初学者:手把手教你学会用 pubchem 数据库搜到目标化合物相关的文献和专利
丁香园
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在生物领域中经常会遇到找化合物相关的生物文献和专利,甚至是检测一个结构为何物的时候,这对学生物的学生来说简直就是灾难。接下来的 pubchem 数据库会让大家的困扰迎刃而解,pubchem 隶属 NCBI 数据库的子数据库,是专门针对化学结构搜索的数据库,使用方便而且是免费数据库,让一种初学者走上生物信息检索的巅峰。
打开网址:
https://pubchem.ncbi.nlm.nih.gov/
1. 利用 bioassy 检测生物相关的文献
在输入框中可以输入化合物的名字或者 CAS 号,点击搜索可以得到以下界面,我们可以查询和阅读想要的文献。
2. 在主页中选中 compound 搜索可以得到以下界面,里面包括化合物的 2D 和 3D 结构物理性质、化学性质以及安全信息。更重要的是能查询到与化合物相关的文献和专利,该功能能迅速且全面的让我们了解该化合物的背景知识。
3. 很多时候我们拿到的是一个中间体结构,根本无法进行名字和 CAS 搜索,尴尬又来了。这时候只需要在主页的右侧点击:
进入页面后会进入以下界面:
可以在上面选择相似结构搜索或者子结构搜索,点击 Launch 按钮,进入以下页面,我们可以在右侧对话框中直接画上我们的结构,点击搜素,便可轻松获得该化合物的所有信息。