原理
材料与仪器
完全 MEM-5 和 MEM-10 培养基 PBS 胰酶 低盐缓冲液 蛋白酶K 平衡的苯酚 1:1 苯酚氯仿 TE 缓冲液 乙酸钠 乙醇 HindIII 限制性内切核酸酶和相应缓冲液
12 孔组织培养板
步骤
1. 用生长至汇片的单层 BS-C-1 细胞建立用于病毒感染的细胞培养液(见基本方案 1 步骤 1~5)。
2. 用完全 MEM-10 培养基将 2.5 × 105 细胞/孔放入 12 孔组织培养板培养(每孔终体积为 1 ml),细胞汇片生长(应小于 24 h)。
3. 在使用前,将一定体积的痘苗病毒储液与 0.25 mg/ml 胰酶混合,涡旋混匀。在 37℃ 水浴锅中保温 30 min,并在保温过程中每隔 5~10 min 涡旋混匀一次。
病毒储液的滴度常常在 2 × 109 pfu/ml 左右,但根据其来源的不同病毒滴度也可能低一些。
如果经过涡旋混匀后,还可以看见团状物,将其冷却到 0℃ 并在冰上超声波作用 30 s。可以重复几次超声,但超声的间隔中应当使样品在冰上冷却。
4. 吸出培养基,加入 250 μl MOI 为 10~20 pfu/细胞的完全 MEM-5 培养基,培养 2 h, 每隔 30 min 轻轻摇动培养板,使细胞均匀接触病毒。
5. 加入 1 ml 完全 MEM-5 培养基,培养大约 24 h。
6. 刮下细胞,转移到微量离心管中,最大转速室温离心 30 s,弃培养基。
7. 将沉淀用 50 μl PBS 重悬,涡旋混匀。
8. 在微量离心管中加入 300 μl 低盐缓冲液和 10 μl 的 20 mg/ml 蛋白酶 K,再加入细胞悬液,涡旋混匀, 37℃ 放置 5 h 到过夜。
9. 用等体积苯酚抽提 1 次,再用 1:1 的苯酚/氯仿抽提 1 次。
如果苯酚抽提后,溶液比较黏稠,将其过 25-G 的针头,以剪切 DNA 降低黏稠度。
10. 加入 1/10 体积的 pH 6.0 的 3 mol/L 乙酸钠(终浓度为 0.3 mol/L)和 2.5 倍体积 95% 的乙醇。于冰上放置 30 min 或 -20℃ 放置过夜。
11. 4℃ 以最大转速离心 10 min,弃上清。
12. 用冰浴的 70% 乙醇洗涤,空气中晾干。
13. 用 100 μl pH 7.8 的 TE 缓冲液溶解沉淀。
14. HindIII 限制酶消化 15 μl DNA 溶液,Southern 印迹及杂交分析鉴定。
注意事项
1. 所有培养都在加湿的 37℃ 5% CO2 培养箱中培养,除非有特殊说明。
2. 与活细胞接触的器械和试剂都应该是无菌的,操作也必须是无菌操作。
来源:丁香实验