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北大博士教你如何从图像中获得可用的灰度数据

生物学霸

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如何从图像中获得可用数据系列,出到第三期啦。
 
前两期说的是如何从图像中获得数字(如何将主观图片转化成直观的数据图
)和大小(如何轻松从图像中获得可用的大小数据),把一些主观图片转化成客观、投稿可用的数据。今天我们讲的是另一个非常重要的内容:如何在图像中测灰度。
 
灰度是一个非常重要的量度,是在 WB 条带等有颜色的图像中都可以测出的数据,闲话不说,我们来看看图文视频示例吧……
 
实例操作:共聚焦图片的灰度
 
● 比较下边两张共聚焦图片中细胞的绿通道平均灰度值,绘制柱形图。
 
● 适用软件:Image-Pro Plus 6.0

● 主要菜单命令
 
Measure→Calibration→Intensity【校正标尺】
Measure→Count/Size【圈对象,求灰度】


灰度只是半定量。
 
灰度并不等同于浓度。
 
两者有相关性,但不是线性关系。




Measure→Calibration→Intensity 应该采用何种校正方式?Free Form
 
● 背景呈黑色或深色
 
● 待测物质呈亮色或浅色
 
● 推荐观测指标:Density 等



Std. Optical Density
 
● 背景呈白色或浅色
 
● 待测物质呈深色或黑色
 
● 推荐观测指标:IOD



图像求灰度的其他应用


电泳条带的半定量、ImageJ,ImageLab,QuantityOne,Bandscan 等软件都可实现条带分析


免疫组化染色的半定量

视频手把手示范操作>>

 
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