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如何用 PubChem 数据库搜到目标化合物相关文献和专利?

丁香园

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摘要

在生物领域中经常会遇到找化合物相关的生物文献、专利,甚至是检测一个结构为何物的情况,这对学生物的学生来说简直就是灾难。今天为大家介绍的 PubChem 数据库可以让大家的困扰迎刃而解。PubChem 隶属 NCBI 数据库的子数据库,是专门针对化学结构搜索的数据库,使用方便而且是免费数据库,让初学者走上生物信息检索的巅峰。

首先,打开网页。

1

利用 BioAssay 检测生物相关的文献。在输入框中可以输入化合物的名字或者 CAS 号,点击搜索可以得到以下界面,我们可以查询和阅读想要的文献。

2

在主页中选中 Compound 搜索可以得到下方界面,里面包括化合物的 2D 和 3D 结构物理性质、化学性质以及安全信息。更重要的是能查询到与化合物相关的文献和专利,该功能能迅速且全面地让我们了解该化合物的背景知识。

3

很多时候我们拿到的是一个中间体结构,根本无法进行名字和 CAS 搜索,尴尬又来了。这时候只需要在主页的右侧点击 Structure Clustering,进入页面后会显示以下界面:

可以在上面选择相似结构搜索或者子结构搜索,点击 Launch 按钮,进入下方页面,我们还可以在右侧对话框中直接画上我们的结构,点击搜索,便可轻松获得该化合物的所有信息。

是不是超简单~

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