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一箭双雕的「潜力股」,曹丰团队 Circ Res 报道它既可广谱抗癌,又能缓解阿霉素心脏毒性

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阿霉素是目前可用的最有效的抗肿瘤药物之一。然而,由于其具有严重心脏毒性的风险,其临床用途受到限制。


之前的工作已确定,CircITCH (环状 RNA ITCH是一种广谱的肿瘤抑制性环状 RNA,其编码基因 ITCH(E3 泛素蛋白连接酶)与阿霉素引起的心脏毒性有关。然而,CircITCH 是否在阿霉素引起的心脏毒性中发挥作用尚不清楚。


2020 年 5 月 11 日,来自中国人民解放军总医院(301 医院)的曹丰团队 Circulation Research 上发表了题为 The Tumor-Suppressive Human Circular RNA CircITCH Sponges miR-330-5p to Ameliorate Doxorubicin-Induced Cardiotoxicity Through Upregulating SIRT6, Survivin, and SERCA2a 的研究性论文,揭示 CircITCH 通过上调 SIRT6,Survivin,SERCA2a,使 miR-330-5p 海绵化,改善阿霉素诱导的心脏毒性


图片来源:Circulation Research



研究内容


阿霉素引起心脏毒性和正常人心脏上的 circRNA 表达模式


为筛选可能参与阿霉素引起的心脏毒性的病理过程中的 circRNA,研究者收集了 3 例阿霉素引起的心肌病患者的尸检标本,和 3 名未患病健康捐献者的心脏,进行 circRNA 测序,并分析了表达。共检测到 19112 个 circRNA,其中 84.93%来自基因组外显子。


过滤差异表达的 circRNA 后,在阿霉素引起的心肌组织和正常组织共 356 个 circRNA 表达不同,其中 207 个显著上调,149 个下调。进一步通过 qPCR,检测在 CircBase 中索引的前十个上调 / 下调的 circRNA。在下调的 circRNA 中,研究者关注了 ITCH 来源的 circRNAs,有 5 个 ITCH 来源的 circRNAs 同工型在人原代心肌细胞,人左心室组织和人类诱导多能干细胞来源的心肌细胞(hiPSC-CMs)上表达。其中 hsa_ circ_0001141 是唯一一个能在这三种类型的细胞或组织上表达的,研究者将其命名为 CircITCH 。

图片来源:Circulation Research


随后,研究者使用不同的引物,通过 qPCR 在健康人心脏和 hiPSC-CMs 上扩增出了预期大小的单个不同产物,并通过 Sanger 测序证明了从头至尾的剪切体的存在。


同时,通过 cDNA 和基因组 DNA(gDNA)作为模板,排除了这个剪切体是转录剪切或基因重排导致的。接下来,检测了 CircITCH 在阿霉素诱导时的表达变化RNA 荧光原位杂交证明其表达是降低的。在阿霉素引起的心肌病中,CirciTCH 水平低于健康心脏和其他类型的衰竭心脏中的水平。这些数据提示 CirciTCH 在阿霉素引起的心脏病中可能发挥作用。


图片来源:Circulation Research



CircITCH 过表达可缓解阿霉素引起的细胞死亡,收缩功能障碍和钙调控障碍


接下来,研究者探索了 CircITCH 在阿霉素诱导的 hiPSC-CM 损伤和功能障碍中的作用。使用腺病毒过表达 CircITCH,然后给予阿霉素。明场细胞形态学,CCK8,以及细胞活力测定,显示 CircITCH 过表达可防止阿霉素诱导的细胞活力丧失,乳酸脱氢酶漏出心肌细胞坏死指数和 EthD1 阳性死细胞的数量均被抑制。使用高速视频显微镜检测了 CircITCH 过表达对细胞收缩特性的影响。阿霉素处理的细胞中,收缩 / 松弛速度和变形距离显著降低。


CircITCH 过表达可显著改善收缩特性(收缩速度和变形距离)和松弛特性(松弛速度和变形距离)。钙成像测量显示,阿霉素降低了细胞中的钙振幅并引起舒张期钙超载,CircITCH 的过表达减轻了这些变化。这些结果表明,CircITCH 的过表达可以防止阿霉素引起的细胞损伤和功能障碍。


图片来源:Circulation Research



CircITCH 缓解阿霉素引起的细胞 / 线粒体氧化应激和 DNA 损伤


为了探索与 CircITCH 引起的心脏保护相关的机制,研究者接下来评估了 hiPSC-CMs 的氧化应激和 DNA 损伤水平(阿霉素引起的心脏毒性的两个主要原因)。与以前的报道一致,阿霉素治疗可诱导明显的 DNA 双链断裂(通过 γ-H2AX foci, 8-OHdG 表征)。此外,CircITCH 的过表达减少了线粒体 DNA 损伤(通过 mtDNA lesions 表征),还检测了线粒体和细胞 ROS 的产生。结果表明,阿霉素处理增加线粒体和细胞氧化应激,而 CircITCH 过表达可部分消除这种增加。

图片来源:Circulation Research



CircITCH 通过海绵化 miR-330-5p 防止阿霉素引起的心脏毒性


据报道,CircITCH 在膀胱癌细胞中起 miRNA 海绵(形象说法,像海绵一样吸满了 miRNA,这样它就无法与天然靶点结合,长期抑制 miRNA 基因)的作用。


