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材料与仪器

步骤

重 组 Ct 病毒载体的制备

材料

试剂
琼脂糖

Aprotinin (10 mg/ml)

仓鼠幼鼠的肾细胞(B H K -21)

使 用 B H K -21 黏附细胞培养物制备重组 S F V 和 S I N 颗 粒 ,用 B H K -21 悬浮细胞大量制备蛋白质产物。中 国 仓 鼠卵巢细胞(C H O K l ) 和 人 胚 胎 肾 细 胞(H E K 2 9 3 ) 可用于表达研究。

帽 类 似 物(m 7 G [5’] PPP [ 5’ G )

cr 胰凝乳蛋白酶, 20m g / m l

完全 B H K 培养基

将 Dulbecco’s modified F-12 培养基和 Iscove’s modified 培养基 I : 1 混合后,加上 4 m m o l / L

谷 氨 酸 盐 和 1 0 % 胎 牛 血 清(F C S )。

D TT, 50 mmol/L

D M R IE -C (Invitrogen)

乙 醇(7 0 % 和 9 5 % , V / V )

O pti-M E M I 低 血 清 培 养 基

苯 酸 :氯 仿 :异 戊 醇(25 : 24 : 1 , V / V / V )

质粒

p SIN R ep 5 (Invitrogen)

pSIN rep504

S I N 辅 助 载 体 D H -B B

S IN 辅 助 载 体 D H -B B ( 2 6S) 5’ S IN (Invitrogen)

所 有 S I N 和 S IN S 助 载 体 都 需 经 过 酶 切 线 性 化 。

p S F V l ( S 扣 I 线 性 化)

p S F V 2 g e n (JVrwI 线 性 化)

p SFV -h elp er2 载体

p SF V -h elp erS2

p S F V -h e lp e rC S 2 19 A

将所有 S F V 载 体 用 I 线性化。

P B S

限 制 性 内 切 核 酸 酶 : JVoZ I 、 JV ra I 、 _Pac I 、 S a p I 、 S f e I 、 _X7io I

R N A 酶 抑 制 物(1 0 〜 5 0 U /ul )

r N T P 混 合 物

10 m m o l/L rA T P

10 m m o l/L rC T P

10 m m o l/L rU T P

5m m o l/L rG T P

IO X S P 6 缓 冲 液

400m m ol/L H E P E S (p H 7. 4)

6 0 m m o l/L 乙酸镁

2 0 m m o l/L 亚 精 胺

1 5 X S P 6 缓 冲 液

SP6 R N A 聚 合 酶(1 0 〜 20U/uD

胰 酶 -E D T A

〇 . 2 5 % 胰 酶

lm m o l/L E D T A

无 R N A 酶水

仪器

细 胞 培 养 板(6 孔 、 1 2 孔 和 2 4 孔)

电 穿 孔 管(〇 • 2 c m 和 0. 4 cm )

