Label Free非标记定量技术
北京百泰派克生物科技有限公司
非标记定量蛋白质组学 (Label Free)近年来成为重要的质谱定量方法,按照其原理进行分类,可以分为两类。Spectrum counts类的非标记定量方法,发展比较早,也形成了多种算法进行定量,但是主要的原理都是根据MS2的鉴定结果作为定量的基础,各种方法的差别在于后期算法在大规模数据上的修正。第二种非标记定量方法的原理是以MS1为基础,计算每个肽段信号在LCMS质谱上的积分,目前Label Free主要的数据分析方法是利用Maxquant软件,根据一级质谱相关的肽段峰强度、峰面积、液相色谱保留时间等信息进行定量分析的方法。
蛋白质非标记定量技术(Label Free)是通过液质联用技术对蛋白质酶解肽段进行质谱分析,无需使用昂贵的稳定同位素标签做内部标准,只需分析大规模鉴定蛋白质时所产生的质谱数据,比较不同样品中相应肽段的信号强度,从而对肽段对应的蛋白质进行相对定量。 Label Free定量优势 就在于蛋白质不需要进行标记,所需样品总量少,耗费低。
相比较iTRAQ/TMT等标记方法,Label Free非标记方法具有特定的技术优势:
a.检测起始样本量少;
b.前处理少,更多保留样本最原始信息;
c.对于低丰度多肽的覆盖程度更高;
d.不受标记试剂盒限制,可进行大批量的样本检测。
标记定量与非标记定量技术的比较
百泰派克生物提供基于质谱的蛋白质定量服务,包括iTRAQ/TMT, Label-Free, SILAC, MRM/PRM及SWATH定量蛋白组学服务,欢迎垂询!