关 circRNA、表达等级和特异性表达组织等信息。

二、搜索功能区使用

1. 点击进入搜索功能区

2. TRAF3 在不同类型样本中的表达线图。

3. TRAF3 在不同类型样本中的表达热图。

4. 点击获得 TRAF3 在不同类型样本中的表达盒形图及详细信息。

5. TRAF3 在不同类型样本中的表达盒形图。

6. 获得 TRAF3 基因详细信息包括全称,染色体位置、正义链或反义链、长度和基因类型等信息。

三、下载功能区使用

点击任意条目可下载相应数据。

四、社区功能区使用

1. 获得相关出版资料和资源信息。

2. 查阅数据库相关问题的解答。

五、提交功能区使用

填入信息点击提交可上传外泌体相关 circRNA、lncRNA 和 mRNA 数据到数据库中。

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