为了探讨 CircITCH 是否可以在 hiPSC-CM 中使 miRNA 海绵化,研究者选择了 8 个候选 miRNA。进行 CircITCH 探针下拉分析后,提取了 miRNA,并通过 qPCR 检测了候选 miRNA 的水平。下拉沉淀物中,显着富集了包括 miR-330-5p 在内的几种 miRNA。


为了进一步验证 miR-330-5p 和 CircITCH 之间的直接结合,采用了生物素化的 miR-330-5p 探针下拉 CircITCH。生物素偶联的 miR-330-5p 比突变体探针捕获更多的 CircITCH,证明 miR-330-5p 可以与 CircITCH 结合。此外,荧光原位杂交显示 hiPSC-CM 中,CircITCH 和 miR-330-5p 共定位。这些结果进一步验证了,CircITCH 和 miR-330-5p 在 hiPSC-CM 中的直接相互作用。


图片来源:Circulation Research


此外,为了更精确 CircITCH 和 miR-330-5p 的结合位点,突变了预测位点,构建 CircITCH 表达载体。当 CircITCH 在位点 1、2 和 3 发生突变时,生物素 - CircITCH 探针下拉沉淀中的 miR-330-5p 水平显着降低,而其他 5 个位点突变没有显示出这样的减少。这些结果表明,结合位点 1、2 和 3 是 CircITCH 在 hiPSC-CM 中捕获 miR-330-5p 的必要条件。


图片来源:Circulation Research



抑制 MiR-330-5p 可抑制阿霉素的心脏毒性


为了表征 miR-330-5p 在阿霉素引起的心脏毒性中的作用,研究者首先检测了阿霉素处理的 hiPSC-CM 中 miR-330-5p 的水平,其表达显著上调。因此,进行了 miRNA 抑制实验。结果表明,miR-330-5p 抑制作用可改善细胞活力,减少细胞死亡,抑制 LDH 和 cTnI 漏出,改善收缩和松弛速度,提高钙振幅,降低舒张压钙超载,钝化细胞和线粒体 DNA 损伤,抑制细胞和线粒体氧化应激。


图片来源:Circulation Research



SIRT6,BIRC5 和 ATP2A2 是 miR-330-5p 的直接靶点


为了进一步找到 CircITCH 和 miR-330-5p 介导的下游分子,通过比较 miRWal 预测的靶点,锁定了 84 个候选靶点。由于竞争性内源 RNA 机制的一般规律(靶 mRNA 的表达通常与 circRNA 的表达呈正相关,但与 miRNA 的表达呈负相关;在疾病状态下,circRNA 和靶 mRNA 的变化是一致的),据此重合了 CircITCH 上调的靶基因和 miR-330-5p 下调的靶基因。通过这种方式,确定了 3 个可能的靶点,分别是 SIRT6BIRC5ATP2A(SERCA2a)


随后,实验验证这三个可能的靶点。首先,进行了计算靶点扫描分析,确定了每个基因在其 3' UTR 中具有 2 个 miR-330-5p 的预测结合位点。其次,克隆了具有 SIRT6,BIRC5 和 ATP2A2 全长野生型 3'-UTR 区的荧光素酶报告基因质粒。MiR-330-5p 有效降低了 3 个报告基因的荧光素酶活性,表明 SIRT6,BIRC5 和 ATP2A2 3'-UTR 是 miR-330-5p 的直接靶点。


为了进一步确认作用位点,对 3'-UTR 区进行了突变。并通过荧光素酶报告基因进行检测,发现 SIRT6,BIRC5 的结合位点 1,ATP2A2 mRNA 3'-UTR 与 miR-330-5p 结合。

图片来源:Circulation Research



CircITCH 在小鼠上改善阿霉素引起的心脏毒性


为了确定 CircITCH 是否在体内对阿霉素诱导的心脏毒性起作用,研究者采用了 AAV9(腺相关病毒血清型 9)的载体系统,来进行 CircITCH 在体内的过表达。在急性小鼠模型中,CircITCH 的过表达减少了阿霉素引起的心室组织空泡化。此外,有关心肌损伤的心脏酶研究表明,CircITCH 过表达有效降低了阿霉素引起的血清天冬氨酸 AST(转氨酶),LDH 和 CK-MB 的水平。


此外,超声心动图和侵入性血流动力学结果,表明 CircITCH 过表达改善阿霉素诱导的心功能降低。CircITCH 过表达改善了阿霉素诱导的左心室心肌纤维化。CircITCH 组中阿霉素诱导的心脏萎缩也被逆转,心肌细胞明显更大。同样地,在慢性小鼠模型中得到了同样的结果。


图片来源:Circulation Research



创新点及展望


在目前的研究中,发现 CircITCH 可有效缓解体内和体外阿霉素引起的心脏毒性。机制上,CircITCH 作为内源性 miR-330-5p 海绵,可调节 SIRT6,Survivin 和 SERCA2a,CircITCH/miR-330-5p 轴通过 miR-330-5p 和 SIRT6,BIRC5 和 ATP2A2 的 3'-UTR 相互作用,调节氧化应激和 DNA 损伤,细胞死亡,收缩功能障碍和钙调节障碍。


本研究揭示了 CircITCH 在阿霉素引起的心脏毒性进展中的新作用,并确认它是针对阿霉素化疗的潜在治疗剂。因为 CircITCH 表现得更像是一支具有「一箭双雕」功能的「潜力股」,既增强了抑制肿瘤的能力,又同时降低了化疗心脏毒性


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