电 穿 孔 仪(B ioR ad G ene P u lser)
设 置 如 表 2 , 如果使用其他的电穿孔仪,请咨询相关厂商。 Falcon 管 (15c m 和 50 m l ) 滤 器 (无 菌 , 〇.22M m ,微 孔 ) 凝胶电泳仪 加热器 孵 箱 , 3 7 。。, 5 % C O 2 微离心机 微离心管 注 射 器 (无 菌 , l m l 、 I O m l 和 50m l ) 组 织 培 养 瓶 (T 2 5 、 T 7 5 和 T 175) 水池 表 2. BioRad Gene Pulser电穿孔仪设置 0. 2 c m 电 穿 孔 管 0 . 4 c m 电 穿 孔 管 电 容 放 大 器 960, 960/nF 电 压 1500V 850V 电 容 器 25mF 2 5 ^ F 电 阻 (电 流 控 制 器 ) aO, 阻 断 的 预 期 的 持 续 时 间 0. 8s 0. 4s 方法 D N A 线性化 1•至少需要线性化5〜IOfXg质粒DNA (更大量的可以保存于—20。 〇 。 2 . 用 苯 酚 :氯 仿 提 取 物 纯 化 线 性 化 的 DNA,然 后 乙 醇 一 20°C 沉 淀 过 夜 或 一 80。。 , 15min〇 3. 4°C, 18 OOOg离心乙醇沉淀物15min。 4 . 用 70%乙醇洗涤,重复离心5min。 5. 空气中晾干或冻干DNA沉淀。 6•重悬沉淀物于无RNA酶水中,使终浓度为0. 5(^/4。 用琼脂糖凝胶电泳确认是否完全消化。 体外转录 对于获得高滴度的病毒产物,体外转录过程是非常重要的。建议将新鲜制备的 R N A 样品用于电穿孔,尽 管 R N A 转录本可在一80°C保存数周。在这些情况下,每个 转录反应可以制备20〜50M g 的 R N A 。如果需要大量的病毒,通过放大如下步骤中的反 应体积可以获得大量的病毒。 7 . 室温下在1.5m l 离心管中为表达和辅助载体准备单独的反应混合物(表 3),最后
加酶。 表 3. SFV和 SIN体外转录反应混合物 SFV/^1 S l W i A 线 性 化 质 粒 (2. 5/ig) 5 5 1 0 X S P 6 缓 冲 液 5 一 1 5 X S P 6 缓 冲 液 — 10 10mm o l / L 帽 类 似 物 5 5 50mmol/L D T T 5 5 r N T P 混 合 物 5 5 无 R N A 酶 水 20 15 R N A 酶 抑 制 剂 1.5 1.5 SP6 R N A 聚 合 酶 3.5 3.5 8 . 混合所有的反应组分,并稍微离心一下。 9. 37°C 孵育 Ih (S F V ) 或 40°C 孵育 Ih (S I N )。 10•取1〜4jul样 品 0 •8 % 琼脂糖凝胶电泳进行R N A 分析。 高 质 量 的 R N A 可以产生相对厚的带而不会弥散。单 链 R N A 的大小不能直接于D N A 分子 质量标准相比,因 为 单 链 R N A 迁 移 比 D N A 快 4 倍 。然 而 ,表 达 载 体 产 生 的 R N A 大约 8kb (根据插人片段的大小而略有不同),辅 助 R N A 迁移得更快。 11. 立即转染高质量的R N A 或保存于_80°C 。 R N A 转染 12. 通过电穿孔或者脂质体介导的转染将新鲜制备的或刚刚融化的R N A 转染进细胞。 如果使用刚刚融化的RNA, 使用前通过凝胶电泳来重新鉴定RNA的质量。 R N A 的电穿孔转染 一般说来, BHK-21细胞比较适合用于电穿孔。细胞不得传代超过3 个月,因为传 代超过3 个月的细胞将逐渐丧失活力。电穿孔前,细胞种板不得超过48h ,并且其 汇合度不得超过8 0 % 。 a. 将足量的B H K -21细胞种至T 175细 胞 瓶 (1 : 3 过夜或1 : 5 隔两夜) 。 转染前注意细胞的生长和形态。 b. 用 P B S 洗涤细胞一次,每 个 T 175细胞培养瓶加入6m l 胰酶-E D T A , 37°C 孵 育 5m i n 。 c. 重悬细胞使细胞聚集块破开。加人细胞培养基至2‘5m l , 800g 离 心 5m i n 。 d•用少量的P B S 重悬细胞沉淀(少 于 5m l) 。 加 P B S 至 25m l 并 800g 离 心 5m i n 。 e•每个T 1 7 5 细胞培养瓶用2.5m l P B S 重悬细胞沉淀(相当于 I X I O 7〜2 X IO 7 个 细胞/m l )。 将细胞立即使用于电穿孔,可以短暂的将细胞置于冰上保存(短 于 IW 。 f•将细胞悬浮物转移至电穿孔管(0.2c m 管中可放〇.4m l, 0.4c m 管则可放0.8ml)。 g. 将 20〜 45^x1重组D N A 和 2 ( ^ 1辅助 R N A (按如上步骤7〜 1 1 制备)加人细胞悬
浮 物 中 。 h. 将电穿孔管放在电穿孔仪架上,然后设置两个电极。 i. 用细胞培养基25倍稀释细胞。将细胞转移至细胞培养瓶或板内。 j. 在 含 5 % C O 2 的孵箱中将细胞37°C孵育过夜。 当使用温度敏感型突变a 病毒载体时,将孵育温度降至30C 或 33。 (:。 k. 按如下步骤13〜16收集重组病毒颗粒。 脂质体介导的R N A 转染 作为电穿孔的替代方法, R N A 可以通过脂质体试剂来转染细胞。 a. 用 2m l 培养基将I.5X I O 5〜3X I O 5 个 B H K -21细胞种至35m m 盘或6 孔细胞板。 培养细胞至汇合度8 0 % 左右。 b•用 2m l O p t i - M E M I Reduc e d - S e r u m 培养基清洗细胞。 c. 在母个I.5m l 离屯、管 (一'共6 个),加 入 I m l 室温的O p t i - M E M I R e d u c e d - S e r u m 培养基。 d. 在 6 个 1.5m l 离心管中依次加入0、 3、 6、 9、 12或 15m 1 D M R I E -C ,轻轻的振 荡一下。 . e. 在一个单独的管子中,将 60W (约30埤 )体外转录的重组R N A 和 30^x1 (约 12.5^^)辅 助 R N A 混合。 f. 在 6 个含有转染混合物的离心管中分别加人1 5 4 R N A 混合物,轻轻的振荡 一下。 g. 将脂质体-R N A 混合物迅速加入洗涤过的细胞中, 37°C 孵 育 4h 。 h•用预热(37°C ) 的完全B H K 培养基替换转染培养基。 i•在含5 % C O 2 的孵箱中将细胞37°C 孵育过夜。 j. 按如下步骤13〜16收集重组病毒颗粒。 重 组 病 毒 颗 粒 的 收 集 在转染后的头24h 内细胞可以高效的制备重组〇(病毒颗粒。通常情况下,可以获得 的滴度的范围是每毫升有IO8〜IO9 个感染颗粒。将孵育时间延长至48h通常可以梗滴 度稍微提高。 13. 在显微镜下观察可产生病毒的细胞,观察是否有污染物和细胞病变效应。 14. 小心的吸弃B H K -21细胞的培养基。 15. 用 0. 22fxm灭菌过滤器除去细胞碎片和污染物。 16•将病毒保存于一20°C (数周)或一80°C (数年)。 液体病毒储存物需要防止反复多次冻融,冻融将显著的降低病毒的滴度。 重 组 颗 粒 的 激 活 用传统的D F V 和 S I N 辅助载体及分裂辅助系统制备的病毒可以直接产生感染颗 粒。然而, p S F V -Helper2 载体使产生的S F V 颗粒仅仅在某些条件下才具备感染性。在 这种情况下,需要如下的激活步骤。 一 17.在病毒储存液中加入cr胰凝乳蛋白酶至终浓度为5 ( % g/m l 。室温下孵育2〇min。

18•加人 aprotinin 至终浓度为 250 ug/ml以终止反应。
激活的 S F V 颗粒可用于感染

来源:丁香实验

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