质粒提取注意事项
生物学霸
1. 复制起始位点 Ori 即控制复制起始的位点。原核生物 DNA 分子中只有一个复制起始点。而真核生物 DNA 分子有多个复制起始 位点。
2. 抗生素抗性基因 可以便于加以检测,如 Amp+ 、Kan+。
3. 多克隆位点 MCS 克隆携带外源基因片段
4. P/E 启动子/增强子
5. Terms 终止信号
6. 加 poly(A)信号 可以起到稳定 mRNA 作用
1. Ampr 水解β-内酰胺环,解除氨苄的毒性。
2. tetr 可以阻止四环素进入细胞。
3. camr 生成氯霉素羟乙酰基衍生物,使之失去毒性。
4. neor(kanr)氨基糖苷磷酸转移酶 使 G418(长那霉素衍生物)失活
5. hygr 使潮霉素β失活。
1. 启动子-促进 DNA 转录的 DNA 顺序,这个 DNA 区域常在基因或操纵子编码顺序的上游,是 DNA 分子上可以与 RNApol 特异 性结合并使之开始转录的部位,但启动子本身不被转录。
2. 增强子/沉默子-为真核基因组(包括真核病毒基因组)中的一种具有增强邻近基因转录过程的调控顺序。其作用与增强子所在 的位置或方向无关。即在所调控基因上游或下游均可发挥作用。/沉默子-负增强子,负调控序列。
3. 核糖体结合位点/起始密码/SD 序列(Rbs/AGU/SDs):mRNA 有核糖体的两个结合位点,对于原核而言是 AUG(起始密码) 和 SD 序列。
4. 转录终止顺序(终止子)/翻译终止密码子:结构基因的最后一个外显子中有一个 AATAAA 的保守序列,此位点 down-stream 有一段 GT 或 T 富丰区,这 2 部分共同构成 poly(A)加尾信号。结构基因的最后一个外显子中有一个 AATAAA 的保守序列,此 位点 down-stream 有一段 GT 或 T 富丰区,这 2 部分共同构成 poly(A)加尾信号。
为什么质粒图谱上有的箭头顺时针有的箭头逆时针,那其实是代表两条 DNA 链,即质粒是环状双链 DNA,它的启动子等在其中一条链上,而它的抗性基因在另一条链上。
1)选分子量小的质粒,即小载体(1-1.5 kb)→不易损坏,在细菌里面拷贝数也多(也有大载体);
2)一般使用松弛型质粒在细菌里扩增不受约束,一般 10 个以上的拷贝,而严谨型质粒 < 10 个。
3)必需具备一个以上的酶切位点,有选择的余地;
4)必需有易检测的标记,多是抗生素的抗性基因,不特指多位 Ampr(试一试)。