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RT-PCR 结果竟然不可信?这点你注意到了吗

丁香园

1855

每天驻扎在实验室做实验已经很不容易了,这时候有人泼凉水,猛得来一句:

你的基因表达计算结果准确吗?

「What?!你不是来搞事情的吧?我可是非常认真地对待实验的!有阴性对照、选取了常用的内参基因等等,实验结束之后,我没有做任何软件上的调整,直接导出结果进行统计计算的,整个流程上是没有问题的!」,也许你是这么想的,但是……

你有测过基因的扩增效率吗?也许你知道常用的基因表达计算方法——ΔCt 法,它在使用的时候,有一个必要条件需要满足:目的基因和内参基因的扩增效率要一致,并且尽可能地接近 100%。也就是说,如果不一致,有可能会影响基因表达计算结果的哟。

除了扩增效率外,还有 Ct 可信程度和内参基因的选择都有可能影响到计算结果的准确度。

所以,你的 Ct 值可信吗?

Ct 值是基因表达计算的基础数值,如果得到的 Ct 值不准确,有偏差,那么,计算的相对表达量毋庸置疑地也会有偏差。

你可能在想,「Ct 值不都是软件自动分析计算得到的吗?难道还会有不准确的?!」。

可以肯定地说,用软件分析扩增曲线得到的 Ct 值大多数情况下都是对的,然而,总有一些小例外需要我们注意,这时候,就需要我们清楚Ct 值的来龙去脉,然后,试一下基线+阈值线吧,会发现惊喜哦!

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